王军军等最新Microbiome：绿茶多酚或能调肠菌治肠炎
王军军团队：绿茶多酚或能调肠菌治肠炎
Microbiome——[14.65]
① DSS诱导的结肠炎小鼠模型中，绿茶多酚EGCG（表没食子儿茶素没食子酸酯）的口服给药能减轻结肠炎症、肠粘膜氧化应激和屏障功能障碍，而结肠给药无此效果；② 这些保护性作用与EGCG改变肠道菌群的组成和功能有关，包括增加阿克曼菌属等丰度、促进丁酸等短链脂肪酸的生成；③ 在诱导结肠炎前预防性口服EGCG，也能改变小鼠肠道菌群，减轻DSS诱导的结肠炎；④ 粪菌移植实验证明，EGCG的有益作用是由肠道菌群介导的。
【主编评语】
膳食多酚是存在于很多植物基食物（如红酒、巧克力、绿茶）中的一类微量营养素，对机体健康有多种益处。绿茶多酚EGCG（表没食子儿茶素没食子酸酯）具有抗炎活性，可能有助于改善炎症性肠病（IBD），但目前尚不清楚肠道菌群在其中扮演什么角色。Microbiome最新发表了来自中国农业大学王军军团队的研究成果，揭示了肠道菌群在EGCG抗肠炎功效中的重要作用，也为食疗改善IBD等消化道疾病提供了新见解。（@mildbreeze）
【原文信息】
Gut microbiota from green tea polyphenol-dosed mice improves intestinal epithelial homeostasis and ameliorates experimental colitis
2021-09-07, doi: 10.1186/s40168-021-01115-9
国内团队：TMAO如何加重高血压？
Redox Biology——[11.799]
① 高血压患者血浆TMAO水平与血压正相关；② 在Ang II诱导的高血压小鼠中，TMAO升高收缩压并引起血管收缩，抗生素治疗可减少TMAO生成、改善Ang II诱导的高血压；③ TMAO处理后，Ang II诱导入球小动脉及血管平滑肌细胞（VSMC）内Ca2+的释放增加；④ TMAO预处理VSMC可激活PERK/ROS/CaMKII/PLCβ3通路，PERK、ROS、CaMKII和PLCβ3抑制剂可削弱TMAO对Ca2+释放的影响；⑤ 因此，TMAO通过激活PERK/ROS/CaMKII/PLCβ3/Ca2+途径，加重Ang II诱导的高血压。
【主编评语】
肠道菌群代谢衍生物氧化三甲胺（TMAO）与慢性肾脏疾病、糖尿病、肥胖和动脉粥样硬化等多种慢性疾病有关。中山大学附属第七医院郑智华、浙江大学医学院第二附属医院魏启春、浙江大学赖蒽茵与团队近期在Redox Biology发表研究，报告了TMAO可加重由血管紧张素II（Ang II）诱导的高血压，并揭示了背后的通路机制。这些发现为高血压的发病机制带来了新启示，提示TMAO或是高血压的潜在的治疗靶点和生物标志物。（@mildbreeze）
【原文信息】
Gut microbiota dependent trimethylamine N-oxide aggravates angiotensin II-induced hypertension
2021-08-25, doi: 10.1016/j.redox.2021.102115
老年性黄斑变性患者的肠道菌群变化及其与补体系统的关联
npj Genomic Medicine——[8.617]
① 纳入57名新生血管性AMD患者及58名健康对照；② 患者的肠道菌群中Negativicutes菌纲富集，Oscillibacter菌属及拟杆菌属在健康对照的肠道菌群中丰度更高；③ 在野生型小鼠及C3缺陷小鼠中，可观察到相似的肠道菌群组成差异；④ 补体因子B基因的SNP在健康对照中丰度更高，HTRA1基因及补体因子H基因的SNP在患者中丰度更高；⑤ Negativicutes菌纲可作为区分AMD与健康对照的潜在生物标志物，且与补体因子H基因的CFH3基因型（rs1061170）呈正相关。
【主编评语】
npj Genomic Medicine上发表的一项最新研究，对比鉴定了新生血管性年龄相关性黄斑变性（AMD）患者与健康对照的肠道菌群组成差异，并发现特定分类群在可区分患者与健康对照的同时，还与患者的补体因子H的基因型相关。（@沈志勋）
【原文信息】
Associations of the intestinal microbiome with the complement system in neovascular age-related macular degeneration
