2019年度回顾 | 微生态人体/动物微生物类微文大合辑
今天是第二期大合集，微生太将和大家回顾一下2019年度人体/动物微生物类的微文，本期囊括了2019年一年中微生态公众号所发布的人体/动物微生物类，根据关键词分为以下13个类别：
【1 综述】
1 综述
综述 | Cancer Cell(IF:23.916)：肠道微生物对癌症、免疫和癌症免疫治疗的影响
综述 | 肠道微生物群、代谢产物和宿主免疫（IF：41.982）
综述 | Cell：炎症性肠病的治疗机遇：宿主 - 微生物关系的机制解析
综述 | Cell Host & Microbe：胃肠道微生物群的区域多样性
综述 | Nature ReviewsMicrobiology：炎症性肠病的微生物基因和途径
综述 | Mol Nutr Food Res：花青素对肥胖相关炎症和肠道菌群变化的保护作用
综述 | Nature子刊：结直肠癌的肠道微生物群：作用机制与临床应用（国人作品IF=23.57）
Nature子刊 | 短链脂肪酸在微生物-肠-脑通讯中的作用（综述）
综述 | 中医科学院李松林等：中草药与肠道微生物组相互作用的分子机制（IF：8.763）
综述 | Microbiome：人体肠道微生物的营养代谢：主要代谢物及其对宿主健康的影响
综述 | Cell 子刊：肠道菌群调节色氨酸代谢影响健康和疾病的机制研究
综述 | Journal of Hepatology | 肠-肝轴在肝病中的影响：治疗的病理生理基础
综述 | Trends in Microbiology：生命最初十年的肠道微生物群
综述 | Gut microbiota：国际癌症微生物组联盟发出共识声明：人类微生物组在癌症中发挥作用
综述 | 肠道代谢组：微生物与宿主之间的相互作用（IF：20.773）
综述 | Cancer Letters：肠道菌群与肿瘤免疫治疗(国人作品)
综述 | Science：在饮食和人类健康的交互点的肠道微生物群
综述 | Genome Biology：人类肠道微生物组的种群动态：变化是唯一不变的
综述 | 南昌大学聂少平等：饮食和中药通过调节肠道菌群缓解2型糖尿病
综述 | Nature Communications：一类广泛存在于人体肠道的拟杆菌肽毒素
综述 | CRIT REV BIOTECHNOL：膳食纤维作为对抗糖尿病的新兴营养因子：关注肠道菌群的参与
综述 | 肠道微生物代谢产物对肥胖、NAFLD和T2DM的影响
综述 | Nature子刊：肥胖，NAFLD和T2DM中的肠道微生物代谢产物
综述 | NAT MED：人类微生物组研究需将菌群区系纳入蓝图
综述 | STEM CELLS：代谢物和肠道菌群在肿瘤免疫编辑、CD8/Treg比值、免疫细胞稳态及肿瘤(免疫)治疗中的意义
综述 | Cell Host & Microbe：精准医学：工程微生物改善药物疗效
综述 | 精简微生物种类—针对免疫治疗的微生物及其代谢产物（IF：41.982）
综述 | 肝脂肪变性背后的秘密组织——肠道微生物组、血浆代谢组和肝脏转录组
综述：特定微生物丛模型在人肠道宿主-微生物间相互作用研究中的应用
综述 | Nature Immunology：微生物群对呼吸健康的影响
综述 | HUM REPROD UPDATE：男女性生殖道菌群的组成特征分析
2 健康人群肠道
综述 | Cell Host & Microbe：胃肠道微生物群的区域多样性
综述 | Trends in Microbiology：生命最初十年的肠道微生物群
综述 | Genome Biology：人类肠道微生物组的种群动态：变化是唯一不变的
科研 | 华大：1520个人肠道单细菌参考基因组，助力菌群研究
