菌种鉴定知识

一、菌种鉴定目的

通过形态特征、理化特性、遗传进化角度等阐明微生物种群之间的分类学关系，确认菌种的身份。

二、菌种鉴定方法

菌种鉴定一般就只要提取基因组DNA，然后PCR扩增16s rDNA片段，上机测序之后，上GeneBank或者Eztaxon对比即可。一般序列相似度在99%以上就可以认为是同一个种细菌。

三、DNA测序流程

（1）基因组DNA提取和检测

（2）16SrDNA/18SrDNA扩增

（3）产物纯化，上机测序，序列比对分析

四、菌种鉴定报告(样本)