单细胞测序分析课程推荐
虽然我们公众号创建的目的还是想给大家推荐一些现成的数据库。这样降低大家使用组学数据的门槛。但是,有一些同学,确实想学一些基本的生信分析的技能。所以如果有一些好的课程或者资源啥的。也会尝试着推荐给大家吧。
目前,对于测序而言,可能最火的就是单细胞测序了。最近在nature protocols上刚刚发表了一篇单细胞测序基本分析方法的综述。所以也就忍不住的推荐给大家了。
在这个综述里面,作者之前做过一个单细胞基本分析的课程(https://scrnaseq-course.cog.sanger.ac.uk/website/index.html)。在这个课程里面,提到了一步一步,如何分析单细胞数据。有兴趣的可以了解一下。
同时作者把之前自己做的培训视频也放到youtube上了。视频总共加起来有16个小时。其实就相当于周末两天的课程了。鉴于很多同学没办法观看。所以笔者就把视频下载了下来。如果想要看视频学习的话,可以回复: ScRNA 获得视频哈。
PS:视频没有中文字幕。如果有一些不懂的地方。那看教程也是可以的。
最后再唠叨几句,关于单细胞测序的分析,这个课程主要还是基于R语言来进行分析的。同时前期的数据处理利用了一部分linux的代码行,所以如果要学习的话,最好还是把相关的基本知识补充一下。快速入门的方法的话,可以参考生信技能树的B站的linux(B站ID:BV1ds411g7eg)和R语言(B站ID:BV1cs411j75B )的视频。有兴趣的可以看一下哈。
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