即将突破5分的Frontiers in Oncology是灌水杂志吗?
最近很多解读发表在Frontiers in Oncology(Front Oncol)上的纯生信(或者是生信+一点湿实验)的文章;吓得小编我赶紧去查了一下Front Oncol的IF,吃鲸!18年的IF居然有4.137分!19年的预测IF已经4.92分了。虽然现在已经3月了,但说不定有希望在6月前突破5+分!即使不能过5+,4.92分也是很不错的IF,并且自引率低得惊人(日后再给大家分享关于自引率的故事)。比起一直在3分左右徘徊不定的杂志而言,Front Oncol能稳定在4+分也说明了它的能够保证足够多的引用量!
比如说2019年的影响因子,是计算2017年+2018年的review+article的总数当做分母,而分子则是所有文章的引用(包括短文);
而为什么2020年1-2月都还不能确定影响因子呢?是因为有的杂志是季刊或者是年刊,在年底才发文章,而这些文章的卷期标注的是2019,但是收录到WoS数据库里面需要一定的时间,所以经常会有延迟;但是一般次年4月就稳定了,3月可能还会有0.1-0.2的波动;
图片来源:桑格助手
从这个图可以看到Front Oncol的年刊量从2018年突然暴涨,国人发表数目也从之前的个位数到了103篇!为什么呢?因为2018年Front Oncol获得了第一个IF=4.416;从趋势图上看得很清楚,在2019年年刊量几乎又翻倍,到了1617篇;我们预估2020年的IF也是类似的一个水平。
2019和2020的国产比例都在40%左右;
2020截止今日发表332篇,今年过去约75天;332×(365÷75)约等于1600篇
此外,我们来看看Front Oncol的引用情况,因为明白Front Oncol的引用才能让我们更好的预估它未来的趋势。首先我们可以看到2018年的文献,其中一篇讨论免疫检查点抑制剂的文章被引用124次!第十名也有34次的被引量,这比我们之前看到的Aging杂志的引用乐观很多了。
然后小编把2018年的文章都导出来看了以后发现,和大部分的杂志一样,Front Oncol被引用很高的都是review的杂志,其中Top30的文章里有28篇都是综述,有2篇是original article,其中有一篇是纯生信的「预后分数」的分析;
那2019年又是怎样呢,因为2018年的时候做纯生信分析还不是很多,真正大家都开始做生信分析还是在2019年才开始的;我们可以看到2019年的被引用最高的一篇是关于STATs蛋白的综述;Top30被引有26篇都是review,和2018年的一样。
那被引用高的都是Review,是不是Review的比例很高呢?我们大致计算了一下:综述1440/总刊量4323=33.3%,这个比例比起很多Open Access(OA)的杂志只有10%不到的Review比例已经很高了。当然也不能和那种只做review的杂志比较,没有可比性。看样子Front Oncol保持高引用的秘诀很可能是这些非常高水平的Review!
有人会问,纯生信文章去哪里了呢?我们检索发现,生信类文章在Front Oncol上,2019共计发表不足100篇,而2020年目前有34篇(今年预计在150篇左右),都是在6-8%的一个水平。那剩下的articles除了一些极少做算法和网站的,就还是那些老老实实做湿实验的了。并且笔者随机阅读了20篇最近发表的湿实验的文章,4-5分的水准肯定是有的。
并且发表的论文不少文章还是做了一点基础实验的,比如说WB,免疫组化,克隆形成,划痕实验等。
所以,综上所述Frontiers in Oncology不是一个水刊,虽然戴着Frontiers的帽子,因为OA附带着极高的版面费,但是不得不说文章的质量还是可以的。年刊量1600+,难免有一些灌水成功的例子,这可能是责编,亦或是审稿人的原因。
当然,回过头,我们再聊聊这些发表的生信文章的文章大致可以分为哪些类别呢?主要可以分为以下几类:
Risk score相关:特定通路或者是某类RNA;
免疫微环境/免疫浸润
可变剪切
RNA编辑
温馨提示,在单基因生信分析的时候,尽可能补充一些基础实验,实在不行也去蛋白数据库找一点免疫组化在正常人和肿瘤患者的差异来凑数吧
那这些纯生信文章的发表周期又是如何呢?
