药物合成设计

反合成分析基本原则

·对称部分先切割, 可简化合成路线

·不稳定结构先切割、或先转化官能团

·影响反应活性或选择性的基团先转化

·C—X键相邻的C—C键优先切割

·C —Z键优先切割(酰胺、酯、醚)

·切割点优先选择中部,提高合成汇聚性

·C—C键优先切割多分叉点

·多环分子公共原子间的键优先切割

·C=C优先切割

·官能团转换

–官能团转换三种方式(FGI、FGA、FGR)

–官能团转换主要目的

·将目标分子转换成更易制备的前体化合物—替代目标分子(Alternative target molecule);

·将目标分子中不适用的官能团转换成所需形式,或添加可去除的必需官能团;

·添加活化基、保护基、阻断基、或诱导基,提高反应的选择性。

现代有机合成路线设计的著名专家 E. J. Corey 的一本专著《化学合成的逻辑学》(The Logic of Chemical Synthesis),其中重点介绍了有机合成路线设计的五大策略,使我们对有关路线设计的策略思想有更高的提高。

Corey根据他的极为丰富的有机合成路线设计经验,将有关有机合成路线设计的总的策略分为五个方面,被称为“五大策略”。这就是:

1. 基于转化方式的策略(Transform-basedstrategies)

2. 基于结构目标的策略(Structural-goalstrategies)

3. 拓扑学的策略(Topologicalstrategies)

4. 立体化学的策略(Stereochemicalstrategies)

5. 基于官能团的策略(Functionalgroup-based  strategies)

无论是何种策略,Corey在反合成思考中是很重视对目标物“分子复杂度(molecularcomplexity)”的逐步减小。

所谓分子复杂度是由分子的大小(molecularsize)、所有的元素和官能团、环的结构和数量(Corey把这种cyclic connection 就称为 topology)、立体中心的数目或密度、化学活泼性与结构稳定性(即动力学和热力学稳定性)等各种因素综合组成的。一个复杂分子的成功的合成就在于对其进行反合成分析时,正确的逻辑推导以逐步减少分子复杂度。

1. 基于转化方式的策略(Transform-based strategies)

选择有高效的,简化的转化方式,以列出一条起自目标物(TGT或goal)的反合成路线,也可以分成多个反合成步骤(antisynthetic steps),而有多个亚目标物(sub-goals)。

基于转化方式的策略就是在合成的几个关键反应上选择最佳的单元合成反应。

2. 基于结构目标的策略(Structural-goalstrategies)

从目标物的分子结构出发考虑引向一个有效的前体,可以是中间体,逐步反推到合成的起始物。也可以有多条反合成路线而再加以比较。也可以双向探索(bidirectional search),即从目标物反推到某中间体,再由已有的原料出发列出合成此中间体的路线。

在目标物分子结构已知的前提下,可以探索是由哪些部分联结起来组成目标物的,也就是在反合成中目标物分子可拆成哪些部分使合成能有效地,简化地进行。

此时,应考虑:根据目标分子的结构,可分成不变的主体结构(也可以将主体结构分成几个部分,Corey 都称它们为 building blocks)和含有反合成子的亚结构(retron-containing subunits,反合成中要变化的)。这步探索就是为了找到目标结构(S-goal),并由此找到目标起始物,即原料(SM-goal)。

3. 拓扑学的策略(Topological strategies)

这里应用了数学上的名词“拓扑学”,其化学含义就是从目标分子的键的联结(connection)方式出发,考虑一个或几个断键(disconnections)的地方,着手反合成的思路。

它有一整套断开位置规律的总结,可分成无环键和环键,环键又可分成孤立环、螺环、稠环、桥环等体系。当然,反合成分析时,有一些环可以保持的,即作为不变的主体结构(building blocks)对待。反合成中,这些环保持不变。合成时,他们直接来自原料。

非环键的断开可有如下规律:

(1)确定可保持的主体结构。芳环、芳烷、烷基可属于此类结构。要考虑到它们应达到最大利用效率。如能保持一个芳烷基要比保持一个芳基为好。这样才能是合成达到较高的简化。

(2)如环直接嵌入骨架中,不要在环旁切断,而应在离环1-3个碳原子处。有立体中心时,也在离该中心1-3个原子处切断。在两个官能团之间,也在其中1-3个碳原子处断开。

(3)碳原子和杂原子的连接处是切开的地方。

(4)如一个分子切开后,能出现两个相同的部分,这是切开的好地方,会引来合成的简化。

孤立环的断开

(1)不属于要保持的,又处于分子骨架中间的单个的环可以考虑断一个或两个键。此时可考虑在杂原子旁断开,能导致产生对称结构处更应断开。

(2)环中应断开那些容易合成的键,如内酯、半缩醛、半缩酮等。

(3)三员环断开时,当然是 2+1 拆开;四员环断开时应是 2+2。

(4)有些环是优先考虑拆开的,如内酯、缩酮、内酰胺、半缩酮等。

(5)有些多核稠环,如甾体化合物有特殊的断开方法。

4.立体化学的策略(Stereochemicalstrategies)

针对有立体结构的目标物,用立体化学的方法,即考虑到立体的关联性,逐个地去除(remove)立体中心。在多个立体中心中要选择暂时保留,还是首先去除。

在这一策略中,反合成时要考虑的是:立体复杂性的减小,即通过反合成逐步减小立体中心(注意:这里是立体中心,stereocenter,其含义包括手性中心、有E 与 Z 二式的双键、还有像环己烷一样的立体构象等各种立体关系)的数目和密度,将它们进行选择性的移去。为此目的,就必须考虑立体简化转化方式(stereosimplifyingtransform)的选择,所需反合成子的建立,前体所有的空间环境等。这种前体也就是合成反应时试剂所作用的底物(substracts)。

5.  基于官能团的策略(Functionalgroup-based strategies)

根据目标物分子所有的各官能团选择适当的官能团变化方式。

官能团按它们在有机合成中的作用可分成三类:

⑴ 在合成起最重要作用的官能团。常见的有C=C,C=O,C=C,C—OH,—(CO)O—,—NH2,—NO2,—CN等;

⑵ 有一些官能团在合成中,其作用要差一些,如—N=N—,—S—S—,R3P 等,但在某些场合下仍然起较好作用;

⑶ 有些官能团不在分子的重要部位,而在周围(peripheral),但在合成中起活化或控制作用,因而在目标分子中可能没有,而是在合成过程中再出现的。如—Hal, —P—,—SO2—,Me3Si— 以及各种硼烷等。这些周围的官能团还包括连接在基本基团上的另一些基团,如烯胺,邻二羟基,亚硝基脲,β-羟基-α,β-烯酮,胍等。

转自漫游药化

有机合成路线

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