2021-09-01, doi: 10.1038/s41525-020-00141-0
一种降解人肠道粘蛋白的新细菌
Gut Microbes——[10.245]
① 体外培养表明，Allobaculum mucolyticum可利用饮食中的聚糖和宿主聚糖（粘蛋白O-聚糖）进行生长；② 从其基因组中鉴定出60种潜在的碳水化合物活性酶（CAZymes），在培养物及细菌裂解液中用质谱鉴定出49种，包括18种靶向粘蛋白O-聚糖的分泌型CAZymes；③ 功能活性实验表明这些CAZymes能水解多种单糖间共价键；④ A. mucolyticum通过分泌大量粘蛋白降解酶来有效降解粘蛋白O-聚糖，进一步利用释放的半乳糖、GlcNAc和GalNAc进行生长。
【主编评语】
对于许多与人类疾病有关的细菌物种来说，内层黏液层是一个重要的生态位。Allobaculum mucolyticum是丹毒丝菌科的一种细菌，可能与肠上皮有密切互作，且与炎症性肠病（IBD）相关。Gut Microbes近期发表的一项研究表明，这种细菌可降解肠上皮黏液层中的粘蛋白O-聚糖，可能是其促进IBD的潜在机制。（@mildbreeze）
【原文信息】
Identification of Allobaculum mucolyticum as a novel human intestinal mucin degrader
2021-08-30, doi: 10.1080/19490976.2021.1966278
江南大学：植物乳杆菌CCFM8661可减少苯丙芘诱导的毒性
Frontiers in Immunology——[7.561]
① 通过苯丙芘结合实验筛选出结合能力最强的植物乳杆菌CCFM8661，在体内实验中口服CCFM8661也可降低苯丙芘处理后上升的粪便内苯丙芘浓度；② 旷场实验表明苯丙芘可诱导小鼠焦虑样行为，口服CCFM8661则可改善症状；③ CCFM8661可降低脑内氧化应激水平（丙二醛MDA）和肿瘤相关基因表达（Bcl-2、p53），改善苯丙芘诱导的结肠中紧密连接蛋白和CYP1A1表达下降；④ CCFM8661可显著改善苯丙芘诱导的结肠损伤、恢复肠道菌群多样性及结构和SCFAs产生。
【主编评语】
江南大学的田丰伟在Frontiers in Immunology发表文章，发现苯丙芘结合能力强的益生菌CCFM8661通过调控肠道菌群，缓解苯丙芘诱导的急性毒性，表明补充CCFM8661是对抗苯丙芘诱导毒性的一种有效且简单的膳食干预措施。（@爱的抉择）
【原文信息】
The Protection of CCFM8661 Against Benzopyrene-Induced Toxicity Regulation of the Gut Microbiota
2021-08-10, doi: 10.3389/fimmu.2021.736129
益生菌BB-12可帮助恢复人肠道菌群稳态
Nutrients——[5.717]
① 受试者首先进行阿莫西林/克拉维酸盐给药（第1-7天），同时给予BB-12或对照酸奶（第1-14天），共招募62名参与者，并在第0、7、14、21和30天检测粪便的短链脂肪酸水平和菌群组成；② 抗生素治疗抑制两组的粪便醋酸盐水平，停用后，益生菌组逐渐恢复至基线水平，而对照组仍受到抑制；③ 第7天，抗生素治疗降低两组的肠道菌群多样性，而对照组的变化幅度比益生菌组更大、更持久，这与BB-12促进菌群恢复的假设一致；④ 两组的基线没有显著差异。
【主编评语】
广谱抗生素的使用通常与抗生素相关性腹泻（AAD）有关，并影响胃肠道的稳态，导致肠道菌群数量和多样性的总体减少，以及短链脂肪酸（SCFA）的产生减少。Nutrients近期发表的文章，发现健康受试者同时服用抗生素和BB-12酸奶，相比于对照组，随着时间的推移，粪便SCFA水平的下降幅度明显更小，菌群的分类特征更稳定。（@爱的抉择）
【原文信息】
subsp. BB-12 Protects against Antibiotic-Induced Functional and Compositional Changes in Human Fecal Microbiome
2021-08-17, doi: 10.3390/nu13082814
FROGS：分析真菌多样性的强大工具
Briefings in Bioinformatics——[11.622]
