环状RNA纯数据挖掘套路
第一步
在GEO数据库下载相关的环状RNA、miRNA、mRNA
第二步
分别对下载到的环状RNA、miRNA、mRNA做差异分析
第三步
利用差异的环状RNA预测可能结合的miRNA
第四步
预测得到的miRNA与差异miRNA取交集
第五步
将上面得到的miRNA预测靶基因
第六步
构建ceRNA网络
第七步
在TCGA数据库下载相关的miRNA数据和临床数据,与网络中miRNA取交集并且做相关性分析
第八步
对网络中的差异基因做功能分析,并且构建蛋白互作网络,提取hub基因并且做生存分析
现在只分享套路,后续我们将会提供范文和课程讲解。
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