综述 | NAT MED：人类微生物组研究需将菌群区系纳入蓝图
科研 | mSystems：撒丁岛百岁老人肠道菌群组成和功能的代表性研究
科研 | Microbiome：对健康个体肠道微生物群多样性与人口学、环境和宿主基因的综合评估
Cell Host & Microbe | 肠道和口腔微生物群落中的遗传信息分布
3 饮食&药物
饮食
Nature Microbiology | 烹饪塑造了肠道微生物菌群的结构和功能
科研 | Cell子刊：抗生素后肠道微生物群的恢复取决于宿主饮食、肠道环境和环境因素
科研 | Cell Host & Microbe: 每日取样揭示了人类饮食与肠道菌群的个性化关联
科研 | 中国农业大学：早期补充叶绿素可预防饮食引起的肥胖并调节小鼠肠道菌群（国人作品）
科研 | Cell Host & Microbe：人类肠道细菌对食品加工过程中常见产物的降解
综述 | CRIT REV BIOTECHNOL：膳食纤维作为对抗糖尿病的新兴营养因子：关注肠道菌群的参与
Gut：饮食中脂肪含量对肠道菌群和代谢物的影响及其与心血管代谢风险因素的关系（国人作品）
科研 | 越桔改善高脂肪饮食诱导的大鼠结肠粘液动态变化并恢复紊乱的肠道微生物群
Gastroenterology | 高脂饮食加速癌变的机制
Nature 子刊 | 饮食-微生物群的相互作用和个性化营养
Microbiome | 膳食果糖诱导的肠道生态失调促进小鼠海马神经炎症：短链脂肪酸的作用
Diabetes Care | 减肥试验：减肥饮食对肠道微生物循环代谢产物氧化三甲胺（TMAO）和骨密度变化的影响
Microbiome | 饮食诱导的慢性肠病缓解与微生物群落结构和次级胆汁酸的合成改变相关
Nature子刊 | 罗氏弧菌和饮食相互作用调控小鼠动脉粥样硬化
Gut | (国人作品)长期多种饮食的变化下人体肠道微生物群落的恢复力
MOL NUTR FOOD RES ǀ增加乳制品的摄入量会改变有患2型糖尿病风险受试者的血清代谢物谱
赵立平团队：绿茶多酚改变db/db小鼠肠道菌群且与血糖降低有关
南农曾晓雄团队+枸杞研究中心曹有龙团队：探究黑果枸杞中花青素对结肠炎小鼠肠道菌群的调节及抗炎特性
Cell子刊 | 蓝莓提取物通过调节肠道微生物群和胆汁酸通过FXR和TGR5途径改善肥胖
Gut | 膳食菊粉可改善肥胖患者的胰岛素敏感性，且对肠道菌群，血浆代谢物和全身炎症反应有直接影响
科研 | JACI：高脂肪摄入诱导微生物区系特征促使食物过敏
药物
综述 | 中医科学院李松林等：中草药与肠道微生物组相互作用的分子机制（IF：8.763）
科研 | Science：肠道菌群影响人体的药物动力学和毒性
科研 | Nature Medicine：口服大环内酯类抗生素通过改变肠道微生物组成降低不发达国家儿童死亡率
科研 | 首都医科大学：白芍总苷长期干预胶原诱导型关节炎大鼠后肠道菌群的动态变化（国人作品）
综述 | Science：在饮食和人类健康的交互点的肠道微生物群
综述 | 南昌大学聂少平等：饮食和中药通过调节肠道菌群缓解2型糖尿病
科研 | 破壁灵芝孢子提取物的抗肿瘤活性：肠道微生物群重塑对衰竭细胞毒性T细胞的修复作用（国人作品）
科研 | 甘草-甘遂配伍对肠道菌群多样性和代谢功能的影响（国人作品）
综述 | Cell Host & Microbe：精准医学：工程微生物改善药物疗效
JN | 中大凌文华等：补充丁酸钠可调节肠道菌群，改善小鼠高脂饮食诱导的肥胖症
科研 | Gastroenterology：IBD患者肿瘤坏死因子拮抗剂疗效影响肠道菌群代谢功能
