NATURE子刊 | 自身免疫的遗传风险与人类肠道微生物群的明显变化相关
推荐：江舜尧
编译：Frank
编辑：十九
文章摘要
许多人类自身免疫疾病的易感染性严重受到II型人白细胞抗原（HLA）等位基因组合的遗传控制。迄今为止，这些基因仍然是1型糖尿病和乳糜泻发病的最大风险因素。虽然HLA是环境对疾病的潜在影响源，但是HLA对人体肠道微生物组成的影响人们仍然知之甚少。本研究使用瑞典东南部所有婴儿的队列研究数据，发现1型糖尿病自身免疫的遗传风险与肠道微生物组显著变化相关。核心微生物组和β多样性均与HLA风险组和基因多态性不同。此外，保护性HLA单倍体基因型与Intestinibacter菌属和Romboutsia菌属具有相关性。因此，普通人群队列研究法在确定自身免疫疾病的潜在环境诱因或保护因子方面具有一定价值，即使这些环境诱因或保护因子可能被强遗传控制所掩盖。
文章中重要图片说明
图1 | 遗传风险组之间的微生物α多样性没有显着差异。a/b：基于每个样品的独特扩增子测序变异位点（a）和香农多样性指数（b）的稀疏曲线。c：遗传风险组和α多样性组的小提琴图和成对统计比较。
图2 | 特定分类群与遗传风险相关。a：通过LEfSe分析发现的整个数据集的生物标志。b-d：LEfSe分析出与风险组相关的特异物种具有较高的平均相对丰度。
图3 | 根据45％患病率绘制的受试者间距离PCoA图。
图 4 | 在一个或多个风险组至少45％的受试者中存在的类群的层次结构组织图。
图 5 | LEfSe按地理区域识别ASV的来源。线性判别分析效应大小（LEfSe）能够将分类群识别为与三个地理区域中的遗传风险组相关的生物标记。
图 6 | 三个地理群集中每个群体的 PCoA图。
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