科研模式中蛋白分子绘制方法

张老湿:发完这篇教程,科研示意图从分子到细胞以及实验耗材都有了相应的方法,应该比较全面了,所有教程用的软件都是PPT,但是思路可以借鉴到AI等矢量绘图软件。

蛋白质分子在生命科学模式示意图中几乎是必备的一类图形,很多时候我们直接采用简单的几何图形即可进行各种示意,但是如果蛋白质分子种类比较多,或者想要表现得更加高级一点,则需要进行一些变通。

本教程集中讲述常见蛋白质分子的示意图,受写作时思路所限,举例未必全面,但是方法是相通的,读者可以自行举一反三。

常见的方法有三类:一是直接使用规则图形替代蛋白质分子,但是规则图形无非圆形(球形)、椭圆、矩形、圆角矩形、多边形,三角形和梯形之类的图形则基本不会用到;二是在上述规则图形上面进行顶点编辑,使得可用图形进一步丰富。

第三类方法是通过布尔运算,利用简单规则图形产生大量新的图形,这是较为高级也较为常用的方法,我们往往使用两个形状联合或剪除(有时候还用到拆分)产生新图形。

事实上,用来进行布尔运算的图形超过三个,可以产生更多意想不到的效果!比如下图我们不拘泥于两个图形的布尔运算,并配合顶点编辑和颜色填充,产生了更丰富的示意图形!可以说只有我们想不到,没有画不出的示意图。

这种布尔运算产生新图形的过程也可以用于细胞器的绘制,比如下图这种袋状物可以定义为蛋白酶体或者溶酶体。

具体到某类蛋白而言,我画过相对特殊的有两类,一是免疫球蛋白,二是跨膜蛋白,在这里也大概说一说。

对于免疫球蛋白,我画过的有以下三种方式,比较简单,无非是形状拼合,最多剪除出来之后再拼合。

跨膜蛋白也比较常见,一般用一条波浪曲线来表示,不过PPT并不直接提供波浪曲线插入,可以采用弧线+直线的方式绘制波浪曲线;如果需要有一定宽度并且描边,则可以采用剪除出来的半环形+矩形拼接形成波浪线,这点PPT不如AI方便,AI直接有波浪效果,还可以进行形状扩展。

也可以采用圆柱体+条带的方式来表示:圆柱体在PPT里面有现成的图形,并不需要椭圆+矩形的方式拼接,连接所用的曲线带可以用剪除环形的方式来获得,两端的曲线则由矩形变形而来。

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