Nature子刊 | 肠道血清素和氟西汀的暴露调节肠道内细菌的定植
4 糖尿病&肥胖
糖尿病
科研 | 仝小林+赵立平：二甲双胍和中药复方改变2型糖尿病合并高脂血症患者的肠道菌群结构
Gut | 膳食菊粉可改善肥胖患者的胰岛素敏感性，且对肠道菌群，血浆代谢物和全身炎症反应有直接影响
科研 | 上海交通大学赵立平、张晨虹、彭永德等：膳食纤维选择性地促进了肠道细菌以缓解2型糖尿病
科研 | PNAS：肠道微生物通过外周血清素调节宿主葡萄糖稳态
科研 | mSystems：不同脂糖比的高能量饮食诱导的肠道菌群在糖尿病前期小鼠中具有相似的促肥胖基因和代谢产物
新发现！肠道菌群，短链脂肪酸和代谢疾病之间具有因果关系（IF：27.125）
综述 | CRIT REV BIOTECHNOL：膳食纤维作为对抗糖尿病的新兴营养因子：关注肠道菌群的参与
综述 | 肠道微生物代谢产物对肥胖、NAFLD和T2DM的影响
综述 | Nature子刊：肥胖，NAFLD和T2DM中的肠道微生物代谢产物
Cell子刊 | 肠道微生物组学分析揭示运动对糖尿病预防的功效（国人作品）
科研 | Cell Host & Microbe：患有和未患2型糖尿病的肥胖个体肠道微生物组成及功能差异
Nature Communication | 肠道菌群代谢物--苯基硫酸盐促进糖尿病肾病蛋白尿
Nat. Genet. | 肠道菌群产生的短链脂肪酸与糖尿病发病风险之间的关系
Cell Host & Microbe | 患有和未患2型糖尿病的肥胖个体肠道微生物组成及功能差异
Endocrine | 2型糖尿病及其并发症患者肠道菌群与粪便代谢的综合关系(国人作品)
MOL NUTR FOOD RES ǀ增加乳制品的摄入量会改变有患2型糖尿病风险受试者的血清代谢物谱
Cell子刊 | 糖尿病创面微生物组的菌株和物种水平变异与临床结果和治疗效果相关
肥胖
科研 | Cell子刊：隔日禁食改善非肥胖健康人群的健康状况
综述 | Mol Nutr Food Res：花青素对肥胖相关炎症和肠道菌群变化的保护作用
科研 | Nature Medicine：肥胖者经过减肥干预后肠道微生物组及血清代谢组的变化（国人作品）
科研 | 又胖又抑郁，不要怪自己，可能是基因问题（国人作品）
科研 | 中国农业大学：早期补充叶绿素可预防饮食引起的肥胖并调节小鼠肠道菌群（国人作品）
综述 | 肠道微生物代谢产物对肥胖、NAFLD和T2DM的影响
综述 | Nature子刊：肥胖，NAFLD和T2DM中的肠道微生物代谢产物
JN | 中大凌文华等：补充丁酸钠可调节肠道菌群，改善小鼠高脂饮食诱导的肥胖症
Diabetes Care | 减肥试验：减肥饮食对肠道微生物循环代谢产物氧化三甲胺（TMAO）和骨密度变化的影响
科研 | 肠道吉氏副拟杆菌通过产生琥珀酸和次级胆酸盐减轻宿主肥胖和代谢失常（国人作品）
科研 | 肠道吉氏副拟杆菌通过产生琥珀酸和次级胆酸盐减轻宿主肥胖和代谢失常（国人作品）
Gut | 减肥手术后--严重肥胖症患者微生物失调引起代谢物改变
5 肠道代谢&胆汁酸
肠道代谢
Gut：饮食中脂肪含量对肠道菌群和代谢物的影响及其与心血管代谢风险因素的关系（国人作品）
综述 | 浙江工业大学靳远祥：微塑料与微生物（包括肠道微生物菌群）的相互作用：一项对环境、动物和人类健康的思考
科研 | Nature Communications: 宏基因组和代谢组共同揭示了人体肠道菌群与宿主代谢的互作
综述 | 肠道微生物群、代谢产物和宿主免疫（IF：41.982）
综述 | Microbiome：人体肠道微生物的营养代谢：主要代谢物及其对宿主健康的影响
综述 | Cell 子刊：肠道菌群调节色氨酸代谢影响健康和疾病的机制研究
