Frontiers in Microbiology | 感染赤腐病的条斑紫菜及其周围海水相关的细菌群落组成均发生变化
推荐：江舜尧
编译：晚香
编辑：十九
黄海水产研究所兼上海海洋大学莫照兰研究员等人于2019年7月4日在Frontiers in Microbiology期刊发表题目为《Compositional Shifts of Bacterial Communities Associated with Pyropia yezoensis and Surrounding Seawater Co-occurring with Red Rot Disease》的文章，该文章为研究赤腐病相关的细菌群落的改变以及与赤腐病同在的周围海水情况的变化提供了研究视角，并发现细菌群落的变化情况与藻类寄主健康状况密切相关，突出了群落分化可作为预测疾病发生的潜在指标。
文章摘要
条斑紫菜是中国市场上最重要的食用红藻，赤腐病是制约条斑紫菜栽培的主要因素之一。据报道，导致赤腐病的病原菌属于卵菌纲腐霉属微生物；然而，这种病害与附生和浮游细菌群落之间的相互作用鲜有报道。本研究采用16S核糖体RNA（rRNA）基因测序技术，结合多种环境因素的评估，对养殖农场采集的未感染、局部感染和严重感染的藻类群体以及临近海水中的菌群进行了深入研究。尽管藻类菌体和海水中的菌群alpha多样性相似，但是未受感染和受感染的群落之间存在显著差异。与条斑紫菜相关的附生细菌群落的系统发育差异主要体现在黄杆菌属、硫杆菌属和红杆菌属等的优势菌群操作分类学单元（OTUs）的相对变化。海水中普遍存在的OTUs在群落间的相对丰度也有所不同，并隶属于不同的分类单元，包括放线菌门、疣微菌门和拟杆菌门，以及α-和γ-变形菌门。与条斑紫菜和海水相关的细菌群落的分化分别由活性硅酸盐和盐浓度主要发挥决定作用。特别地是，14项潜在指标（2个条斑紫菜的OTUs和12个海水OTUs）与环境变化有相关性，并与条斑紫菜的健康状况有显著差异。总的来说，本研究为研究赤腐病相关的细菌群落的改变以及与赤腐病同在的周围海水情况的变化提供了研究视角。本研究观察到的变化情况与藻类寄主健康状况密切相关，强调了群落分化可以作为预测疾病发生的一个潜在指标。
文中重要图片说明
图1 | 三个养殖区域中不同健康状况的条斑紫菜的比较（A）和感染腐霉病菌Pythium chondricola的放大图（B）和（C）
图2 | 不同健康状况下的条斑紫菜（A）和海水（B）细菌群落多样性指数的比较
图3 | 非度量多维尺度（NMDS）图说明各个数据集之间的关系
图4 | 在门/纲水平上与条斑紫菜和海水有关的细菌群落结构
图5 | 筛选与健康状况相关的细菌OTUs并比较三组细菌的相对丰度
图6 | 细菌群落和环境参数的冗余分析（RDA）双标图
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