重复一篇6.2分的生信文章(1)
最近看到一篇6.2分的生信文章,看起来挺简单的。所以带着大家重复一下文章中的图,也顺便学习一下各种工具的使用。
文章名:A pan-cancer analysis of the oncogenic role of staphylococcalnuclease domain-containing protein 1 (SND1) in human tumors
后台回复SND1可获取全文
本文的Figure 1是介绍SND1这个基因的表达情况
Figure 1a
通过TIMER2数据库,展示SND1在TCGA数据库中的表达。
TIMER2数据库的网址是:http://timer.cistrome.org/
打开后点击箭头所指位置
输入SND1
点击下载pdf就可以得到Figure 1a了
Figure 1b
对于TCGA数据库中没有正常组织的肿瘤类型,使用TCGA与GTEx数据库联合进行分析,该图是使用在线数据库GEPIA2所作
GEPIA2:http://gepia2.cancer-pku.cn/#index
打开网址点击箭头的位置
点击Box plot
按照箭头选择好
出图
大家可以一个一个选,就可以得到作者的图了。
突然间有事,今天就这么多吧,下会继续。
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