万能神器CytoScape里的这个插件，可以教你用明星分子活生生钓出一条通路来……

要从已有的差异基因（DEGs）所组成的Network里，找出可能研究的课题，这个其实并不难

，只需要你明白，你要研究的方向是什么，下游的明星基因需要研究的是什么？那就需要这样的工具了：

胡椒~这个也是CytoScape的一个App

：

和昨天的路径连接器不一样的是，

胡椒是通过引入一个明星分子作为钓饵（Bait）来分析已知的Network与其的关系的：

操作起来还是很方便的，

首先输入一个从STRING上做好的Network图：

然后用细胞胡巴（前几天刚讲过），来找出一其中的关键分子，因为庞大的DEGs中，只有处于关键位置，

也就是度中心性和介数中心性较高的基因（不要再问我啥是介数中心性了哈，这个之前专门给你们讲过，平时不看怪谁呢），才有可能是起到作用的关键基因：

接着调出“胡椒”，选择需要分析的Bait，也就是钓饵

，这个我就随便写了个TP53：

然后把关键基因，

都选择为下游需要连接的蛋白Nodes。

点击分析

，就会出结果了：

绿色的边（Edge）代表了原有的Network中的边（Edge），红色的边（Edge）代表的是Bait引入的Network

。按照关系的远近，以及引入情况，可以进行整合：

差不多结果图就是这样的

：

可以看得出来TP53可能会通过这三个蛋白（六边形的

），对原有的Network起到了调控作用。

你选择的Network中Node多一点的话，

形成最后的结果也会很多很复杂，再用3D插件整个活，就会变成这样：

所以在最初的过程中，需要选择尽量少的HubGene

，才能更好地分析结果，好了，有兴趣就自己去试试吧。想要知道啥是胡椒的话，可以自己去CytoScape上下搜一下。或者在评论区进行评论，就发给你们地址。实在不行就回复“公克”（不要在评论区回复

），要么就直接星球上见（当然，进不去也无所谓

）。好吧，今天就先给你们策到这里吧，祝你们心明

眼亮

。

封面：乡村爱情   https://pic.sogou.com/

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