尬聊系列之一---生信编程初学
出发点
大半年了，我没事就会在课题组内发一些脚本需求，希望通过这些需求来驱动课题组内成员的编程学习与提升，争取尽快能找到一个可以替代我的人。稍有进展，但仍不太快。转念一想，是否组内真的需要有能替代我的？故有此文。
学习生物信息到底要不要学编程
生物信息专业的朋友便无需考虑这个问题，毕竟是本行。而对于其他生物相关专业的朋友，事实上，不会有太少是不得不，更或者随大流地进去生信学习大军。到底需不需要学编程。我个人觉得，这一块的朋友在科研成果上，往往是干湿结合；那么如果侧重的是分析，则可能真的不得不学一些非常基础的；而如果侧重的是实验，则正好相反，需要做的可能是了解清楚并使用已有的工具，有必要的情况寻求科研或者商业合作。毕竟，每个人发挥擅长的，或许才是最有成效
编程要学到咋样？
目前市面上，各种生信N个任务，或者生信M个题目…我个人其实不感兴趣，毕竟我似乎没有认识的某某是通过刷这些题目而写一首好脚本的。相对而言，我觉得所谓的生信编程题目，最适合的并不是作为训练，而是作为测验，亦即，如果你会，那么你行；如果你不会，那么你需要更多的学习，而不是来刷题。
这似乎跟某些技能的日常应用和考试是一个逻辑。类比一下，你的六级考试666，然而你却说不好英语。
我个人觉得编程学习的逻辑应该是，了解一门语言，如果是第一门语言，应该是看经典的入门书（或者适合自己的入门书），刷书里面的题，随后再做一些带有自身需求的生信编程项目。这个说法似乎跟前述的生信N个任务或者M个题目有所矛盾。
其实没有。一本经典的编程入门书，往往是一版再版。后面的题之所以设置，事实上是带有训练意义，也往往是书本作者教学经验的归纳。相比之下，目前可见的生信N任务与N题，自然是有适合生信入门的朋友所需要的。但是否是合适的编程规范和思维形成，则并不说。
这也可以让我们看到存在部分公众号，为了某种商业化目的，其实本身初学并指示掌握了软件的使用，即推出各种绘图教程，如经典案例，某某用了Y叔的clusterprofiler，除了一个其实诡异的富集气泡图。对于真正要学习的人，到底是好是坏，更不谈各类培训班。有时候，我想想，到底是谁给你的自信？
看完书之后，要做些自身存在需求的或者课题组有需求的项目，而不是刷别人的题。我本身是做非模式生物较多的，所以并不是别人给的题目就适合自己的需要，更或者回事我们最终需要掌握。
编程的学习也需要一个正反馈过程
做自身有实际需求的项目 与 所谓刷题 ，所最大区别，事实上即是 完成之后的正反馈。
此点才是促进个人进步的最大动力。
想想为什么有些人会继续写博客，有些人会持续不断的开发新的工具，有些人会热衷论坛与公众号的运营，
一方面是兴趣（这点是扯淡的），更重要的是另一方面，存在一些持续的正反馈
那么我的想法
所以生物背景的朋友学习编程，我觉得需要确定的可能有：
到底需不需要学习
到底要学习到什么程度
找到兴趣或者放弃
看书，完成一些有趣的项目
完成一些自己有需求的项目（当然可以参考从一些生信M题），但最重要的还是从课题组出发
最后，还是自我定位 ==》 我与课题组的师妹聊过之后发现，她的定位很清晰，以后开展科研是要像现在课题组PI一样，那么其实，我给她在编程上的建议，大部分其实并不需要或者不合适的。
生信学习，其实真的不要相信任何人，应该相信自己，审视所有人的建议，包括这篇推。
再声明
本推文出发点就是……个人觉得有趣
本推文已尽可能地保证零基础的朋友能在windows下完全重现，但不保证每个人都能重现。毕竟我没有义务。所以最好不要针对本文的步骤向我提问（星球的朋友除外），近期赶课题，木有时间。
（另，个人时间和精力有限，大群可以学习交流，但我不一定会回复（也没有义务），直接私信我讨论交流的朋友，请先微信转账或附图支付宝转账-）。
参与讨论交流