今日Nature：隔日'过午不食'为何能更长寿？| 热心肠日报
今天是第1954期日报。
Nature：符合昼夜节律的限时进食如何促进健康长寿？
Nature[IF:49.962]
① 一种间歇性限时进食（iTRF）方法（隔天进行“过午不食”式的20小时禁食），能在果蝇中抗衰老（推迟肌肉和肠道的衰老标志物表达）、延长寿命；② iTRF能增强昼夜节律性的生物钟和自噬基因表达，且其作用也依赖于这二者；③ 敲除核心生物钟基因或抑制自噬介导因子表达，以及改为白天禁食/夜间进食或在白天诱导自噬，均使iTRF失效；④ 增强夜间的自噬，能在随意进食的果蝇中起到与iTRF一样的有益作用，是iTRF抗衰老、促长寿的主要机制。
Circadian autophagy drives iTRF-mediated longevity
09-29, doi: 10.1038/s41586-021-03934-0
【主编评语】限时进食（TRF）是将进食控制在特定时间段内的一种禁食方法。近年研究表明TRF有助于改善代谢健康，可能有潜在的抗衰老作用。Nature发表的一项最新研究发现，一种符合昼夜节律的间歇性TRF（iTRF）方法能在果蝇中有效延缓衰老、延长寿命。进一步研究发现，iTRF的这种作用机制不同于其他的促长寿干预（热量限制、限制膳食蛋白质、抑制胰岛素样信号），也不依赖于肠道菌群，而是通过增强生物钟调控的夜间自噬作用来发挥其健康效益的。这些发现为研发促进健康长寿的饮食和药物干预手段，提供了新的理论和证据支持。（@mildbreeze）
生活方式干预可有效治疗难治性高血压
Circulation[IF:29.69]
① 140名难治性高血压患者随机分为2组，分别接受4个月的生活方式干预（饮食指导、行为体重管理、锻炼）或对照干预（标准化教育和医生建议）；② 相比于对照干预组，生活方式干预组的收缩压降低值显著更高（-12.5mmHg vs. -7.0mmHg）；③ 相比于干预前，生活方式干预显著降低24小时动态血压（-7.0mmHg），对照干预无作用（-0.3mmHg）；④ 相比于对照干预组，生活方式干预组的静息压力反射敏感性、高频心率变异性及流量介导扩张均有更好的改善。
Effects of Lifestyle Modification on Patients With Resistant Hypertension: Results of the TRIUMPH Randomized Clinical Trial
09-27, doi: 10.1161/CIRCULATIONAHA.121.055329
【主编评语】来自Circulation上发表的一项随机对照临床试验结果，在140名难治性高血压患者中进行了4个月的干预，发现相比于简单的标准化教育及医生建议，基于饮食及运动的生活方式干预可更好地降低患者的收缩压，并改善多项高血压相关指标。（@aluba）
香辛料有助改善24h动态血压
American Journal of Clinical Nutrition[IF:7.045]
① 对有心脏代谢疾病风险升高的71位超重/肥胖成年人进行随机、交叉、对照喂养试验，参与者在每日供能2100kcal的相似饮食背景下接受低、中或高剂量香辛料烹饪膳食共4周；② 三个剂量对LDL胆固醇（主要结果）的影响无显著差别；③ 与中剂量香辛料（3.3g/日）相比，高剂量（6.6g/日）显著降低了24h平均收缩压，与低剂量（0.5g/日）相比，高剂量降低了24h平均舒张压；④ 三种剂量香辛料饮食对诊室血压、血糖指标和血管功能的影响无显著差异。
Herbs and spices at a relatively high culinary dosage improves 24-hour ambulatory blood pressure in adults at risk of cardiometabolic diseases: a randomized, crossover, controlled-feeding study
