实验为主，TCGA数据挖掘为辅的6分+发文方法

今天介绍一种实验为主，TCGA数据挖掘为辅的6分+发文方法。这篇文章发表在Cell Death & Disease上，影响因子：6.3，中科院最新分区：二区，属于OA期刊，需要收取版面费，不在中科院发布的国际预警期刊名单上。

文章题目：GBP5 drives malignancy of glioblastoma via the Src/ERK1/2/MMP3 pathway

分析内容：

1、首先收集相关GBM临床样本，通过WB发现GBP5在GBM组织中表达上调，并且根据肿瘤等级分析，发现GBP5的表达与肿瘤等级具有相关性；在GBM细胞系中检测GBP5的蛋白表达水平，同样得到GBP5的表达也是上调的，通过TCGA数据挖掘分析得到上述的表达验证，并且发现GBP5表达越高，预后就越差。

2、通过功能得失实验，发现GBP5促进GBM细胞的增殖、迁移、侵袭。

3、通过探索GBP5促进GBM细胞增殖、侵袭的分子作用机制，作者通过RT-PCR筛选了各种与转移相关的基因，发现MMP3的表达最为显著，并且通过WB和siRNA转染发现MMP3对GBP5促进GBM细胞增殖、侵袭发挥重要的作用。

4、寻找对于GBP5 / MMP3促进GBM细胞增殖和侵袭至关重要的信号通路，通过查阅文献，Src和ERK参与了hepatoma 和osteoarthritis中MMP3的表达，作者通过相关分析发现Src / ERK1 / 2轴参与了GBP5 / MMP3促进的GBM细胞增殖和侵袭。

5、在小鼠体内实验证实了GBP5表达促进GBM细胞的生长和侵袭。

总结：

文章总体论证思路比较简单清晰，最难的就是如何找到这样一个GBP5并且要保证实验结果都是阳性的，如果实验结果是阴性的就相当于白做了。当然还要有相关科研经费资助，例如国自然基金或其他经费等等，没有相关经费再好idea也只能晾在一边。