想研究抗生素抗性基因却不懂宏基因组？

写在前面

前一阵终于走出了我觉得最正确的一步，我退学了！！

虽然没有学位了，但是学还是没白上，毕竟知识是靠我自己一点一点学来的。

没学位就进不了高校了，然而我也不会干别的，就注册了一个公司开展科研服务解决吃饭问题。

相信关注公众号的老粉应该对我研究抗生素抗性基因相关问题和数据分析的能力有一定的了解，所以就有了今天这条恰饭推文～

产品介绍

目前来说，环境领域研究抗生素抗性基因最常用的方法是通过宏基因组，但是宏基因组学的研究其实有利有弊。

宏基因组技术的优点说起来挺吸引人的，简单的说就是通过宏基因组测序，微生物群落中的所有东西都能获得。

对于抗生素抗性基因研究来说，除了基本的抗性基因多样性和丰度以外，宏基因组技术比较吸引人的就是能同时获得可移动基因单元相关的结果，并且能够识别部分抗生素抗性基因的宿主微生物。

但是 (重点来了)，宏基因组分析的理想永远是好的，但是实际的结果几乎完全可以说是取决于分析人员的个人能力，这一点对于那些做的非常好的课题组当然不是什么问题，但是对于大部分依赖于测序公司进行分析的课题组来说就是天大的问题，最后几乎得不到理想的结果。

对于属于“大多数”的我们来说，现在有了更加简便、易用、学习成本低的研究方法。

美格基因与中国科学院城市环境研究所朱永官院士团队深度合作，隆重推出高通量qPCR芯片检测服务，该芯片一次可以同时检测383种抗生素抗性基因(其中包含少量的可移动基因单元)，基本上可以做到环境样本中抗生素抗性基因的全覆盖，轻松满足科研用户一次性和便捷地检测数百个目标基因的需求。

产品特点

产品详情

实验流程

分析要点

前一阵专门写了一篇推文详细介绍了这个检测服务的原理和数据分析过程，想要了解详细方法的请点传送门！！

产品参数

分析服务

能看到这里的朋友应该就是比较感兴趣了，后面才是我要说的重点内容。

这个产品是属于美格基因的一款测试服务，我是与美格基因进行合作，样本还是送到美格基因去测试的。

那我在这中间是干什么的呢？直接找美格基因去测不是更好么？

看了上文介绍的朋友应该了解了，这个技术本质上说就是荧光定量PCR，只不过是使用了一个我们平时实验室没有的专业qPCR设备，应用已经进行验证好的各个基因的引物进行测定，最后得到的结果就是这383个基因的相对丰度和绝对丰度。

注意了！！

美格基因给的结果就是两个数据表格，分别是样本中各个基因的绝对丰度和相对丰度。

虽然这样已经节省了大量的数据分析成本，至少不需要用服务器了，但是数据表格依然挺大的，主流的分析方式还是采用R语言进行后续的统计学分析和可视化 (有点类似于16S rRNA扩增子的后续分析)。

如果对数据的格式、应用方式和R语言不熟悉，其实分析起来还是有一定的难度的。

这就是我的工作了，我可以根据各位的研究内容，量身打造数据分析和可视化方案，减轻各位的学习成本和分析时间。

其实这种数据分析也并非只有我能做，不过相对于其它公司的常规数据分析人员来说，我具有一个很难替代的优势，就是我对这种数据怎么写文章还是有自己的一套想法的，文章也发了不少。

在我这里做分析，我可以提供“实验设计-数据分析-文章写作”全方位的帮助！！

想要做这个服务的老师请通过下方的联系方式与我联系，想要了解我水平能力的朋友也可以聊一聊😂