Nature Communication | 人体肠道微生物组与寄主代谢之间的互作
综述 | 肠道代谢组：微生物与宿主之间的相互作用（IF：20.773）
Nature子刊 | 肠道菌群代谢组研究表明饮食中的丝氨酸会让大肠杆菌在炎症的肠道中更加具有竞争力
Nature子刊 | 以粘膜为食的微生物对唾液酸的代谢表明了微生物对肠道的适应性机制
综述 | 南昌大学聂少平等：饮食和中药通过调节肠道菌群缓解2型糖尿病
科研 | Nature microbiology：γ-氨基丁酸对人类肠道细菌的调节作用
Cell | 肠道微生物的种间竞争机制：对同一纤维多糖的共同偏好
科研 | Nature子刊：炎症性肠病中肠道菌群结构及代谢活动变化
Cell子刊 | 代谢组揭示了肠道微生物代对人体内铁离子吸收的调节
科研 | Molecular SystemsBiology：大肠杆菌中枢代谢中蛋白质-代谢物相互作用的系统图
综述 | STEM CELLS：代谢物和肠道菌群在肿瘤免疫编辑、CD8/Treg比值、免疫细胞稳态及肿瘤(免疫)治疗中的意义
科研 | 通过补充肠道微生物群产生的戊酸盐可抑制艰难梭菌的生长
Medicinal Research Reviews | 褪黑激素介导的粘膜、微生物代谢、和节律的相互作用治疗肠道炎症
科研 | Microbiome：共生来源的代谢产物控制宿主肠道霍乱弧菌的发病机理
Cell | 基于化学-基因特异性分析对宿主健康有关联性的肠道菌群代谢物
综述 | 精简微生物种类—针对免疫治疗的微生物及其代谢产物（IF：41.982）
Nature Communication | 肠道菌群代谢物--苯基硫酸盐促进糖尿病肾病蛋白尿
Cell Metabolism | 肠道菌群相关代谢物--胆汁酸生物学功能
Diabetes Care | 减肥试验：减肥饮食对肠道微生物循环代谢产物氧化三甲胺（TMAO）和骨密度变化的影响
NAT REV ENDOCRINOL | SCFAs ：有益或有害？只有一线之差！
Microbiome | 批次效应对大鼠尿代谢组和肠道微生物群的影响比尿毒症更大
科研 | 肠道吉氏副拟杆菌通过产生琥珀酸和次级胆酸盐减轻宿主肥胖和代谢失常（国人作品）
科研 | Cell子刊：肠道共生菌代谢产物介导对沙门氏菌感染的定植抗性
Frontiers in Genetics | 肠道微生物与宿主代谢相互作用的表观遗传调控
生命早期因素和生活方式对学龄儿童肠道微生物群和代谢表型的影响
Endocrine | 2型糖尿病及其并发症患者肠道菌群与粪便代谢的综合关系(国人作品)
CIRC RES | 肠道微生物与心血管表型和风险相关的血浆代谢物的关联：横断面研究
Gut | 减肥手术后--严重肥胖症患者微生物失调引起代谢物改变
Cell Metab：微生物影响小鼠性别特异性节律基因和代谢物表达
科研 | 肠道吉氏副拟杆菌通过产生琥珀酸和次级胆酸盐减轻宿主肥胖和代谢失常（国人作品）
胆汁酸
Nature子刊 | 宏基因组和代谢组分析揭示了普洱茶中茶褐素可调节肠道菌群和胆汁酸代谢缓解高胆固醇血症（国人作品）
Cell子刊 | 蓝莓提取物通过调节肠道微生物群和胆汁酸通过FXR和TGR5途径改善肥胖
科研 | Hepatology：益生菌LGG通过抑制小鼠肝脏胆汁酸合成和促进胆汁酸排泄来预防肝纤维化
科研 | Gut：16SrRNA扩增子测序和代谢组共同揭示原发性硬化性胆管炎患者胆汁微生物群的变化
科研 | Gut：微生物胆汁酸水解酶介导粪便菌群移植治疗复发性艰难梭菌感染的疗效
Nature medicine | 肠道菌群-胆汁酸-IL22轴调控多囊卵巢综合征发病（国人作品）