7-lncRNA Assessment Model for Monitoring and Prognosis of Breast Cancer Patients_ Based on Cox Regression and Co-expression Analysis
Received: 25 January 2019 Accepted: 15 November 2019
从投稿到接受10个月
A 6 lncRNA-Based Risk Score System for Predicting the Recurrence of Colon Adenocarcinoma Patients
Received: 10 October 2019 Accepted: 16 January 2020
从投稿到接受2个月
An immune-related signature predicts survival in patients with lung adenocarcinoma
Received: 01 Apr 2019; Accepted: 12 Nov 2019
从投稿到接受8个月
An Integrated Three-Long Non-coding RNA Signature Predicts Prognosis in Colorectal Cancer Patients
Received: 28 July 2019 Accepted: 04 November 2019
从投稿到接受4个月
Association of MSH2 Expression With Tumor Mutational Burden and the Immune Microenvironment in Lung Adenocarcinoma
Received: 30 October 2019 Accepted: 30 January 2020
从投稿到接受3个月
Development and Validation of a RNA-Seq Based Prognostic Signature in Neuroblastoma
Received: 14 Apr 2019 Accepted: 18 Nov 2019
从投稿到接受7个月
Development of a Novel Six-miRNA-Based Model to Predict Overall Survival Among Colon Adenocarcinoma Patients
Received: 10 September 2019 Accepted: 08 January 2020
从投稿到接受4个月
Development of an Immune Infiltration-Related Prognostic Scoring System Based on the Genomic Landscape Analysis of Glioblastoma Multiforme
Received: 10 September 2019 Accepted: 29 January 2020
从投稿到接受4个月
Effect of m6A RNA Methylation Regulators on Malignant Progression and Prognosis in Renal Clear Cell Carcinoma
Received: 14 July 2019 Accepted: 06 January 2020
从投稿到接受6个月
Gene Expression Profiling Stratifies IDH-Wildtype Glioblastoma With Distinct Prognoses
Received: 25 April 2019 Accepted: 02 December 2019
从投稿到接受7个月
Genomic Features and Clinical Characteristics of Adolescents and Young Adults With Cholangiocarcinoma
Received: 06 August 2019 Accepted: 03 December 2019
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Genomic Identification of RNA Editing Through Integrating Omics Datasets and the Clinical Relevance in Hepatocellular Carcinoma
Received: 29 October 2019 Accepted: 09 January 2020
从投稿到接受3个月
Genomic Signatures of Immune Activation Predict Outcome in Advanced Stages of Ovarian Cancer and Basal-Like Breast Tumors
Received: 01 November 2019 Accepted: 10 December 2019
从投稿到接受1个月!
Identification of a Two-Gene (PML-EPB41) Signature With Independent Prognostic Value in Osteosarcoma
Received: 02 September 2019 Accepted: 31 December 2019
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Integrative Analysis of Sirtuins and Their Prognostic Significance in Clear Cell Renal Cell Carcinoma
Received: 06 October 2019 Accepted: 07 February 2020
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Prognostic Heterogeneity of MRE11 Based on the Location of Primary Colorectal Cancer Is Caused by Activation of Different Immune Signals
Received: 05 May 2019 Accepted: 06 December 2019
从投稿到接受7个月
Screening and Identifying Immune-Related Cells and Genes in the Tumor Microenvironment of Bladder Urothelial Carcinoma_ Based on TCGA Database and Bioinformatics
Received: 24 September 2019 Accepted: 19 December 2019
从投稿到接受4个月
Screening the Cancer Genome Atlas Database for Genes of Prognostic Value in Acute Myeloid Leukemia
Received: 23 September 2019 Accepted: 16 December 2019
从投稿到接受3个月
Systemic Analysis of RNA Alternative Splicing Signals Related to the Prognosis for Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
Received: 08 August 2019 Accepted: 16 January 2020
从投稿到接受5个月
UBASH3B Is a Novel Prognostic Biomarker and Correlated With Immune Infiltrates in Prostate Cancer
Received: 13 May 2019 Accepted: 17 December 2019
从投稿到接受7个月
从上述的20篇文章我们可以发现,大部分的文章是在3-4个月就接受了,还有一些1个月就直接接收了的;当然也有一些文章因为可能是因为审稿人提了很多意见,有可能还补充了一些基础实验,所以全部审稿加修稿下来用了7-8个月的时间。
Again!Frontiers in Oncology不是一个水刊!至于它后期IF走向如何,小编在科研菌为大伙解读它的发展和走向!
关注「科研菌」公众号,并后台回复「F」,获取上述的经典20篇Frontiers in Oncology生信论文。
编辑:理茶德
校审:糯米饭