幼年特发性关节炎易感基因位点新发现
图片显示当前研究和先前免疫芯片研究中位于幼年特发性关节炎相关区域的基因产物之间的相互作用。实线表示直接的相互作用，其中两个分子之间有直接的物理接触。虚线表示间接交互。只有实验验证的相互作用会被展示，GWAS =全基因组关联研究。
供稿：贾园（北京大学第一医院 风湿免疫科）
美国辛辛那提大学的Laura A. McIntosh等人研究发现了幼年特发性关节炎（Juvenile idiopathic arthritis，JIA）的易感基因位点。
JIA是儿童时期最常见的风湿性疾病，与基因强相关。迄今为止，JIA的基因研究受有限的样本量、患者群体的异质性或只纳入候选区域的限制。
关节型JIA和IgM型RF阴性JIA的临床表现相似，都是JIA最常见的亚型。本研究是为了确定少关节型JIA和IgM型类风湿因子（rheumatoid factor，RF）阴性的多关节型JIA之间的关系。
研究人员运用Affymetrix全基因组SNP阵列6.0或Illumina HumanCoreExome-12+阵列，对包含2751名少关节型JIA和RF阴性的多关节型JIA患者在内的三个患者队列进行基因分型。总的来说，研究人员运用这些平台或Illumina HumanOmni2.5平台，对15866个当地和研究之外的对照进行相关性分析。在进行SNP相关性分析之前，用高质量的单核苷酸多态性（single-nucleotide polymorphisms，SNPs）对1000个基因组进行填补。
Meta分析显示出9个区域的相关性证据（P<1×10-6）：PRR9_LOR（P =5.12×10-8）、ILDR1_CD86（P = 6.73×10-8）、WDFY4（P = 1.79×10-7）、PTH1R （P = 1.87×10-7）、RNF215（P = 3.09×10-7）、AHI1_LINC00271 （P = 3.48×10-7）、JAK1 （P = 4.18×10-7）、LINC00951 （P = 5.80×10-7）及HBP1 （P = 7.29×10-7）。其中PRR9_LOR、ILDR1_CD86、RNF215、LINC00951和HBP1是第一次被显示出为自身免疫性疾病的易感性基因位点。此外，相关SNPs还包括WDFY4、CCDC12、MTP18、SF3A1、AHI1、COG5、HBP1和GPR22的顺式表达数量性状基因位点。
本研究提供了独有的JIA的风险基因位点及JIA与其它自身免疫性疾病重叠的风险基因位点的证据。这些新的相关SNPs能影响基因表达，并且它们的结合区域与免疫相关的分子通路关系密切。因此，它们可能代表了促成少关节型JIA和RF阴性的多关节型JIA发病的区域。
参考文献：Arthritis & Rheumatology 2017;69:2222-2232
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