非肿瘤纯生信创新思路3(重点融入免疫相关性分析)重磅上线
很多人都说非肿瘤纯生信没有什么内容可以做,难以发表SCI论文,其实并不是这样的,你可以对分析内容进行一下创新,例如这样的分析思路:
如何进行创新呢?
我们可以根据一篇2-3分的非肿瘤参考范文进行创新,例如下面这篇参考范文:
原文是这样做的:
第一步,数据下载处理、合并、矫正、差异分析
第二步,进行WGCNA分析
第三步,进行取交集的基因
第四步,进行GO、KEGG富集分析、PPI分析、构建miRNA-mRNA-TF网络
第五步,进行免疫相关的分析
我们进行创新后的分析思路是这样的:
第一步,数据下载处理、合并、矫正、差异分析
第二步,重点关注免疫分析部分,不做其他分析,CIBERSORT这种算法估计审稿人都看腻了,我们使用ssGSEA算法计算免疫评分,并且分为免疫细胞和免疫功能这两部分
第三步,进行免疫细胞之间的相关性分析、免疫功能之间的相关性分析
第四步,进行正常组与疾病组之间免疫评分的差异分析
第五步,进行显著表达的基因与免疫细胞、免疫功能的相关性分析,并且筛选与免疫最为相关的基因(重点分析内容)
第六步,选出与免疫最为相关的基因构建模型(重点分析内容)
第七步,GO与KEGG分析估计审稿人都看腻了,我们来做一下DO分析
在这里我们仅仅分享了创新思路,里面的操作内容需要大家自行进行摸索。
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