miRNA前体、miR-5p、miR-3p
什么是miRNA?
miRNA (microRNA)是一组由基因组编码的长度约20~23个核苷酸的非编码RNA,通过和靶基因mRNA碱基配对引导沉默复合体(RISC)降解mRNA或阻碍其翻译。在miRNA公共数据库miRBase (http://www.mirbase.org/)中已经有1W多条来自不同物种的miRNA序列。
如何形成的?
是由约70个碱基大小形成发夹结构的单链RNA前体 (pre-miRNA),经过Dicer酶酶切加工后,成为长约20~24nt的成熟miRNA,如下图所示
有的miRNA前体两个臂分别产生一条有功能的成熟miRNA,他们分别靶向不同的位点。这时候就要来进行区分了,一般以“-5p”和“-3p”分别命名。如hsa-miR-21-5p和hsa-miR-21-3p,分别表明从hsa-mir-21前体的5’端臂和3’端臂加工而来的。表达水平较高的miRNA后面不加任何符号,而表达水平较低的miRNA后面加上*号,如hsa-miR-21*,有时带“*”的miRNA就根本不出现。
而发夹状结构的miRNA前体转录本以“mir”命名,其编号以“MI”编号,如人的miRNA 21的前体ID为hsa-mir-21,Accession为MI0000077。
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