Nature：KRAS药物进入“爆发期”，5款产品开展人体试验
癌蛋白KRAS的突变发生于约25%的癌症病例中，且与极差的疾病预后有关，因此，科学家们认为，阻断KRAS信号是一种潜在的抗癌途径。然而，先前几十年的研究证明，该蛋白可能是一种“无成药性”的靶点，因为，它的表面除了一个GTP结合口袋，其它部分非常光滑，因此，药物研发人员很难在其表面找到小分子候选药物的“立足点”（结合口袋）。
不过，大约在10年前，研究人员发现，KRAS实际上比想象得更具靶向性，这使得研发靶向KRAS的药物取得了突破性的进展。如表1所示，至少有5种KRAS调节剂处于临床开发阶段。其中，AMG 510、MRTX849以及JNJ‑74699157/ARS-3248这三种候选药物仅靶向KRAS的G12C突变体（KRAS-G12C），而BI 1701963（通过与SOS1结合来抑制KRAS）和mRNA-5671（靶向KRAS蛋白的一种癌症疫苗）有着不同的作用机制，可能在更广泛的人群中发挥作用。
一、KRAS-G12C抑制剂
总体来说，KRAS抑制剂的进展与业界对“通过共价相互作用与靶点结合的小分子药物”的兴趣的提升紧密相关。先前很长一段时间，药物研发人员一直避免使用共价结合剂，因为他们担心这种混杂且不可逆的结合可能产生脱靶毒性。然而，随着EGFR抑制剂afatinib、BTK抑制剂ibrutinib等候选药物证实这种毒性是可控的，许多公司也开始探索这种共价结合剂是否也能适用于其它靶点。
加州大学旧金山分校的化学生物学家Kevan Shoka很早就发现了开发KRAS共价结合剂的可能性。因为，他们发现，KRAS-G12C突变体的特征是新引入一个半胱氨酸，而这种亲核氨基酸很容易形成共价键，如果一类小分子可共价结合KRAS-G12C突变体中的半胱氨酸，那么，它们就有望用于治疗携带这类KRAS突变的患者。
2013年，在一篇Nature论文中[1]，Shokat首次报道了利用小分子共价结合KRAS-G12C突变体的可行性（为了获得这类分子，其团队坚持了6年的筛选）。通过晶体学分析，Shokat等发现，共价化合物可与KRAS上先前未被发现的“开关-II口袋”（switch-II pocket）结合。
三大候选药物
这一发现立即引起了轰动。之后，Shokat与人联合创办的Araxes Pharma的子公司Wellspring Biosciences证实，Shokat所鉴定的这一化合物的改良版本可缩小被移植了携带KRAS-G12C突变的人类肿瘤的小鼠的肿瘤。不久后，Araxes与强生旗下的Janssen达成合作，致力于将这一候选药物（前文提到的JNJ‑74699157/ARS-3248）推进临床试验。
在Araxes取得进展的同时，制药巨头Amgen也有了重要收获。通过与Carmot Therapeutics合作，他们很早就发现，一些共价结合化合物甚至可以打开“开关-II口袋”的“盖子”（lid）上的一个“神秘口袋”。
“这是我们的一个关键发现。打开这一神秘口袋可能为候选分子带来更多潜在的结合位点。”Amgen研究副总裁Margaret Chu-Moyer说。（2017年，Shokat及其同事在Cell Chemical Biology杂志上报道了他们发现的同一个“神秘口袋”[2]）
2018年8月，Amgen首个KRAS-G12C抑制剂（AMG510）进入临床研究，几个月后（2019年1月），竞争对手Mirati Therapeutics的KRAS-G12C抑制剂MRTX849也开始人体试验，Araxes和Janssen的JNJ-74699157在今年7月紧随其后。
Amgen公司不久前（9月）在ESMO上公布了AMG 510 I/II试验的初步数据。13例接受AMG 510治疗的NSCLC患者中，有7例（54%）患者获得了部分缓解，肿瘤体积变小；其他6例患者接受治疗后病情稳定。此外，患者似乎对AMG 510耐受良好，迄今为止未显示剂量限制毒性。目前，多例患者已经接受AMG 510治疗超过6个月。
Amgen肿瘤开发负责人Greg Friberg认为，由于参与该试验的NSCLC患者病情都已恶化，且AMG 510平均是他们的四线治疗，因此，这些初步数据提示，这一KRAS-G12C抑制剂响应持久性良好。
不过，Amgen针对结直肠癌患者的试验的早期结果不算“亮眼”。12例接受治疗的患者仅1例(8%)部分缓解，剩余10例患者病情稳定。Friberg表示，不同癌种中AMG 510疗效的差异可能反应了在不同疾病中，KRAS-G12C通路起着略微不同的作用。
Mirati公司在10月于AACR-NCI-EORTC会议以及Cancer Discovery杂志上[3]公布了MRTX849相关的数据。6例可评估的NSCLC患者中，3例(50%)达部分缓解；4例结直肠癌患者中，1例(25%)达部分缓解。
联合治疗
除了单药治疗，开发者们也已在研究基于KRAS-G12C抑制剂的联合治疗。比如，安进正在研究AMG 510与PD-1抗体pembrolizumab的联合。在10月30日发表于Nature上的一篇论文中[4]，相关研究者证实，10只接受这种联合策略治疗的小鼠中有9只肿瘤永久消失了。此外，被“AMG 510+pembrolizumab”治愈的小鼠之后还拥有了排斥KRAS-G12D肿瘤的能力，表明这种联合治疗可能会驱动一种获得性免疫反应。
目前，Amgen已经在NSCLC患者中测试这一联合治疗策略，且计划在今年年底在结直肠癌患者中进行测试。Mirati也计划将MRTX849与pembrolizumab联用。
除PD-1抗体，SHP2抑制剂是KRAS-G12C抑制剂开发商为它们寻找的另一“联合伙伴”。SHP2是一种磷酸酶，与KRAS的激活-失活机制有关。本月初，安进刚刚与一家名为Revolution Medicines的公司达成合作，获得其实验性SHP2抑制剂RMC-4630，不过，调查“AMG 510+ RMC-4630”的试验何时开始尚未披露。Mirati此前已与诺华达成合作，开发“SHP2抑制剂TNO155+ MRTX849”组合疗法，相关I/II期试验计划在2020年进行。
