一作解读|中国春-欧山羊草5M附加系探究
将野生近缘植物中的优异基因导入普通小麦是拓宽小麦遗传基础、改良小麦的有效途径之一。欧山羊草Ae. biuncialis(2n = 4x = 28, UUMM)生长在高温和高光照的地中海和西亚地区,携带抗病、抗旱、耐盐等诸多可供小麦遗传改良的优异基因。Molnár-Láng等团队创制了一系列小麦-欧山羊草二体附加系。但是,关于欧山羊草特异分子标记的开发鲜有报导。
本课题组前期创制了一系列中国春-欧山羊草衍生系材料。本研究对其中一个株系WA317进行了分子细胞遗传学鉴定。利用欧山羊草DNA做探针,中国春DNA为封阻,对WA317进行GISH鉴定。结果表明,WA317含有44条染色体,包含1对完整外源染色体(红色杂交信号)和42条小麦染色体(由DAPI复染为蓝色)(图1a,c)。因此,WA317是一个遗传稳定的小麦-欧山羊草二体异附加系。
图1小麦-欧山羊草5Mb附加系染色体鉴定
利用探针Oligo-pAs1.0(或Oligo-pTa535)和Oligo-pSc119.2对WA317中外源染色体和小麦染色体进行FISH鉴定。当以Oligo-pAs1.0(红色)和Oligo-pSc119.2(绿色)进行FISH鉴定时,附加的外源染色体短臂上均含有二者杂交信号(图1b);当以Oligo-pTa535和Oligo-pSc119.2进行FISH鉴定时,附加的外源染色体同样含有Oligo-pSc119.2的杂交信号(图1d)。
为了进一步确定WA317中外源染色体的遗传成分,以小伞山羊草(UU)和卵穗山羊草(MM)DNA作为探针,四倍体小麦(AABB)作为封阻(1:30),对其进行mcGISH鉴定(图2)。结果表明,WA317中附加染色体属于M基因组。根据Wanget al(2013)发表的欧山羊草FISH模型,在7条Mb染色体中,WA317中外源染色体的FISH探针杂交信号以及长短臂臂比非常接近于5Mb染色体。因此,WA317是小麦-欧山羊草5Mb二体异附加系。
图2 以小伞山羊草(UU)和卵穗山羊草(MM)DNA作为探针,对欧山羊草(a)和小麦-欧山羊草5Mb附加系WA317(b)根尖有丝分裂染色体mcGISH鉴定。a 欧山羊草,U和M组染色体分别为绿色和红色;b WA317,外源染色体为红色,小麦染色体为蓝色。
利用简化基因组测序技术,对欧山羊草株系Y17进行测序,获得的序列与中国春序列进行比对,将同源性小于50%的序列用于开发欧山羊草特异分子标记。目前,共设计600对引物,其中242对具有欧山羊草特异扩增带型,筛选效率为40.33%。为了进一步将这些特异标记定位到M和U基因组上,242个特异标记对欧山羊草Y17(UUMM)、小伞山羊草Y139(UU)、卵穗山羊草Y258(MM)和阴性对照中国春进行扩增(表1)。242个标记可以扩增298种带型,分为4种类型:U和M共有带型(172个)、U特异扩增带型(6个)、M特异扩增带型(102个)和Y17特异扩增带型(18个)。另外,这242个标记对5M附加系WA317进行扩增,45个标记具有特异扩增条带,为5M特异分子标记。本文开发的欧山羊草特异分子标记,可以用于小麦背景下欧山羊草及U和M基因组染色体的追踪与鉴定。
Table1. Detection of Ae. biuncialis accessions and line WA317 using Ae.biuncialis SLAF markers.
图3 欧山羊草特异分子标记电泳条带及分类
与中国春相比,小麦-欧山羊草5M二体附加系WA317在植株发育后期,穗部颖壳逐渐变为褐色,且较难脱粒(图4),说明5M染色体携带有与颖壳发育相关的基因。
图4 中国春(左)小麦-欧山羊草5Mb二体附加系WA317(右)植株与穗部形态
2020年6月5日,这一研究成果在线发表在International Journal of Molecular Sciences上(https://doi.org/10.3390/ijms21114053),论文题目为“Molecular cytogenetic identification of wheat–Aegilopsbiuncialis 5Mb disomic addition line with tenacious and black glumes”。论文第一作者是宋利强和赵慧博士,李俊明研究员是该论文的通讯作者。该研究得到了国家自然科学基因项目、国家重点研发计划项目、河北省科技厅优秀青年基金项目的资助。