陈根：全基因组测序，为精准治疗添砖加瓦

文|陈根

许多基因可以在多种生物学过程或分子功能中发挥作用。在全基因组水平上鉴定多功能基因并研究其特性可以揭示支持细胞功能的分子事件的复杂性，从而使人们更好地了解细胞的功能格局。

全基因组测序是对生物体整个基因组序列进行的测序，可以获得完整的基因组信息。1986年，Renato Dulbecco最早提出人类基因组的测序。他认为如果能够知道所有人基因的序列，对癌症的研究将会很有帮助。

随着近年来测序技术的不断进步，该技术确实在精准治疗中发挥很大效用。近日，荷兰癌症研究所的科学家们又发现，在转移性肿瘤的系统治疗中，一次WGS足以为治疗提供充足可靠的信息。

科学家们分析了481份转移瘤样本的全基因组数据，这些样本来自231个成年患者。这些数据被整合成250对“配对样本”，每对样本都是同一患者肿瘤转移前后分别获取的肿瘤组织。配对样本取样间隔的中位数是6.4个月（范围：0.6-33.3个月）。

结果表明，481份样本中共检测出2491个驱动基因，包括122个原癌基因，和155个抑癌基因。此外，还存在466个（97%）样本检测出至少1个驱动基因突变。在配对样本的对比中，平均驱动基因的个数是一致的(P=0.33)，各样本的中位驱动基因为5个。

科学家们分析了这5个发病率最高的癌肿。整体相比，这些常见癌种配对样本中驱动基因率没有显著差异。但配对样本取样病灶不同、更长的活检间隔时间，是两个增加配对样本驱动基因改变率的因素。

值得一提的是，481个样本中，有111个（23%）发现了至少1个SOC标记基因，其中71个样本含（15%）药物敏感标记基因（例如非小细胞肺癌中EGFR热点突变），37个（8%）含耐药标记基因（例如结直肠癌中的KRAS热点突变），另有3个（0.6%）样本同时含有敏感标记基因和耐药标记基因。

未来，期待更精准、更复杂的基因检测技术在临床上大展身手。