利用TCGA发3分SCI就是这么简单

利用TCGA发SCI的套路有很多很多，这里介绍发3分的SCI。现在要介绍的这篇文章发表在Cancer Medicine，关于这个期刊的信息可以参考~生信数据挖掘不会选期刊？点我

这个套路主要是下载TCGA临床数据和mRNA数据，进行差异分析，对差异基因做GO、KEGG富集分析，PPI分析，这里跟GEO数据挖掘的套路是一样的，不同的是，这里有生存数据以及其它临床数据，然后就可以构建cox回归模型，同时也对临床数据构建了cox模型。

文章题目：Candidate genes involved in metastasis of colon cancer identified by integrated analysis

摘要：

结肠癌是世界上最恶性的癌症之一。 所有结肠癌患者中近20％在IV期（转移）被诊断出来。 然而，由于对其发病机理缺乏了解，对结肠癌的进一步研究是困难的。 在本研究中，我们从TCGA数据集中获取并进行了高通量序列数据综合生物信息学分析，包括差异基因表达分析，基因本体和KEGG途径分析，蛋白质 - 蛋白质分析，生存分析和多变量Cox比例风险回归分析，以确定一组参与结肠癌转移的关键候选基因。 然后基于REG1B，TGM6，NTF4，PNMA5和HOXC13的表达构建预后信号，这可以提供显着的预后结肠癌的价值。