【Meta分析】New PubMed数据库检索方法全面攻略

系统评价/Meta分析指全面收集所有相关研究并逐个进行严格评价和分析，再用定性或定量合成的方法对资料进行处理得出综合结论的研究方法。在指导学员的过程中发现初学者在学习过程中常常会碰到许多共性问题，本公众号特此开设专栏解答，希望能够和大家共同学习交流Meta分析，共同成长，如有不当之处，还请大家批评指正。本期我们分享的新版PubMed数据库的检索方法。

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概述

昨日我们向大家介绍了【文献检索】PubMed数据库界面更新，检索方式有何变化？由于网页原因并未完整展示,因此特作补充。同时我们也找到了New PubMed的官方更新介绍,首先我们来看PubMed更新了什么?
  • 在结果页面上的摘要中预览摘要:在结果展示界面点击设置按钮,然后选择Abstract,可以看到检索结果以摘要形式展示,显示了非常全面的信息
  • 翻页浏览摘要:点击标题进入页面详情之后,可以看到在两边出现了PREV RESULT和NEXT RESULT,可以直接对搜索结果进行翻页
  • 使用侧边栏浏览记录:侧边栏除了原先的过滤器之外还新增了RESULTS BY YEAR,可以移动两个小圆点对文献发表的年份进行限制
  • 以您喜欢的格式引用:PubMed支持直接引用格式,点击Cite,可出现引用的结果并支持AMA,MLA,APA,NLM的格式,同时也可下载ris格式导入文献管理软件。
  • 通过社交媒体或永久链接分享:点击Share,支持分享至Facebook和twitter,以及复制文章链接.
  • 最多显示5个外部工具图标:全文链接将支持最多5个图标,满足可能获取全文的需要
  • 通过移动设备访问所有内容:可使用手机访问PubMed数据库,并实现适配
那么PubMed更新后旧版的还能用吗?
目前来看,PubMed新版和旧版可以共存,只要选择相应的网址即可:PubMed更新版:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/,PubMed旧版https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed,但是在2020年,PubMed更新版将成为默认使用。那么如果掌握PubMed更新版的检索方法呢?

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检索方法

接下来我们以骨关节炎的检索策略为大家演示文献的检索与导出:
"osteoarthritis"[MeSH] OR "osteoarthr*"[Title/Abstract] OR "degenerative arthritis"[Title/Abstract]
首先进入MeSH数据库,点击页面中的MeSH Database,输入osteoarthritis后将第一条记录勾选并点击右侧的Add to search builer,会看到PubMed Search Builder中出现了"Osteoarthritis"[Mesh],点击Search PubMed。
接下来,在结果的展示界面点击Advance进入高级检索
在高级检索界面中选择字段Title/Abstract,在框中输入检索词osteoarthr*,点击Add,会看到Query box出现osteoarthr*[Title/Abstract],
同理输入"degenerative arthritis",这时需要注意,因为是第二个词,所以要选择与第一个词的逻辑关系,点击下拉的小箭头,选择Add with OR,最后可以看到(osteoarthr*[Title/Abstract]) OR ("degenerative arthritis"[Title/Abstract])的检索式,然后点击Search,也可以点击下拉箭头选择Add to history。
最后在检索历史界面将主题检索结果与自由词检索结果合并,分别点击Actions的···,选择Add query, Add with OR,最后在Query box可看到检索式,点击Add to history,最后在检索历史界面可看到检索结果89887条,然后点击数字可以进入检索结果展示的界面。
结果的展示界面仅支持两组排序方式Best match(默认)和Most recent,之前Best match数目会减少目前来看也已经解决,文献的导出也更加人性化,唯一美中不足的是最多只支持导出1万条记录。依次点击Save,Selection中选择All results,另外也支持All results on this page(该页文献)和Selection(您选中的),Format选择RIS格式,保存的格式用EndNote默认打开即可实现导入。由于PubMed不支持分次导出,因此大家在制作Meta分析时需保证最终的检索结果少于10000条(相信也没有那么多,不然筛选累死人了)
另外值得一提的是在摘要的展示界面新增了对该文章的评论、相似文章、被引用文章,相信会增加阅读文献的体验.
目前账户登陆后会文献检索文献,因此无法使用自定义过滤器和创建提醒等功能,待完善后再为大家介绍。PS:大家非常喜爱的ScholarScope显示影响因子的插件也失效了。
因此你是PubMed的这次更新你是喜欢还是不喜欢呢?
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