① FROGS 是一个易于使用的工具软件，使用智能方法处理内部转录间隔区(ITS)扩增子序列，而且同样适合和高效地处理所有其他不可合并的扩增子；② FROGS 被与许多流行的宏条形码工具进行了比较，并被证明对可靠的 OTU 序列重组非常敏感；③ FROGS 产生极少的假阳性和假阴性，具有出色的召回率和准确率；④ FROGS 简单易学，既可以在网页中通过Galaxy 平台上使用，也可以在命令行上使用。
【主编评语】
检测真菌最常用的标志物是 ITS，但有一个主要缺陷：PCR可能会在大量真菌中产生非重叠的读长。当这些读长被过滤掉时，传统的宏条形码流程会丢失部分信息，从而产生关于所研究环境的组成和结构的有偏差的图片。本研究开发了一种解决方案-FROGS工具，可以处理包括重叠和非重叠在内的整个读长集，从而提供更准确的真菌群落表征。作者使用模拟数据和真实数据进行对比测试证明了其解决方案的有效性，大家可通过命令行或基于 Galaxy 的 Web 界面使用该解决方案。（@刘永鑫-中科院-宏基因组）
【原文信息】
FROGS: a powerful tool to analyse the diversity of fungi with special management of internal transcribed spacers
2021-08-19, doi: 10.1093/bib/bbab318
国内团队：四氢姜黄素可抑制血小板活化和血栓形成
Thrombosis and Haemostasis——[5.249]
① 四氢姜黄素（THC）在体外可显著降低激动剂诱导的人纯化血小板的颗粒分泌，包括CD62P和CD63的表达，血小板因子4、CCL5和ATP的释放，此外抑制血小板聚集；② THC和姜黄素体外预处理的血小板可抑制肠系膜动脉血栓模型小鼠血栓的形成，且THC更佳，但两者均不延长尾部出血时间；③ 机制上，THC干预对血小板的血栓素A2(TxA2) 生成和颗粒分泌的抑制作用部分由THC通过下调MAPKs信号通路抑制血小板胞浆型磷脂酶A2（cPLA2）活化所介导。
【主编评语】
血小板颗粒分泌在动脉粥样硬化血栓形成中起关键作用，四氢姜黄素（THC）是姜黄素的主要代谢物之一，近期大理大学公共卫生学院牙甫礼作为通讯作者在Thrombosis and Haemostasis发表的一项研究表明THC通过抑制MAPKs/cPLA2信号传导减弱血小板的血栓素A2（TxA2）生成和颗粒分泌，进而抑制血栓形成，提示THC有心血管保护的潜力。此前，本研究合作者陈彬林（现就职广西妇幼保健院营养科）等人在Clin Exp Allergy发表的一项研究（2018年）证明膳食THC比姜黄素更有效的改善小鼠过敏性气道炎症。（@陈彬林）
【原文信息】
Tetrahydrocurcumin Downregulates MAPKs/cPLA2 Signaling and Attenuates Platelet Thromboxane A2 Generation, Granule Secretion, and Thrombus Growth
2021-08-24, doi: 10.1055/s-0041-1735192
警惕！肠缺血可能是新冠首发症状
Journal of Internal Medicine——[8.989]
① 3例有严重肠道症状的患者在切除的组织中呈现明显的SARS-CoV-2阳性，但没有COVID-19的任何常见临床表现，且多次咽拭子检测呈SARS-CoV-2阴性；② 所有标本的组织学检查均显示肠壁和胆囊壁广泛缺血坏死，壁内血管血栓形成，还观察到血管内皮炎和新血管生成，以及SARS-CoV-2蛋白特异性染色；③ 粪口感染/再感染是SARS-CoV-2传播的一种潜在方式，值得进一步研究；④ 建议对近期肠缺血急诊病例的切除样本进行SARS-CoV-2检测。
【主编评语】
新冠的非呼吸道首发症状被越来越多的报道，Journal of Internal Medicine近期发表的病例报告，首次报道了肠缺血症状可能是新冠的首发症状，再次表明粪口途径是新冠病毒感染的潜在途径。（@mildbreeze）
【原文信息】
Bowel ischemia as onset of COVID-19 in otherwise asymptomatic patients with persistently negative swab
2021-08-26, doi: 10.1111/joim.13385