TCMSP中药有效成分分析(来源:生信自学网 作者:乐伟 )

时间:2019-07-30  来源:生信自学网   作者:乐伟

基本概念:
生物利用度(OB):是指制剂中药物被吸收进入人体循环的速度与程度。生物利用度是反映所给药物进入人体循环的药量比例,它描述口服口服药物由胃肠吸收,及经过肝脏而达到体循环血液中的药量占口服剂量的百分比。包括生物利用程度与生物利用速度。
类药性(DL):指化合物与已知药物的相似性。具有类药性的化合物并不是药物,但是具有成为药物的可能,这一类化合物称为类药性分子或药物类似物分子。

数据库:
TCMSP数据库
分析药物:黄连(huanglian)
操作步骤:
1、进入TCMSP数据库官网
网址:http://lsp.nwu.edu.cn/tcmsp.php
2、在搜索框输入需要需要分析的药物,比如我们输入huanglian,然后点击搜索

3、进入搜索结果页面,在结果页面找到最相关的药物

4、进入数据结果页面,我们可以看到,数据有很多列,这些指标,可以根据自己的分析去删选,现在一般的分析主要用OB和DL两个作为删选条件,当然大家可以自己设定条件。

OB>30

DL>0.18

5、删选之后我们就得到了我们需要的结果,接下来,我们把这些数据条目复制下来,新建一个txt文件,把复制的数据粘帖到新建的txt文件。在整理这个txt文件需要注意:把得到的文件拖到excel里面,看下文件是不是分好列了,如果发现你的文件只有一列,那么说明有错误,需要换个浏览器重新操作,直到了得到下图表格形式,我们试过,一般搜狗和遨游浏览器可以得到正确的结果,当然每个人的情况不同,需要根据实际情况更换自己的浏览器操作。

经过这些操作,我们就得到了中药的有效成分的文件,可以用于后续其他分析。后面我们会给大家讲解其他操作,欢迎关注生信自学网,当然也可以直接购买《中药复方网络药理学》的课程,学习更多的操作,购买课程提供课程代码、答疑。

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