人类研究中的管家基因

人类研究中的管家基因

定义我就不多说了，不懂的自行去搜索了解。

早在2003年，Su et al. 等人就发表了文章List of housekeeping human genes derived from the article "Human Housekeeping genes are compact 收集了常见的可以在real-time PCR实验当做对照的管家基因集合，基于表达芯片值来判定的。

详细列表在：http://www.tau.ac.il/~elieis/Housekeeping_genes.html

*NM_001101        actin, beta (ACTB), mRNA      6988
*NM_000034        aldolase A,fructose-bisphosphate (ALDOA), mRNA         3425
*NM_002046        glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPD), mRNA         828
*NM_000291        phosphoglycerate kinase 1 (PGK1), mRNA          2727
*NM_005566        lactate dehydrogenase A (LDHA), mRNA            2105

很明显可以看到，大家耳熟能详的 GAPDH，ACTB都在其中，很好。

但是在2013年，E. Eisenberg and E.Y. Levanon等人对管家基因列表进行了修正，发表文章：Human housekeeping genes revisited ，这个时候是基于RNA-seq数据来判定的，选取那些基因在人体类不同的细胞组织表达模式都比较统一的基因。其实可以用GTEx数据库来进行这个探索，可以把它再修正一波。

完整列表见：https://www.tau.ac.il/~elieis/HKG/HK_genes.txt  还包括这些基因的外显子信息：https://www.tau.ac.il/~elieis/HKG/HK_exons.xlsx  都是可以下载自行探索的。

不够，吊轨的是，作者推荐用来做实验的PCR control genes我竟然一个都不认识，唉，尴尬的是以前熟知的GAPDH，ACTB居然被剔除掉了。
呵呵哈哈哈