09-12, doi: 10.1093/ajcn/nqab291
【主编评语】近期发表于American Journal of Clinical Nutrition的一项研究表明，在心脏代谢疾病风险升高的超重/肥胖成年人中，与使用低、中剂量香辛料烹饪相比，高剂量香辛料干预4周有改善24h动态血压的趋势。本研究使用的香辛料包含肉桂，香菜，姜，孜然，欧芹，黑胡椒粉，大蒜，姜黄，洋葱粉，红辣椒，迷迭香等24种药草和香料。（@临床营养Dr.Chen）
浙江大学：长期坚持健康饮食可降低女性晚年认知衰退风险
American Journal of Clinical Nutrition[IF:7.045]
① 随访49493名基线平均48岁的女护士达30年，期间重复7次做食物频率问卷得出饮食分数；② 比较替代地中海饮食（AMED）、DASH饮食和替代健康饮食指数（AHEI-2010）的最高最低得分五分位者，严重主观认知下降（SCD）与无SCD的校正优势比分别为0.57、0.61和0.81；③ 与长久以来和近年来饮食质量三分位最低者相比，长期保持饮食质量最高者发生严重SCD的几率最低，且随时间推移饮食不断改善者患严重SCD的几率还能更低；④ 女性健康饮食有益于认知。
Long-term diet quality and its change in relation to late-life subjective cognitive decline
09-25, doi: 10.1093/ajcn/nqab326
【主编评语】近期浙江大学医学院公共卫生学院袁长征作为通讯作者在American Journal of Clinical Nutrition发表的一项研究表明女性长期坚持和改善健康饮食模式（如DASH饮食）对维持主观认知有益。（@临床营养Dr.Chen）
促炎饮食可能增加老年人的衰弱风险
American Journal of Clinical Nutrition[IF:7.045]
① 纳入1701名中老年受试者（平均年龄58岁），约12年的随访期间，224例发展为衰弱；② 通过食物频率问卷评估受试者的能量校正后的饮食炎症指数（E-DII）；③ 校正多种相关混杂因素后，E-DII每增加一个单位，与衰弱风险增加16%显著相关；④ 相比于E-DII最低的受试者，E-DII最高的受试者的衰弱风险显著增加为前者的2倍多（OR=2.22）；⑤ E-DII与衰弱的关联并非由IL-6与及反应蛋白所介导。
A pro-inflammatory diet is associated with increased odds of frailty after 12-year follow-up in a cohort of adults
09-24, doi: 10.1093/ajcn/nqab317
【主编评语】衰弱（frailty）发生于10-15%的社区老年人中，炎症是衰弱的一大关键因素。American Journal of Clinical Nutrition上发表的一项前瞻性队列研究结果，对1701名中老年人进行12年左右的随访后发现，较高的饮食炎症指数与衰弱风险的增加显著相关。（@aluba）
十二指肠粘膜重塑治疗2型糖尿病（综述）
Gut[IF:23.059]
① DMR可降低血糖，并具有额外的代谢改善作用，如减少肝脏脂肪，且没有其它手术的导致解剖结构改变的缺点；② 临床研究表明，DMR对高胰岛素抵抗患者效果最好；③ DMR可能不是安全有效地消融十二指肠粘膜的唯一方法，新的消融技术（如粘膜下激光消融、脉冲电场消融）正在研究中；④ 为推动“代谢内镜”领域的发展，需一种综合方法可在人类和临床前模型中研究DMR的效果；⑤ 目前，DMR还不能取代基于药物的2型糖尿病管理。
Alternative treatments for type 2 diabetes and associated metabolic diseases: medical therapy or endoscopic duodenal mucosal remodelling?
