美国发布艾伦干细胞浏览器!含6000张干细胞3D图片
想象一下,你有一双特殊的“透视眼”,能够透过一个人,看清楚他的每一个细胞、干细胞,就好像在博物馆看“装在生物容器里的标本”。
这是美国艾伦细胞科学研究所努力在做的事情。他们历时一年,制作出来自同一母细胞的不同干细胞3D图片集,形成了一个堪称宏大的干细胞图片展览,还带有检索功能,并命名为——“艾伦干细胞浏览器”(Allen Cell Explorer),2天前才刚刚正式发布。
细胞是生命的基本单位。
我们体内的每个细胞都是一个微观的小世界,包含着许许多多复杂的、鲜活的、相互合作、密切配合的“动力机制”,然后便促成了细胞的行为——比如说,有类似于在你的体内游走游走,或者分裂一下、一个变俩,这样的基础行为;也有比如说一大堆细胞约好了一起跳一跳,好让你的心脏能够完成泵血的这种高度专业化的行为。
生物科技前沿现在已经了解了究竟有多少这样的“细胞动力机制”,但我们还没有搞清楚的是,它们到底是怎么完成一系列复杂的合作,在各种特定的时刻,完成各种各样特定的任务的。理解这些非常关键,会帮助我们更好地看懂当一个人生病的时候,他的细胞究竟发生了什么事情而导致无法正常运转。
艾伦干细胞浏览器提供的这些公开图片集——Dr.博逛了逛,每一个细胞都超美,合在一起,堪称震撼。它对细胞层面的研究会有很大的帮助,科学家们可以观察癌症和其他疾病有关的细胞结构变化,从而加速干细胞、癌症及药物开发的研究进程。
艾伦干细胞浏览器包含了6000多张诱导多能干细胞图片,每张图片内DNA、细胞膜和线粒体等重要结构都用不同颜色标记。
《自然》杂志网站报道了艾伦干细胞浏览器的发布。艾伦细胞科学研究所主任瑞克·哈维兹带领的研究团队里,有计算机科学家利用程序对数千张图片进行了分析,找到了不同细胞结构之间的相互关联。深度学习程序能够通过一两点线索推测出细胞的结构信息,并将这些信息与真实细胞信息进行比较,不断学习进步,从而演变成准确预测与疾病有关基因变异的3D交互工具。
资料来源:
https://www.paulallen.com/allen-cell-explorer-creating-a-dynamic-digital-window-into-the-human-cell/
http://www.geekwire.com/2017/human-stem-cells-allen-cell-explorer/
http://digitalpaper.stdaily.com/http_www.kjrb.com/kjrb/html/2017-04/07/content_366742.htm?div=-1