其它在研的组合策略包括“KRAS-G12C抑制剂+CDK4抑制剂”。利用全基因组CRISPR干扰筛选，Shokat团队最近发现，当KRAS被抑制时，CDK4是那些对细胞生存至关重要的基因之一。他希望，调查这一组合策略的试验尽快开始。
二、靶向其它KRAS突变体
除了KRAS-G12C抑制剂，业界在开发针对其它KRAS突变的药物方面也取得了重要进展。其中，名为Moderna Therapeutics的公司正在与默沙东合作，开发一种mRNA癌症疫苗（表1及前文提到的mRNA-5671），使其能够在体内制造抗原，以启动T细胞寻找和破坏表达四种关键KRAS突变体（G12C、G12D、G12V和G13C）的细胞。
在一项I期试验中，Moderna和默沙东正在携带KRAS突变或转移性的NSCLC、结直肠癌或胰腺癌患者中测试mRNA-5671单药治疗和“mRNA-5671+ pembrolizumab联合治疗”的潜力。
此外，如表1所示，Mirati 计划于2020年开展向FDA递交G12D抑制剂 IND申请所需的研究。
三、间接抑制KRAS
针对泛KRAS（pan-KRAS）的药物在近期也取得了令人兴奋的进展。10月末，勃林格殷格翰（BI）宣布，其首个泛KRAS抑制剂BI1701963进入临床开发阶段。BI1701963靶向的是SOS1蛋白，该蛋白可促进KRAS的激活。临床前研究表明，这种高度特异性的SOS1抑制剂可降低细胞和动物模型中KRAS-GTP水平和MAPK信号。所有的早期迹象均表明，BI1701963对KRAS激活突变有广泛的抑制作用。
“与KRAS-G12C抑制剂不同，SOS1抑制剂类化合物阻断的是SOS1-KRAS的相互作用，因而与KRAS是何种突变无关。”BI癌症研究负责人Norbert Kraut解释道。
不过，BI已发现，SOS1抑制剂单药治疗效果并不突出，只能让肿瘤“停滞”，而不能杀伤肿瘤。为了获得肿瘤细胞杀死活性，他们必须将BI1701963与MEK抑制剂（trametinib）联合使用。公司期望，这种联合策略可提高疗效，并潜在的延缓适应性耐药的出现。
除BI外，今年2月，在一篇PNAS论文中[5], 拜耳也宣布，其发现了一款选择性抑制KRAS-SOS1相互作用的SOS1结合物。据称，公司正在研发SOS1抑制剂，但尚未公布任何研发时间表。
四、未来其它可能性
最后，值得一提的是，除间接抑制KRAS的SOS1抑制剂BI1701963外，BI手中还有另一款与KRAS上被新鉴定出的口袋——开关I/II口袋（switch I/II pocket）[6]结合的小分子BI-2852。研究表明，这一新发现的口袋有望为阻断KRAS与其所有“激活伙伴”（activating partners）、效应蛋白和失活蛋白的相互作用带来可能。BI正在积极推进结合这一口袋的化合物的研发。
鉴于过去几十年制药界对靶向KRAS的强烈渴望，相信这些新口袋的发现将进一步助长KRAS药物的研发热潮。
小结
相关论文：
[1] Jonathan M. Ostrem et al. K-Ras(G12C)inhibitors allosterically control GTP affinity and effector interactions. Nature（2013）.
[2] Daniel R. Gentile et al. Ras Binder Induces a Modified Switch-II Pocket in GTP and GDP States. Cell Chemical Biology(2017).
[3] James G. Christensen et al. The KRASG12C Inhibitor, MRTX849, Provides Insight Toward Therapeutic Susceptibility of KRAS Mutant Cancers in Mouse Models and Patients. Cancer Discovery(2019).
[4] Jude Canon et al. The clinical KRAS(G12C) inhibitor AMG 510 drives anti-tumour immunity. Nature（2019）.
[5] Roman C. Hillig et al. Discovery of potent SOS1 inhibitors that block RAS activation via disruption of the RAS–SOS1interaction. PNAS(2019).
[6] Dirk Kessler et al. Drugging anundruggable pocket on KRAS. PNAS(2019).
参考资料：
1# Cracking KRAS（来源：Nature Reviews Drug Discovery）
2# KRAS抑制剂频获突破，“不可成药”靶点将成为历史？（来源：药明康德）
3# 勃林格殷格翰将首个泛KRAS抑制剂BI1701963推进至临床试验阶段，中国将参与全球早期同步开发（来源：医药魔方）
4# Nature里程碑：KRAS抑制剂+PD-1，治愈肿瘤有希望（来源：医药魔方Pro）
新靶点
NKG2A | GARP | CD22 | LIF | CDK2 | WWP1 | VCAM1 | Flower | CD24 | Gingipains | DES1 | GPR139 | DHX37 | CXCL10-CXCR3轴 | 628个靶点 | CA19-9 | PTPN2
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