师姐真传的一些RNA抽提技巧(TRIzol法)

1、使用前防范:TRIzol剧毒且易挥发(由于主要成分是苯酚),氯仿呢也是一种有毒也易挥发的试剂,有的小盆友为了防止氧化,还会加入β巯基乙醇,这个反正建议有鼻子的童鞋都做好防护。提取RNA前做好保护措施,最好在通风厨中操作,所有接触TRIzol的耗材,最好扔到专门的密封的桶中,等待处理。否则整个实验室都会弥漫着气味,师兄师姐会打死你的!

2、必备前奏:所有耗材(枪头、EP管)均经过RNA酶灭活或者直接购买无RNA酶的耗材,除RNA酶主要方法是用DEPC水浸泡48小时(DEPC虽然味道香,但却是强致癌的,泡管子的时候别一直去闻它,一般来说煮沸或高温高压灭菌15min后,DEPC就会降解成二氧化碳和水)。顺便说一句,其实我们以前也曾经试过,湿热灭菌两次,也可以有效降低RNase,当然这是偷懒的办法啦。操作前戴口罩,你的唾沫星子是最大的RNA酶来源。

3、RNA非常容易降解,所有步骤尽量在冰盒里面操作,包括离心时需用4度预冷的离心机。根据说明书,非特别注明,所有程序均在15-30度下进行,试剂也放置于15-30度,但是都不是温度计的大家,还是放在冰盒上靠谱点。

4、1-5×10^7细胞或者50-100mg组织加入1ml TRIzol,细胞或者组织过多,TRIzol过少会导致裂解不充分,内源性RNA酶抑制不完全,导致RNA降解。

5、TRIzol加入细胞后,反复吹打,充分裂解细胞至均一透亮,不粘稠为止。

6、加入氯仿后充分混匀,其实这步也不能过于剧烈,上层的水相含有RNA,中间的组织相含有DNA和蛋白质,剩余的一部分DNA会萃取到氯仿中,同时氯仿具有使蛋白质变性的作用,离心完,中间那层就是组织层。

7、离心后,溶液分层,上层为含有RNA的水相,中间层乳白色的为含有部分DNA、蛋白质的组织层,下层红色的为含有DNA和部分蛋白质的氯仿, 此时,注意,“宁少勿多”,提取上层无色液体时,小心轻柔,可以用200ul的枪抽吸,一般1ml的TRIzol时最多可以提取500ml上清,但是建议提取400ul以下,千万避免吸到中间的乳白色组织层,否则最后测量RNA时,OD260/280非常低,会有蛋白混入。

8、异丙醇加入的目的是为了使RNA沉淀,此时RNA已经提出来了,应轻轻混匀,避免RNA损伤。离心后肉眼可见EP管底部白色羽毛状沉淀即为RNA沉淀,后面洗涤等操作均应该注意,切勿将白色沉淀给倒掉,否则你就白提了。

9、75%乙醇加入的目的是为了洗涤和沉淀作用,也应该轻柔。

10、最后晾干乙醇时应尽量充分晾干,先用枪头尽量把75%乙醇吸干,再晾5min,否则没有晾干乙醇,加入DEPC水时可能导致RNA白色沉淀不溶解。

11、加入DEPC水溶解RNA时,可根据自己需要的浓度来调整加入DEPC水的量。

12、纯的RNA的OD260/280为2.0,比值在1.8~2.0为较好结果,<1.8提示有蛋白蛋白参杂,>2.0说明RNA有降解。

13、RNA提取后可以跑琼脂糖胶来判断降解情况,纯的无降解的RNA跑完琼脂糖胶后应该有3条带,26S,18S, 5S。其中5S很淡,不容易看见。如果条带很淡,且有拖尾现象,提示有RNA降解。

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