新格元邱匀彦:从半导体转向生物科技,基于高通量单细胞测序平台革新精准医疗
高通量单细胞测序是指从单个细胞的水平上对成千上万个细胞中的遗传物质进行测序,从而识别样本中的细胞的类型、功能,特定细胞健康或状态的变化。单细胞测序不仅能够分析相同类型细胞的异质性,还能获取珍贵的临床样本不同类型细胞的精准遗传信息,在科研、临床以及药物研发市场有广阔前景。
高通量单细胞分析技术最早出现于2015年,之后得到了迅猛发展。2017年10月,“人类细胞图谱计划(Human Cell Atlas,HCA)”正式公布,致力于描述一个健康人体的所有人类细胞的参考图谱,是高通量单细胞研究产业化的里程碑。同在2017年,美国的10X Genomics和BD医疗的单细胞测序微流控系统相继推出并立即被广泛应用于科研领域。此时,初露锋芒的单细胞测序领域,引起了邱匀彦的兴趣。
邱匀彦是台湾大学生物机电工程硕士,致力于研究生物传感器,毕业后进入台积电工作。他判断:“单细胞技术及生物芯片大有可为。生物芯片虽然不如半导体芯片大众,但是一个非常前沿、快速增长,且更能发挥自身价值的方向。”刚好2018年新格元成立,向邱匀彦抛出了橄榄枝。
“几番接触下来,我非常认可的新格元的发展方向、领导思维、团队氛围,专业技术也对口。”因此,在兴趣和行业风向驱使下,邱匀彦鼓起勇气离开台积电,转行进入并不熟悉生物科技领域,担任新格元工程总监,从事微流控芯片的设计研究,以及开发从样本处理到单细胞建库的自动化解决方案。
同时,邱匀彦也见证了新格元从初创时10个人的规模,到现在国内单细胞行业佼佼者的地位。2018年成立后,新格元把从耶鲁大学获得独家专利授权的技术从实验室状态开发成商业化产品,并率先推出了国内第一,全球第三个成熟商业化单细胞测序平台。
继10X Genomics、BD之后,
全球第三个成熟商业化单细胞测序平台
由于国内单细胞市场起步较晚,10X Genomics、BD等国外企业掌握关键核心技术,国内主流的单细胞测序平台和试剂大多依赖进口,国内大部分企业以开展测序服务或是代理国外产品为主,行业内极度欠缺具有自主核心技术的国产单细胞测序平台。
邱匀彦认为:“关键技术'卡脖子’是痛点,也蕴藏着巨大的市场机会。”单细胞测序平台门槛较高,需要整合微流控、自动化、生化试剂开发、软件开发等多种技能。新格元以开发国产单细胞测序平台为使命,组建起了一支对临床应用市场有着敏锐触觉的市场和研发团队,配置了完善的工程师团队、生信研发团队,以及试剂开发和生产团队,快速完成了国内首个单细胞测序平台的开发及商业化,成为了继10X Genomics、Becton Dickinson之后,第三家拥有成熟商业化高通量单细胞测序平台的公司。
据了解,新格元的单细胞测序平台能够提供从组织样本处理,高通量单细胞分离及测序文库构建,到数据分析和临床意义挖掘的全面解决方案,各项性能指标均与国际领先产品持平。
目前,新格元开发的单细胞测序平台已经在基础科研市场上有了广泛的应用,在药物研发方向也展示出了巨大潜力。其中,在单细胞应用最火热的科研市场,该平台已经获得了海内外700余名用户的肯定,发表了大量科研论文和成果。在药物研发市场,找到有效新靶点及提高药物开发效率是药企的普遍需求。新格元从2018年开始搭建单细胞数据库,同时陆续推出了单细胞层面解析转录组、免疫组、免疫组、突变、转录组功能变化等单细胞多组学产品,已和晶泰科技、君实生物等达成合作,为创新药开发和临床实验工作提供了有力的支持。
专注自动化、标准化,
加速单细胞测序临床转化
很显然,与科研市场和药物研发市场相比,广阔的临床市场是一片更有吸引力的星辰大海。
在临床诊断中,精准全面的生物标志物对患者准确分型、治疗方案选择,甚至患者生命决策都有重要指导意义。单细胞测序既能够及时、精准地对病人进行检测,还能够发现传统病理方法无法发现的作用机制与标志物,为新适应证发现提供治疗效果与安全性证据。单细胞测序对于肿瘤或其它疾病病灶的评估是多维的,从细胞类型结构、细胞表型与基因型的内在关联、细胞通路功能活性状态、细胞间通讯作用等各方面去寻找病灶组织的细胞与转录特征。以此为基础进行药物靶点评估,以及从中发现的生物标志物,对于病灶组织特征的刻画更为全面且精准。
近年国内精准医疗市场快速发展,让新格元看到了单细胞技术在国内临床市场的潜力和发展空间。邱匀彦表示:“单细胞测序临床转化的关键壁垒在于自动化和标准化。”自成立之初,新格元就专注于单细胞技术在临床中的应用,邱匀彦正在带领团队开发从样本处理到单细胞建库的自动化解决方案,满足临床转化需求。目前新格元已经推出单细胞建库自动化仪器Matrix,自动化组织解离仪Python即将正式发布。
邱匀彦认为,在10X Genomics占据市场主导地位的情况下,临床转化将是中国企业赶超国外企业的机会点之一。“例如,我认为国内企业在全流程解决方案、自动化和灵活性、数据精准处理解决等方面将很快赶超国外,快速推动单细胞技术在临床落地。”
与邱匀彦此前的预料一致,高通量单细胞测序在2020年和2021年获得了空前关注。谈及未来,邱匀彦表示:“未来,单细胞技术在多组学和空间组学的发展值得我们关注,在应用场景上,从科研市场到药物研发、临床诊断再到健康管理已是大势所趋。在单细胞测序朝阳赛道上,新格元将围绕单细胞测序平台持续开发创新技术,完善产品布局,打造国际领先的单细胞测序平台。”
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