非编码RNA数据库,你知道多少?
在介绍非编码RNA数据库之前,我们首先来看一下非编码RNA是什么?非编码RNA是指不编码蛋白质的RNA基因或者基因产物,比较早发现的非编码RNA是tRNA、rRNA。目前研究比较多的非编码RNA主要有miRNA,lncRNA, snoRNA, eRNA, piRNA。接下来,我们看一下这些非编码RNA数据库:
1、miRBase数据库
miRBase数据库是目前研究miRNA使用比较多的数据库,这个数据库网址:http://www.mirbase.org/
2、NONCODE数据库
NONCODE数据库是整合型的非编RNA数据库,其中收录lncRNA比较全,但是不收录tRNA和rRNAs,这个数据库的网址:http://www.noncode.org/
3、CircBase数据库
CirBase数据库是收录环状RNA的数据库,是目前研究使用比较多的数据库,这个数据库的网址:http://www.circbase.org/
4、snoRNAdb数据库
snoRNAdb数据库是一个收录snoRNA的数据库,这个数据库的网址:https://www-snorna.biotoul.fr/
5、RNAcentral
RNAcentral是一个主要收录非编码RNA序列的数据库,这个数据库的网址:http://rnacentral.org/
6、starBase
starBase是一个提供不同RNA以及蛋白间的互作关系的数据库,这个数据库的网址:http://starbase.sysu.edu.cn/
如果大家会用这些数据库,可以收藏一下这些数据库。
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