10×Visium空间转录组测序技术原理

将基因的表达与组织切片的免疫组化图像进行整合，从而将组织内不同细胞的基因表达信息定位到组织的原始空间位置上去，从而能够定位和区分功能基因在特定组织区域内的活跃表达，达到直观检测组织中不同部位基因表达的差异。对于理解生物学和复杂疾病至关重要。

技术原理

10x Genomics空间转录组用于文库构建的每张载玻片上有四个捕获区域，每个捕获区域的大小为6.5x6.5mm，包含5000个被条形码标记的点（barcoded spots），每个点的直径为55 μm，点和点之间中心的距离为100 μm，并且每个点都有一个唯一的barcode序列，每个数据点会覆盖 1-10 个细胞。组织切片的细胞中会释放出mRNA，通过poly-T捕获带有poly-A的mRNA，迁移到每个spot的mRNA会被标记上相应的barcode序列，然后进行文库构建并进行测序。最后，根据数据的条形码信息对数据进行分析，以确定哪些数据来自哪个位置，从而实现空间基因表达的可视化。