ggplot2绘图学习 箱图
R绘图往期回顾：
R绘图：patchwork 一页多图（2）通过数字，字母，#符号 控制布局
R绘图：ggeconodist，基于ggplot2的另类箱图
之前我们学习了ggplot绘制单变量，两个连续变量的图形，两个离散型变量。对于一个离散型变量，一个连续型变量，有很多作图方式，包括箱图，点图等等
· geom_boxplot() for box plot
· geom_violin() for violin plot
· geom_dotplot() for dot plot
· geom_jitter() for stripchart
· geom_line() for line plot
· geom_bar() for bar plot
今天我们介绍一下箱图
library(ggplot2)data("ToothGrowth")ToothGrowth$dose <- as.factor(ToothGrowth$dose)head(ToothGrowth)我们先建立一个图层，以dose为X轴，len为Y轴
e <- ggplot(ToothGrowth, aes(x = dose, y = len))箱图的主要函数及参数
· Key function: geom_boxplot()
· Alternative function: stat_boxplot()
· Key arguments to customize the plot: alpha, color, linetype, shape, size and fill
基本的箱图
e + geom_boxplot()旋转的箱图
e + geom_boxplot() + coord_flip()凹陷的箱图（缺口显示中位数以及置信区间）
e + geom_boxplot(notch = TRUE)显示均线的箱图
e + geom_boxplot() + stat_summary(fun = mean, geom = "point", shape = 18, size = 4, color = "blue")scale_x_discrete()可以
1 选择要展示的X轴
2 改变X轴顺序
选择要展示的X轴
e + geom_boxplot() + scale_x_discrete(limits=c("0.5", "2"))改变顺序
e + geom_boxplot() + scale_x_discrete(limits=c("2", "0.5", "1"))通过group改变颜色
边框和填充色都可以改变
单一颜色
e + geom_boxplot(color = "black", fill = "steelblue")改变边框颜色
e + geom_boxplot(aes(color = dose))改变填充色
e + geom_boxplot(aes(fill = dose))手动改变边框/填充色
· scale_color_manual(), scale_fill_manual() : 用自定义颜色
· scale_color_brewer(), scale_fill_brewer() : 使用RColorBrewer包中的调色板
· scale_color_grey(), scale_fill_grey() :使用灰度
用自定义颜色
e2 <- e + geom_boxplot(aes(color = dose)) + theme_minimal()e2 + scale_color_manual(values=c("#999999", "#E69F00", "#56B4E9"))调色板
e2 + scale_color_brewer(palette="Dark2")e2 + scale_color_grey()改变填充色
e3 <- e + geom_boxplot(aes(fill = dose)) + theme_minimal()e3 + scale_fill_manual(values=c("#999999", "#E69F00", "#56B4E9"))e3 + scale_fill_brewer(palette="Dark2")e3 + scale_fill_grey()多组箱图
e + geom_boxplot(aes(fill = supp))改变箱子的间距
e + geom_boxplot(aes(fill = supp), position = position_dodge(1))自定义颜色
e + geom_boxplot(aes(fill = supp), position = position_dodge(1)) + scale_fill_manual(values=c("#999999", "#E69F00"))资源贴