Cell Metabolism | 肠道菌群相关代谢物--胆汁酸生物学功能
科研 | 肠道吉氏副拟杆菌通过产生琥珀酸和次级胆酸盐减轻宿主肥胖和代谢失常（国人作品）
Microbiome | 饮食诱导的慢性肠病缓解与微生物群落结构和次级胆汁酸的合成改变相关
科研 | 肠道吉氏副拟杆菌通过产生琥珀酸和次级胆酸盐减轻宿主肥胖和代谢失常（国人作品）
Microbiome | 通过肠道菌群次级胆汁酸代谢的综合评估揭示其在IBD的代谢能力差异
6 免疫&癌症
免疫
综述 | Cancer Cell(IF:23.916)：肠道微生物对癌症、免疫和癌症免疫治疗的影响
综述 | 肠道微生物群、代谢产物和宿主免疫（IF：41.982）
科研 | Nature Communication：肠道微生物组组成及其与关节疼痛和炎症的关系
科研 | Science：Akkermansia muciniphila黏蛋白降解菌在体内稳态下引发的肠道适应性免疫反应
科研 | Cell：抗生素驱动的肠道微生物群紊乱改变了人体对疫苗的免疫反应
科研 | Gut ：自身免疫性肝炎中肠道菌群的改变(国人作品)
综述 | Cancer Letters：肠道菌群与肿瘤免疫治疗(国人作品)
Nature Microbiology | 厌氧菌促进结直肠癌的发生，调节肿瘤免疫
综述 | STEM CELLS：代谢物和肠道菌群在肿瘤免疫编辑、CD8/Treg比值、免疫细胞稳态及肿瘤(免疫)治疗中的意义
科研 | 上海交大陆舜等：中国晚期NSCLC患者肠道微生物组多样性与抗PD-1免疫治疗疗效之间的强相关性
Cell | 抗生素驱动的肠道菌群紊乱改变了人体对疫苗的免疫
综述 | 精简微生物种类—针对免疫治疗的微生物及其代谢产物（IF：41.982）
科研 | Immunity：MHC II类抗原在肠道上皮细胞的呈递引发移植物抗宿主病，并受微生物群的影响
Cell | 伤害感受器神经元通过调节肠道生理而介导宿主对沙门氏菌的防御
Science | 生命早期的微生物控制MAIT细胞发育成熟进而促进组织修复
Nature Medicine | 搞事情，会不会过敏居然部分取决于肠道菌群
Cell Host & Microbe | 结肠炎诱导的Th17细胞增加重症继发感染的风险
NATURE子刊 | 自身免疫的遗传风险与人类肠道微生物群的明显变化相关
Nature | 先天淋巴细胞通过白细胞介素IL-2促进肠道中调节性T细胞的增殖
侵袭性白念珠菌感染过程中分泌的小型蛋白可激发机体TLR2/4介导的炎症反应（国人作品）
癌症
综述 | Cancer Cell(IF:23.916)：肠道微生物对癌症、免疫和癌症免疫治疗的影响
综述 | Nature子刊：结直肠癌的肠道微生物群：作用机制与临床应用（国人作品IF=23.57）
综述 | Gut microbiota：国际癌症微生物组联盟发出共识声明：人类微生物组在癌症中发挥作用
科研 | Nature：18S和ITS测序揭示了真菌菌群通过激活MBL促进胰腺癌的发生
科研 |Nat Med：检测粪便中特殊细菌的变化可以发现早期直肠癌
科研 | mBio: 粪便中短链脂肪酸以及肠道菌群的结构不能够预测结肠癌的状态
科研 | 香港中文大学于君:结直肠癌患者肠道真菌失调与生态改变
科研 | 南方医科大学珠江医院高毅：原发性肝癌不同分期的肠道菌群失调程度与预后的关系分析
Nature Microbiology | 厌氧菌促进结直肠癌的发生，调节肿瘤免疫
综述 | STEM CELLS：代谢物和肠道菌群在肿瘤免疫编辑、CD8/Treg比值、免疫细胞稳态及肿瘤(免疫)治疗中的意义
