Nature子刊 | 用于组织原位分析的高分辨率空间转录组学

编译:不二,编辑:十九、江舜尧。

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美国麻省理工大学与哈佛大学博德研究所和瑞典皇家理工学院基因技术研究所Sanja Vickovic和Joakim Lundeberg等人于2019年9月9日在顶级期刊Nature Methods发表题目为《High-definition spatial transcriptomics for in situ tissue profiling》的文章,该方法为研究健康和疾病中组织结构和功能提供了更高分辨率的技术手段。
文章摘要 
空间分子特性决定组织器官的功能,但如今缺乏同时捕获两者特性的高分辨率方法。研究者开发了高分辨率空间转录组学的方法,可以从含有密集空间条形码磁珠的组织学切片上捕获RNA。每个实验都以2μm的分辨率捕获了数十万个偶联空间条形码的转录本,并在小鼠脑癌和原发性乳腺癌中进行了验证。这为细胞和组织的高分辨率空间分析开辟了新道路。

文中重要图片说明

图1 | 高清空间转录组学(HDST)。

图2 | HDST可以区分乳腺癌切除术中的细胞类型和空间位置。


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