单核苷酸多态性(SNP)是什么?

SNP(全称Single Nucleotide Polymorphisms)即单核苷酸多态性,主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异引起的DNA序列多态性,包括单个碱基的转换、颠换等。

  SNP作为第三代遗传标记,分布非常广泛,在遗传分析,疾病诊治,分子育种和种群生态评估等诸多领域有十分重要的意义。

  进行SNP检测的方法有很多,如直接测序法、taqman探针法、massarray法、芯片法、高分辨率熔解曲线法、KASP法等。

  如果要对tens or hundreds的SNP位点在hundreds or thousands样本中进行检测,比如临床上指导用药相关SNP的检测(伴随诊断)、科研中对有限数量SNP的相关研究、潜在诊疗疾病相关SNP的大量样本验证等等,那么我们推荐你使用——massarray法!

  massarray法是利用桌面式质谱仪来进行检测,具有检测成本低、周期短、灵活、实验操作和数据分析简单等特点,是中高通量靶点检测实验室的最佳选择。该技术目前已在全球范围内得到广泛应用,覆盖药物基因组学、遗传性疾病、肿瘤及液体活检、传染性疾病等各个领域。

(0)

相关推荐

  • SNP 对于 m6A 修饰的影响

    写在前面 之前的两天,我们介绍了关于预测 m6A 调控的数据库.关于 m6A 的调控和核苷酸序列的关系,其主要是通过识别 GGm6ACU 基序来进行调控的,所以影响基因序列发生变化了情况,就有可能m6 ...

  • NAR:SNPs如何用于检测疾病途径

    伊利诺伊大学Urrina ChanaPig的研究人员已经开发出一种新的计算工具,可以使用单核苷酸多态性来识别与疾病相关的途径,包括乳腺癌和前列腺癌.单核苷酸多态性是指人的DNA突变,是人类最常见的遗传 ...

  • lncRNASNP: LncRNA相关SNP突变数据库

    lncRNA中的SNP及其对lncRNA的影响怎么做?疾病中lncRNA的表达是什么? 这样的小问题,LncRNASNP大可爱都能解决. lncRNASNP的构建图 IncRNASNP 是提供人.小鼠 ...

  • 进展|终生低Lp(a)水平:基因开的绿灯?

    众所周知,脂蛋白a[Lp(a)]升高是动脉粥样硬化性心血管疾病(CVD)和主动脉瓣钙化狭窄的独立致病危险因素,Lp(a)持续升高的患者具有较高的CVD风险,而反义寡核苷酸(ASOs)已在早期的临床试验 ...

  • PrecisionMed_MassAR​RAY平台系统介绍

    最近由于个人情感问题很久没有更新微信号内容,实在是很抱歉!以后定会多写点技术平台介绍和单基因疾病诊断的介绍! 今天着重为大家介绍目前最最廉价的基因突变检测(SNP)技术---MassARRAY检测技术 ...

  • 单核苷酸多态性SNP

    NP主要指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性.与其他分子标记相比,SNP具有分辨率高.覆盖基因组范围大.遗传稳定等特点,广泛应用于群体遗传学研究和疾病相关基因的研究,在药物基因组 ...

  • 柳叶刀子刊| 中山大学第一附院罗俊航教授团队揭示了单核苷酸多态性特征对局部肾细胞癌复发的预测价值

    推荐:江舜尧 编译:莫沉 编辑:马莉 中山大学第一附属医院罗俊航教授团队于2019年3月14日在<Lancet Oncol>上发表题目为<Predictive value ofsin ...

  • 蔡清清教授团队首次创建基于单核苷酸多态性的预测模型指导NK/T细胞淋巴瘤患者精准预后判断和早期患者治疗决策

    结外鼻型NK/T细胞淋巴瘤(ENKTL)好发于亚洲及拉丁美洲,在我国占所有淋巴瘤病例的15-30%.ENKTL临床表现及预后具有明显异质性,当前预后评价系统多基于临床及病理特征,而基于临床分期制定的治 ...

  • 人MTHFR基因多态性检测试剂盒(荧光PCR法)简介

    产品介绍 [注册证编号]:国械注准20173403239 [产品规格]:30人份/盒 [存储条件]:1.-20±3℃避光保存,有效期10个月 2.试剂盒在-16℃~8℃的温度范围内运输,运输时间不超过 ...

  • SNP你到底叫啥名?

    我叫林平之,是莫愁师姐的师弟.我最近遇到的问题是--CYP2D6*10这个是什么鬼.虽然我知道是一个SNP位点,但有的文献里讲CYP2D6*10这个位点是100C>T,也有的说是C188T,还有 ...

  • 如何从vcf文件中批量提取一系列基因的SNP位点?

    需求 客户的一个简单需求: 我有一批功能基因位点,想从重测序的群体材料中找到这些位点,如何批量快速获得? 示例文件 gene.txt image.png test.vcf image.png 代码实现 ...

  • SNP芯片的原理

    如果基因组上这个位点,是CGCT和AGCT的杂合子,那么AGCT就会被切断,而CGCT保持完整.在后面与探针的杂交过程当中,保持完整长链的链,可以杂交到探针上去,而被切断链,它与探针杂交的序列就变短了 ...

  • STR or SNP? 傻傻分不清楚

    2019-06-28 13:36:51 上一次的[源基因小课堂]给大家介绍了单倍群的正确打开方式 在第二堂课里 我们来讲讲人类基因组的两种遗传标记 STR与SNP STR和SNP各表示什么意思? 两者 ...

  • 科研 | INT J MOL SCI:比较转录组学研究揭示兰花颜色多态性(国人作品)

    编译:刘宁,编辑:十九.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 植物的颜色变化与适应性进化相关,兰花属Pleione具有各种各样的花色,但是其颜色形成及进化机制尚未得到解析.本文选择中国四川省黄龙市 ...