Gastroenterology | 高脂饮食加速癌变的机制
科研 | 上海交大陆舜等：中国晚期NSCLC患者肠道微生物组多样性与抗PD-1免疫治疗疗效之间的强相关性
观点 | Nature Reviews Cancer：专家访谈之“肿瘤微生物组”
科研 | Nature Medicine：工程化细菌诱导持久的肿瘤消退和全身抗肿瘤免疫应答
Gut | 中国高危人群胃癌风险预测规则的建立与验证：一项全国性多中心研究
Nature Medicine | 可编程细菌诱导持久的肿瘤消退和全身抗肿瘤免疫
PNAS | 结直肠癌相关肠道菌群可造成致癌的表观遗传特征
Nat. Med. | 通过荟萃分析揭示全球结直肠癌患者肠道菌群特征
Nature子刊 | Rnf5 - / - 小鼠改变的肠道菌群可增加抗肿瘤免疫抑制黑素瘤生长
肠道菌群激活组织蛋白酶K分泌介导TLR4依赖型M2巨噬细胞极化促进结直肠癌转移（国人作品）
Nat. Med. | 跨队列的结直肠癌微生物诊断特征及与胆碱降解的关联
7 神经系统
科研 | Nature子刊：精神分裂症患者肠道微生物群移植导致小鼠精神分裂症样精神障碍
科研 | Nature Communication：饮食中的色氨酸通过肠道菌群调控自身免疫性神经炎症
Nature子刊 | 短链脂肪酸在微生物-肠-脑通讯中的作用（综述）
肠道微生物可用于预测和区分健康人、阿尔茨海默症前期及患病人群：一项中国人队列研究
科研 | Hepatology：小鼠肝硬化相关神经炎症依赖于肠道菌群作用并可通过粪菌移植得到缓解
科研 | ISME：布氏田鼠体内调节宿主对寒冷代谢适应的微生物-内脏-脑相互作用（国人作品）
Science子刊 | 精神分裂症中菌群-肠-脑轴的潜在作用机制（国人作品）
科研 | Nature子刊：寡糖类药物GV-971重塑肠道菌群平衡，减轻脑内神经炎症进而抑制阿尔茨海默病的进展（国人作品）
科研 | 肠道菌群可调节腹侧海马应激受损大鼠的抑郁行为及炎症过程
Microbiome | 膳食果糖诱导的肠道生态失调促进小鼠海马神经炎症：短链脂肪酸的作用
科研 | Hepatology：小鼠肝硬化相关神经炎症依赖于肠道菌群作用并可通过粪菌移植缓解
压力、焦虑，你怕了吗？2篇新研究：看肠道菌群如何来刷“存在感”
Cell Reports | 神经系统变性疾病又添微生物新证据？代谢组揭示了帕金森病中肠道微生物与宿主相互作用对硫代谢的影响
BRAIN BEHAV IMMUN | 上海交大苏殿三等：术后参考记忆缺陷与肠道菌群失调相关
自闭症新发现：KDM5-菌群相互作用可调节社会行为（国人作品）
科研 | MOVEMENT DISORD：揭开帕金森病和非典型帕金森综合征的肠道微生物群的神秘面纱
科研 | Cell 子刊：寡糖类药物GV-971重塑肠道菌群平衡，减轻脑内神经炎症进而抑制阿尔茨海默病的进展（国人作品）
8 肝脏&肾脏&胰腺&心血管
肝脏
综述 | Journal of Hepatology | 肠-肝轴在肝病中的影响：治疗的病理生理基础
科研 | Gut ：自身免疫性肝炎中肠道菌群的改变(国人作品)
科研 | Hepatology：益生菌LGG通过抑制小鼠肝脏胆汁酸合成和促进胆汁酸排泄来预防肝纤维化
科研 | Nature：以肠道细菌为靶标的噬菌体可以减轻酒精性肝炎
Hepatology | 基于肠道微生物组、血液代谢组学以及肝脏转录组学分析导致肝脏脂肪变性的原因
科研 | Cell子刊：高产酒精肺炎克雷伯菌引发脂肪性肝病（国人作品）
科研 | Journal of Hepatology：肠道菌群驱动的肠道血管屏障破坏是非酒精性脂肪肝炎发展的先决条件
