朱棣经句容攻占南京夺得帝位，永乐十六年临茅山
史料记载，燕王朱棣发动“靖难之役”，建文四年（1402 年）是从句容东北面长江上的瓜洲渡江，自镇江经句容下蜀、龙潭，最后攻占了应天（今南京），夺得帝位。
洪武三十一年（1398 年），朱元璋驾崩后，因太子朱标早逝，皇太孙朱允炆继位，是为惠帝，年号建文，后世以其年号而又称建文帝。
明太祖朱元璋在位时，把儿孙分封到各地做藩王，藩王各拥重兵，坐镇一方，势力日益膨胀，燕王朱棣更握有重权。建文帝朱允炆对这些藩王忧心忡忡，继位不久，就为增强自己的权力而同时削弱诸王的权力，采取了一系列削藩措施，先后以各种理由把一些藩王逮捕的逮捕，流放的流放。在对那些较小较弱的藩王采取行动后，目标直指实力最强的燕王朱棣。
朱棣为明太祖第四子，元顺帝至正二十年（1360 年），生于应天府。洪武三年（1370 年），10 岁受封燕王。洪武十三年（1380 年），就藩燕京北平。
洪武三十一年十二月，为了提防朱棣造反，建文帝在北平周围及城内部署兵力，又以防边为名，把朱棣的护卫精兵调出塞外戍守，准备削除燕王。
燕王朱棣见到几位藩王先后被削，明白如此下去必无法逃过此劫，遂一边争取时间一边做战争准备。
建文元年(1399 年)，燕王朱棣以“清君侧”为名举兵起事，史称“靖难之役”。“靖难”，就是削平祸乱的意思。
建文帝起用老将耿炳文统兵北伐，又派李景隆继续讨伐。但因建文帝缺乏谋略，加上朱元璋大清洗后朝中已无良将可用，致使主力节节败退，不断被歼。
建文四年，朱棣挥师南下。灵璧（位于安徽省东北部）之战后，从哪个方向进攻，朱棣召集诸将商议，有的说宜取凤阳，有的说先取淮安。朱棣说“凤阳楼橹完，淮安多积粟，攻之未易下，不若乘胜直趋扬州。”意思是凤阳防守严，淮安粮多，不易攻取，不如一鼓作气拿下扬州。五月十一日，燕军遂向扬州方向前进，一路摧枯拉朽，五月十七日，到达天长（扬州西北50 公里）。
五月二十二日，朱允炆遣庆成郡主( 朱元璋的侄女、朱棣的堂姐) 与朱棣谈判，表示愿意割地求和。朱棣说“此奸臣欲姑缓我，以俟远方之兵耳。我岂为所欺哉!”意思是这是奸臣施的缓兵之计，我不会上当的。庆成郡主无言以对，只好返回复命。
六月初一日，燕军准备从浦子口（今南京浦口）渡江，但遇到了平燕将军、总兵官盛庸最后的抵抗。燕军战不利，朱棣打算议和北还。此时朱棣次子朱高煦引兵来援，朱高煦率众殊死战，击败盛庸，都督陈蠧率水师降燕。
六月初三日，燕军乘势自瓜洲渡江，盛庸仓促聚集海船出下蜀东面的高资港迎战，被击败，军队溃散。
六月初六日，燕军至镇江，镇江守将童俊率城投降。燕军自镇江向西，经高资、桥头、下蜀，六月八日攻破龙潭，直逼南京城下。官军已毫无抵抗能力，燕将感叹道：“原以为越到京畿越会泥足深陷，岂知官军久疏战阵，犹如土鸡瓦狗般不堪一击。”
燕军驻扎于龙潭、下蜀一带，距京师东约30 公里，近在咫尺，朝廷惊恐万状。
六月初九，建文帝派人见朱棣，再次谈判。朱棣表示割地无名，只要奸臣。
建文帝束手无策。大臣方孝孺进言，认为可以坚壁清野，得不到物资支持的燕军会不战自疲。官军固守城池，以待援军，抵御的时间越久，前来勤王的军队就会越多。拖延几天，胜负难说。
没了章法的朱允炆对方孝孺言听计从，于是下令兵将赶赴城外，在京城以东长江沿线，夜以继日，拆除屋宇，搬运物资，不给燕军留下任何可用的东西。
拆下的砖瓦木料越积越多，家园毁坏后搬出的物资到处都是。督役将官限令尽快将物资运完，实在运不了的，便放火烧掉。一时间郊外村镇大多毁于大火，四乡民众哀鸿遍野。
要说以前京城百姓还准备和皇帝共存亡的话，那现在人人都恨不得燕军赶紧攻下京城，谁会甘心为了保他皇帝的皇位，把自己的家给毁了？
《光绪续纂句容县志》载：“惠帝建文四年六月乙卯，燕兵自瓜洲渡江。庚申至龙潭，帝令清野，民多自焚其屋。”
然而，坚壁清野也抵挡不住燕军凌厉的攻势，六月十三日，燕军抵应天。
守卫金川门( 位于南京城西北面) 的朱橞和李景隆开门迎降，是为金川门之变。
《明史·本纪》卷五载：癸巳，王集诸将议所向，或言宜取凤阳，或言先取淮安。王曰：“凤阳楼橹完，淮安多积粟，攻之未易下。不若乘胜直趋扬州，指仪真，则淮、凤自震。我耀兵江上，京师孤危，必有内变。诸将皆曰善。己亥，徇扬州，驻军江北。天子遣庆成郡主至军中，许割地以和，不听。六月癸丑，江防都督佥事陈瑄以舟师叛，附于王。甲寅，祭大江。乙卯，自瓜州渡，盛庸以海艘迎战，败绩。戊午，下镇江。庚申，次龙潭。辛酉，天子复遣大臣议割地，诸王继至，皆不听。乙丑，至金川门，谷王橞、李景隆等开门纳王，都城遂陷。”
燕军攻下帝都应天，燕王朱棣夺得帝位，建文四年7 月17 日在南京登基，称明成祖，改年号永乐。后世又称朱棣为永乐大帝。永乐十九年（1421 年），正式迁都北京。
自建文四年（1402）在南京登基，至永乐十九年迁都北京，明成祖朱棣在南京的时间近20 年。
朱棣笃信道教，自诩为真武大帝的化身，发动“靖难之变”时，利用方士为其出谋划策、制造舆论，即位后更利用道教为其巩固统治地位，多次遣人寻访大师张三丰。永乐十六年（1418 年），亲临茅山。《光绪续纂句容县志》载：“明成祖永乐十六年，帝幸茅山。”