环状RNA纯数据挖掘套路

第一步

在GEO数据库下载相关的环状RNA、miRNA、mRNA

第二步

分别对下载到的环状RNA、miRNA、mRNA做差异分析

第三步

利用差异的环状RNA预测可能结合的miRNA

第四步

预测得到的miRNA与差异miRNA取交集

第五步

将上面得到的miRNA预测靶基因

第六步

构建ceRNA网络

第七步

在TCGA数据库下载相关的miRNA数据和临床数据,与网络中miRNA取交集并且做相关性分析

第八步

对网络中的差异基因做功能分析,并且构建蛋白互作网络,提取hub基因并且做生存分析

现在只分享套路,后续我们将会提供范文和课程讲解。

VIP会员涨价通知

一次性付费就可以学习所有课程

不做meta分析,不搞生信,利用这招就可以发一大堆SCI

利用环状RNA开题课程重磅发布

用这个数据库选题好选到爆

要是得到这张图,预测模型绝对加分

你没有看错,3分+SCI就是这么简单

生信之非肿瘤数据挖掘重磅发布

非肿瘤方向一样可以做临床预测模型呀

临床预测模型高级课程重磅发布

meta分析入门也不是如此简单

贝叶斯网状meta分析应该怎么样学呢?

手把手教你利用WGCNA发文章

GO富集分析这种图,你也可以呀

这个文件可以帮助你少走很多弯路

(0)

相关推荐

  • 科研 | 剑桥大学:造血细胞转录组图谱中细胞类型特异性新的LncRNA和circRNA

    编译:Champion,编辑:夏甘草.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读 本研究使用来自脐带和成人外周血的27种成熟细胞的90个RNA样品以及来自11种成熟细胞的32个小RNA样品进行分析.通过 ...

  • circRNA芯片分析的一般流程

    虽然我一直讲解的GEO数据挖掘,都是基于mRNA这样的表达芯片,但实际上miRNA,lncRNA,甚至circRNA芯片也是大同小异的分析流程. 所以,如果你确实是第一次接触circRNA芯片数据,完 ...

  • 环状RNA CircFndc3b通过FUS/VEGF

    原创 李纪伟 上海生命基因 环状RNA CircFndc3b通过FUS/VEGF-A轴调节心肌梗死后的心脏修复 发表单位:坦普尔大学Lewis Katz医学院 师弟:最近的circRNA研究好热门!我 ...

  • 肿瘤miRNA靶点预测数据库

    miRNA作为ncRNA的一类.其主要发挥功能的主要方式是通过和基因形成双向互补链进而来影响基因的表达.因此通过miRNA和基因序列是否互补就可以遇到miRNA可能的靶基因了.这个基本上就是经典的预测 ...

  • ceRNA-芯片分析的一般流程

    前面我们已经介绍过circRNA的基础概念: 首先了解一下circRNA背景知识,背景知识,以及 circRNA芯片分析的一般流程,还有circRNA-seq分析的一般流程. 看起来好像是把circR ...

  • 环状RNA高分发文套路

    文章题目:A circular RNA protects the heart from pathological hypertrophy andheart failure by targeting m ...

  • 纯数据挖掘之仔猪的长非编码RNA的鉴定

    咱们<生信技能树>的B站有一个lncRNA数据分析实战,缺乏配套笔记,所以我们安排了100个lncRNA组装案例文献分享,以及这个流程会用到的100个软件的实战笔记教程! 下面是100个l ...

  • 环状RNA,用这种套路好发到爆

    本课程根据一篇100%纯数据挖掘的范文进行讲解,完成文章里面所有内容的分析,文章里面没有任何实验操作,做到100%纯挖掘.课程部分内容展示: 本课程属于VIP会员专属课程,请购买了VIP会员的粉丝朋友 ...

  • 利用这个套路,环状RNA轻松发4.5分SCI

    文章题目:Increased expression of circRNA_102231 in lung cancer and its clinicalsignificance 全文下载方式:打开网址h ...

  • 环状RNA数据挖掘

    为标书选题,为研究生开题或者实验选题,可以合理利用数据挖掘.如果是研究环状RNA,可以挖掘GEO数据进行选题,我们已经录制好了这样的视频,视频内容就是怎么教你查找数据,然后下载数据和整理数据,然后进行 ...

  • circRNA(circular RNA,环状RNA)详解

               近年来,circRNA作为非编码RNA研究领域中的新宠,在每一个研究领域.研究方向都有发现circRNA新功能,吸引着无数科研小伙伴们的眼光聚焦于此,在心痒难耐.摩拳擦掌的同时, ...

  • 全球首家“环状RNA”初创成立即获上亿美元融资,发展潜力比线性RNA公司更大?

    昨日,mRNA 疫苗入选<麻省理工科技评论> 2021 年"全球十大突破性技术"榜单,印证了 mRNA 技术的发展潜力. 就在今日,美国初创公司 Orna Therap ...

  • 知名风投先后入局的环状RNA赛道前景几何?业内人士:还有两大难题亟待解决

    过去一年,新冠疫苗的研发让一种线性 RNA--mRNA 变得耳熟能详,相关研究的火热程度前所未有. 而在最近,环状 RNA 又开始掀起另一波关注.继全球首家环状 RNA 初创露面后(点击转到:全球首家 ...