科研 | 南方医科大学珠江医院高毅：原发性肝癌不同分期的肠道菌群失调程度与预后的关系分析
综述 | 肠道微生物代谢产物对肥胖、NAFLD和T2DM的影响
综述 | Nature子刊：肥胖，NAFLD和T2DM中的肠道微生物代谢产物
Nature | 以肠道细菌为靶标的噬菌体或可缓解酒精性肝病
综述 | 肝脂肪变性背后的秘密组织——肠道微生物组、血浆代谢组和肝脏转录组
Cell子刊 | 人体内Roseburia Spp.菌属与饮酒相关，并且可以改善小鼠的酒精性脂肪肝疾病
Nature 子刊 | 肝移植后定殖的耐多药细菌和肠道微生物组的纵向演变
Gastroenterology | 多组学联合分析丙肝病毒感染对宿主的影响机制
肾脏
胰腺
科研 | Nature：18S和ITS测序揭示了真菌菌群通过激活MBL促进胰腺癌的发生
科研 | Gastroenterology：胰腺外分泌功能受损与肠道菌群组成和多样性的变化有关
心血管
Microbiome | 协和医学院张抒扬课题组：冠心病严重程度与肠道菌群相关
Gut：饮食中脂肪含量对肠道菌群和代谢物的影响及其与心血管代谢风险因素的关系（国人作品）
Circulation | 短链脂肪酸--丙酸盐预防高血压心血管损害
9 IBD
综述 | Cell：炎症性肠病的治疗机遇：宿主 - 微生物关系的机制解析
综述 | Nature ReviewsMicrobiology：炎症性肠病的微生物基因和途径
科研 | Nature子刊：炎症性肠病中肠道菌群结构及代谢活动变化
Advanced science ǀ一种基于肠道菌群及炎性环境干预炎症性肠病特定部位的促分解肽纳米疗法
科研 | Gastroenterology：IBD患者肿瘤坏死因子拮抗剂疗效影响肠道菌群代谢功能
科研 | Gut：瑞典IBD人群结肠镜检查结直肠癌的发生率和特点与非IBD人群的差异
Gut | 未发现瑞典随机人群中肠易激综合症患者的特征微生物群
10 抗生素&益生菌&粪便移植
抗生素
科研 | PNAS重磅：亚致死浓度抗生素对肠道菌群的破坏机制
科研 | Cell：抗生素驱动的肠道微生物群紊乱改变了人体对疫苗的免疫反应
科研 | Nature Microbiology：早期住院治疗和抗生素治疗对婴儿肠道菌群和耐药性影响的宏基因组特征
Cell | 抗生素驱动的肠道菌群紊乱改变了人体对疫苗的免疫
益生菌
科研 | 内蒙古农大张和平：口服复方益生菌改善犬的采食量、增重、免疫力和肠道菌群结构
科研 | PLoS Pathogens：解读大肠杆菌Nissle 1917的遗传毒性和益生菌活性之间的相互作用
粪便移植
科研 | EBioMedicine：在大鼠结肠炎模型中，单次粪便菌群移植可调节微生物组并改善其临床表现
科研 | Hepatology：小鼠肝硬化相关神经炎症依赖于肠道菌群作用并可通过粪菌移植得到缓解
Nature Medicine | 移植粪便菌群延长早衰小鼠的健康和寿命
11 动物肠道&瘤胃
动物肠道
Nature Microbiology | 核心肠道菌群是通过有益的相互作用和鱼类的菌株变异来维持的
科研 | Microbiome：从出生到市场的猪肠道微生物组的纵向研究揭示了与阶段和生长性能相关的细菌（国人作品）
The ISME Journal | 天然食物促使圈养啮齿类动物原生肠道微生物群的保留
华农郑金水等揭示了断奶仔猪微生物组对饮食转变的适应性，并通过metagenomicbinning建立宏基因组参考
Microbiome | 菌株水平揭示洄游大西洋鳕鱼肠道菌群
大熊猫的肠道菌群可能并没有特化出发酵纤维素的能力（国人作品）
Genome Biology | 恒河猴幼崽肠道微生物群的成熟及其在腹泻病发生中的作用
