癌症检测黑科技:一滴血可以验50多种癌症!

癌症的发病一般会很隐匿,出现明显症状的时候大多已经到了中晚期。这就给大家一个普遍印象,查出来的癌症都是中晚期,早期癌症的发现概率很低

利用血液游离DNA (cfDNA)同时检测和定位多种癌症类型,可以解决癌症早期诊断这个巨大的未被满足的需求。研究团队的目光聚焦于cfDNA 的甲基化水平,旨在以较强的异质性检测、定位出处于各阶段的多种癌症类型。

ctDNA 就是循环肿瘤DNA(Circulating tumor DNA),就是原发肿瘤甚至是转移形成的新肿瘤上的细胞破裂掉落下来的DNA片段,进入外周血循环系统。

cfDNA就是血液游离DNA(Cell free DNA),就是在血液中游离的自身DNA而已,这些DNA多是从身体的细胞或者白血球破裂释放出来的。

DNA 甲基化是指 DNA 化学修饰的一种形式,能够在不改变 DNA 序列的前提下改变遗传表现。DNA 甲基化通常会抑制基因表达,DNA 甲基化异常及其造成的基因表达的变化将促进肿瘤的生长,因此分析 cfDNA 甲基化有利于检测和定位癌症

但是目前使用cfDNA或其他分析物同时检测和定位多种癌症类型的研究很少。

2020年3月,《肿瘤学年鉴》杂志上刊登了一项研究:一种新型血液检测技术,可以验出超过50种癌症,准确度还相当之高!该技术检测癌症的特异性高达99.3%,假阳性率仅0.7%。

研究数据

CCGA(NCT02889978)研究的目的是确定结合人工智能的cfDNA测序是否能够以足够高的特异性检测和定位大量的癌症类型,从而被考虑用于以一般人群为基础的癌症筛查项目

这是一项前瞻性、多中心、病例对照、观察性、随访研究。这项研究纳入了6689名参与者,其中2482名为癌症患者(超过50种癌症),其余4207名未患任何癌症。

研究者将他们分为训练集(training set)和验证集(validation set,二者皆为机器学习术语),分别从参与者身上收集了血液进行检验,通过使用二代测序技术分析血样里游离DNA(cfDNA)中的甲基组序列,来得出结果。

试验结果表明,在验证集中,检测整体特异性为99.3%;训练集中,特异性为99.8%;验证集中的假阳性率(FPR)为0.7%,训练集中的FPR为0.6%。这反映出在50多种癌症中,单一的、一致的假阳性率(FPR)不到1%。

图注:癌症检测特异性数据

在所有癌症中,验证集和训练集中的I–III期癌症检测敏感度为43.9%和44.2%。对于12种常见癌症(肛门癌、膀胱癌、结直肠癌、食管癌、头颈部癌、肝癌/胆管癌、肺癌、淋巴瘤、卵巢癌、胰腺癌、浆细胞肿瘤以及胃癌),验证集和训练集中的I–III期癌症检测敏感度为67.3%和69.8%。

图注:癌症检测敏感度数据

检测敏感度还与癌症分期有关,分期越晚则敏感度越高。在所有的癌症中,I–Ⅳ 期检测敏感度分别为39%、69%、83%和92%,在12种癌症中, I–Ⅳ 期检测敏感度分别为18%、43%、81%和93%。

这项技术对许多没有筛查范例的致命癌症类型也有效果,例如,在胰腺癌检测中,I期敏感度为63%,II期敏感度为83%,III期敏感度为75%,IV期敏感度为100%。

对癌症组织来源准确性的分析发现,96%的样本具有类似癌症的信号,正确率为93%。训练集和验证集之间以及各阶段之间的准确性是一致的。

图注:组织来源准确度数据

小结

鉴于以上结果,研究者认为这种cfDNA测序技术可能是一种筛选各类癌症患者的可行方法。cfDNA的靶向甲基化分析可同时检测和定位50多种癌症类型,包括缺乏筛查范例的高死亡率癌症。

但是这项技术仍存在一定的局限性。在分析时,并没有对所有未患癌参与者进行1年的完整随访,以确保他们没有患癌;另外,尽管研究中所涵盖的癌症类型范围很广,但因某些癌症类型的样本量过小,研究结果有一定可能性会在这些类型中呈现异质性。

使用这种基于cfDNA的多癌症早期检测试验,是否可以在较早阶段检测到癌症,仍需要进行进一步的研究。

参考资料:

https://www.sciencedirect.com

End

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