这个国自然热点数据库值得每个科研人收藏
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M6ADD数据库
m6A作为近年来涌现出的研究热点，已然成为国自然基金申报的香饽饽，相关研究论文也是如井喷之势。为了给大家打call，我们也推送了一系列文章，如介绍什么是m6A的《CNS热点、国自然热门，m6A的前世今生》，介绍m6A数据库的《这个研究热点的重磅数据库！错过真要悔一生》，解读高分m6A论文的《蹭国自然热点，发15分文章》，方便好用的网页版工具《这两个工具的路子有多野？有人靠它蹭热点发文章、拿国自然》还有超高分的长文综述《两个月内频登高分期刊，此热点凭什么如此受追捧》。
4月27日，哈尔滨工业大学生命科学与技术学院的张岩教授在 RNA Biology（IF = 5.351）杂志上发表了疾病中m6A修饰的综合数据库——M6ADD数据库。该数据库从2000多篇已发表论文中发现、过滤筛选出了涉及59种疾病，包含有222个经实验证实的m6A疾病关联。另外，运用计算和统计方法还从30个高通量测序数据集中获得了409229个m6A疾病关联。
该数据库的网址为http://m6add.edbc.org/
下面本工给大家介绍一下M6ADD数据库的功能和使用
进入主页后，网页如下所示，主要包括 “Browse”、 “Search”、 “Download”、 “m6A-Net”和“m6A-Regulator”5个功能模块。下面本工一一为大家介绍下。
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Browse模块
在这个模块，M6ADD有两个主选项，“Experiment”为网站作者人工收集的数据，“Sequencing”为网站作者利用测序数据集计算和统计所获得的数据。点击“+”按钮即可弹出下面的内容。
“Experiment”部分有“gene”、“disease”和“protein”3个部分，点击后跳出的内容分别为所研究有m6A修饰的基因、研究的疾病和m6A的WER蛋白（即Writer、Eraser和Reader三种m6A调节蛋白）。“Regulatory”这列所展示的内容为m6A修饰对该基因的影响和作用，“Differential expressionTCGA”这列表示该gene在TCGA中是否有差异表达。
点击蓝色的“detail”后，可跳转到如下页面，展示的内容除了上面表格中的外，还有研究方法、物种、器官，以及该研究论文PMID、tittle和论文中对这一结果的描述。
在“Sequencing”部分，展示的结果如下所示，大家点击左上方的按钮可以下载结果，点击右边蓝色的“UCSC”则会跳转到UCSC Genome Browser界面展示相关数据情况。
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Search模块
在这个模块，网站为我们提供两种搜索方向。
一种是搜索实验验证的data。大家只需勾选或输入物种、器官、疾病、WER蛋白和基因信息，即可搜索，不填则表示该选项为任意。
另一种则是搜索高通量数据结果。RADAR和MetDiff是MeRIP-seq数据的两种不同的差异分析方法。Integration则是对两种方法的结果取交集。
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Download模块
M6ADD允许用户以文章为单位，点击蓝色箭头可下载该研究的数据结果，包括实验验证的结果和高通量数据结果。
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m6A-Net 模块
在这个模块，用户只需输入在自己研究中有差异m6A修饰的基因，M6ADD即可根据数据库中的数据来构建PPI网络，并有多种格式的图片供用户下载。下方还有3个按钮，点击即可自动将PPI网络中的所有基因导入到DAVID中进行富集分析。
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m6A-Regulator模块
在这个模块，用户可以选择癌症类型和已知的m6A调节蛋白来获得M6ADD提供的潜在的癌症m6A调节蛋白，这其中基本都是reader。
关于数据库的介绍就到了，m6A作为这几年的研究热点，相比大家都希望有个好工具来帮助大家搬砖，所谓工欲善其事必先利其器，希望各位民工们能够利用好数据库和之前推送的文章，祝实验顺利，发好文章！
学医前和学医后