科研 | ISME：具有遗传变异谱的牛模型中宿主对早期肠道菌群的遗传效应
PNAS | 蜜蜂肠道菌群对植物多糖的消化如何进行分工？(国人作品)
瘤胃
科研 | 浙江大学王佳堃: 基于宏转录组学揭示湖羊瘤胃中新型纤维素酶
科研 | Science advance：瘤胃核心微生物群的一个可遗传的子集决定了奶牛的生产效率和排放
科研 |Microbiome：宿主遗传对牛瘤胃微生物菌群的影响及与饲料转化率相关的可遗传瘤胃微生物特征
EnvironmentalMicrobiology | 母乳喂养与人工饲养相比，对瘤胃微生物群具有较小的长期生理意义
Microbiome | 宿主遗传对牛瘤胃微生物群的影响及与饲料效率相关的可遗传瘤胃微生物特征
12 呼吸道&口腔&皮肤
呼吸道
科研 | Clinical InfectiousDiseases：呼吸道微生物群与流感病毒易感性的关系
BMC Biology | 健康人群与疾病人群上呼吸道的微生物组
Thorax | 早期鼻腔微生物群和生命初期急性呼吸道感染率的关系
口腔
JCLIN PERIODONTOL | 卢洪叶等：牙周炎维护期内的菌群变化情况（国人作品）
Microbiome| 牙菌斑和牙结石的微生物差异与口腔生物膜的成熟阶段有关
Journalof Alzheimer's Disease | 首次探究口腔微生物组在阿尔茨海默症发展中的意义（国人作品）
mSystems| 使用全长16S rRNA基因测序鉴定青年牙菌斑中的初始定居细菌
Microbiome| 化疗并发症（粘膜炎）与口腔细菌生态失调有关
皮肤
Nature 子刊 | 特应性皮炎和牛皮癣患者中的微生物与宿主之间的相互作用
13 其他
Nature| 剖宫产婴儿存在微生物群发育不良和机会致病菌定植
Trends in Ecology & Evolution | 生态回路：跨多营养相互作用的宿主微生物（国人作品）
综述 | Nature Immunology：微生物群对呼吸健康的影响
科研 | Science：描述健康和受损肠道微生物群发展的协变生态群稀疏网络
综述 | Nature Communications：一类广泛存在于人体肠道的拟杆菌肽毒素
科研 | Nature Medicine：防止新生小鼠肠道菌群失调可预防迟发性败血症
科研 | Nature Genetics：艰难梭菌形态形成过程中宿主传播周期的适应性
Nature | 肠道菌群-宿主作用新发现：基因组结构变异与健康疾病相关
科研 | AR：与强直性脊柱炎和类风湿性关节炎风险相关的人类白细胞抗原等位基因影响肠道微生物群
Nature Microbiology | 通过单细胞病毒标记来定义人类肠道宿主-噬菌体网络
Microbiome | 宏蛋白质组分析表明共生、竞争和噬菌体与宿主的相互作用形成了沼气厂的微生物群落
Microbiome | 肠道微生物群的重现性证实太空飞行期间微生物和宿主代谢有所转变
Science | 描述健康和受损人体肠道微生物群发育的稀疏共变单元
Science | 利用梭状芽胞杆菌去除宿主体内的微生物衍生分子
Microbiome | 感染急性HIV-1后肠道微生物组的演变
Gut | 真菌参与原发性硬化性胆管炎患者肠道微生物群的生态失调
科研 | 肠道微生物组是小鼠模型中全面防护急性砷中毒所必需的
NAT REV MICROBIOL | 传统社会和工业化社会的肠道微生物及其对人类健康的影响
Nature子刊 | 在厌氧肠道芯片上培养复杂人类肠道微生物群
综述：特定微生物丛模型在人肠道宿主-微生物间相互作用研究中的应用
Cell 子刊 | 用器官芯片揭示肠道微环境和机械力促进志贺氏菌感染