非生物胁迫和植物激素刺激下锌指基序相关同源域家族基因及其表达谱的全基因组分析

Genome-wide analysis of zinc finger motif-associated homeodomain (ZF-HD) family genes and their expression profiles under abiotic stresses and phytohormones stimuli in tea plants (Camellia sinensis)

非生物胁迫和植物激素刺激下锌指基序相关同源域家族基因及其表达谱的全基因组分析

*Scientia Horticulturae

在植物中，锌指基序相关的同源结构域（ZF-HD）转录因子（TFs）在发育过程和应激反应中起着不可或缺的作用。但是，人们对ZF-HD基因家族成员在茶树（Camellia sinensis）中的特定功能了解甚少。我们以全基因组规模鉴定了茶中的18个CsZF-HD基因。这些基因在系统发育上分为两个主要的亚科：ZF-HD和MIF。基因结构分析表明18个成员中有13个没有内含子。转录组数据分析揭示了不同组织中CsZF-HD基因的时空表达模式。在顺式作用元件分析的基础上，我们检测了在各种非生物和植物激素处理（干旱，寒冷，外源SA，MeJA，ABA和GA3）下CsZF-HD基因的表达模式。实时定量聚合酶链反应（qRT-PCR）分析证实了CsZF-HDs在多种胁迫和植物激素处理下的差异表达。预测和研究调节CsZF-HD基因的miRNA及其内源性靶标模拟物（eTM）。在水杨酸处理下，CsZF-HD10和csn-miR172b-5p-3的表达模式完全相反。在大多数顺序中，我们还检测到水杨酸处理下csn-miR2673a和CsZF-HD15之间，脱落酸处理下csn-miR399a-5和CsZF-HD9之间以及茉莉酸甲酯处理下csn-miR2673a和CsZF-HD3之间负调控关系。阶段。结果表明，csn-miR2673a的预测eTM（LTCONS-00,013,981）可能通过在水杨酸处理下引诱相关miRNA来间接调节CsZF-HD表达。总之，这些结果为进一步研究CsZF-HDs的生物学功能奠定了基础。