09-08, doi: 10.1136/gutjnl-2020-323931
【主编评语】十二指肠粘膜重塑（DMR）是一种旨在治疗2型糖尿病的内镜手术。来自Gut上发表的一篇综述文章，介绍了利用DMR治疗2型糖尿病的作用机制及临床效果，并讨论了十二指肠消融的治疗程序及消融技术，同时也提示，目前对于2型糖尿病的管理，DMR尚无法取代药物治疗。（@aluba）
通过零膨胀分位数法 (ZINQ) 对微生物组数据进行非参数关联检验
Microbiome[IF:14.65]
① 本研究提出了ZINQ，它使用两部分分位数回归模型来适应菌群数据中的零膨胀；② 对于给定的分类群，ZINQ 包括逻辑回归中的有效检验以对零计数进行建模，然后是一系列基于分位数等级得分的检验，对非零部分的多个分位数进行了调整，并针对零膨胀进行了调整；③ 作为一种基于回归和分位数的方法，该方法是非参数的并且对不规则分布具有鲁棒性，同时允许协变量调整；④ 由于没有做出分布假设，ZINQ 可以应用于已在任何规范化策略下处理过的数据。
Powerful and robust non-parametric association testing for microbiome data via a zero-inflated quantile approach (ZINQ)
09-02, doi: 10.1186/s40168-021-01129-3
【主编评语】本研究提出了 ZINQ，这是一种微生物群与二分或定量临床变量之间基于分位数的关联检验，基于一系列场景中的真实数据和对真实数据集的应用的全面模拟表明，与现有检验相比，即使它提供了更好的假阳性控制，ZINQ 通常具有相等或更高的功效，其为当前的菌群差异丰度分析提供了强大而可靠的替代方案。这项工作为菌群数据的关联检验提供了一种稳健而强大的非参数回归方法。（@刘永鑫-中科院-宏基因组）
Rob Knight团队：Faith系统发育多样性的高效计算及其在菌群特征分析中的应用
Genome Research[IF:9.043]
① Stacked Faith的系统发育多样性(SFPhD)通过实现一种计算效率高的算法，能够在更大的规模上计算这种被广泛采用的多样性指标；② 与以前的方法相比，该算法减少了所需的计算资源量，从而产生了更易于访问的软件，同时减少了碳足迹；③ 新算法得到的结果与先前的算法得到的结果相同；④ 作者进一步证明，在 FINRISK 研究的宏基因组数据中，Faith's PD 的系统发育方面为检测年轻和年长人群之间的多样性差异提供了更大的能力。
Efficient computation of Faith's phylogenetic diversity with applications in characterizing microbiomes
09-03, doi: 10.1101/gr.275777.121
【主编评语】基于系统发育、系统基因组树和稀疏数据分析的算法和资源进步的推动，作者开发了一种新的算法——即 Stacked Faith 的系统发育多样性 (SFPhD)，用于快速计算 Faith's PD。此外，作者旨在证明基于系统发育分析的在宏基因组研究中是值得关注的角度，之前在这些研究中该指标不常使用。基准测试的代码可在 GitHub (https://github.com/biocore/faiths-pd-benchmarking) 上找到。对 FINRISK 宏基因组数据进行基准测试所需的数据和代码也可在 GitHub 上获得。SFPhD 代码可在 unifrac Python 包 (https://github.com/biocore/unifrac) 中找到。（@刘永鑫-中科院-宏基因组）
朱怀球团队：DeePhage——区分宏病毒组中的毒性和温和噬菌体衍生序列的工具
GigaScience[IF:6.524]
① DeePhage 使用“one-hot”编码形式来详细表示 DNA 序列；② 通过卷积神经网络检测序列特征以获取有价值的局部特征；③ DeePhage 在 5 倍交叉验证上的准确率高达 89%，比 2 个类似工具 PhagePred 和 PHACTS 高出近 10% 和 30%；④ 在真实的宏病毒组中，DeePhage 在使用 BLAST 作为注释时正确预测了最高比例的重叠群，没有明显的偏好；⑤ 在相同的计算配置下，DeePhage 与 PhagePred 和 PHACTS 相比，运行时间分别减少了 245 和 810 倍。
DeePhage: distinguishing virulent and temperate phage-derived sequences in metavirome data with a deep learning approach
09-08, doi: 10.1093/gigascience/giab056
【主编评语】北大朱怀球团队在本研究中提出了一种新的计算方法 DeePhage，它可以直接快速地将每个读长或重叠群判断为有毒或温和的噬菌体衍生片段，特别是用于宏基因组学分析，通过直接检测来自宏基因组和宏病毒组的温和病毒片段，该研究进一步提出了一种新策略来探索菌群中的噬菌体转化。检测这种转变的能力为人们提供了对人类疾病潜在治疗方法的新见解。DeePhage 可通过 http://cqb.pku.edu.cn/ZhuLab/DeePhage 或https://github.com/shufangwu/DeePhage 免费获得。（@刘永鑫-中科院-宏基因组）
感谢本期日报的创作者：mildbreeze，aluba，临床营养Dr.Chen，Dr.Smile，刘永鑫-中科院-宏基因组