详解如何利用Cython为Python代码加速
引言
通常,在 Python 中写循环(特别是多重循环)非常的慢,在文章 https://www.jb51.net/article/133807.htm中,我们的元胞自动机的状态更新函数 update_state 使用了两重循环,所以我们尝试用 Cython 重构该方法。
代码
我们在同文件夹下新建一个 update.pyx 文件,写入如下内容
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import numpy as np cimport numpy as np cimport cython DTYPE = np. float ctypedef np.float_t DTYPE_t def update_state(np.ndarray[DTYPE_t, ndim = 2 ] cells): return update_state_c(cells) @cython .boundscheck( False ) @cython .wraparound( False ) cdef np.ndarray[DTYPE_t, ndim = 2 ] update_state_c(np.ndarray[DTYPE_t, ndim = 2 ] cells): """更新一次状态""" cdef unsigned int i cdef unsigned int j cdef np.ndarray[DTYPE_t, ndim = 2 ] buf = np.zeros((cells.shape[ 0 ], cells.shape[ 1 ]), dtype = DTYPE) cdef DTYPE_t neighbor_num for i in range ( 1 , cells.shape[ 0 ] - 1 ): for j in range ( 1 , cells.shape[ 0 ] - 1 ): # 计算该细胞周围的存活细胞数 neighbor_num = cells[i, j - 1 ] + cells[i, j + 1 ] + cells[i + 1 , j] + cells[i - 1 , j] + \ cells[i - 1 , j - 1 ] + cells[i - 1 , j + 1 ] + \ cells[i + 1 , j - 1 ] + cells[i + 1 , j + 1 ] if neighbor_num = = 3 : buf[i, j] = 1 elif neighbor_num = = 2 : buf[i, j] = cells[i, j] else : buf[i, j] = 0 return buf |
update_state_c 函数上的两个装饰器是用来关闭 Cython 的边界检查的。
在同文件下新建一个 setup.py 文件
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import numpy as np from distutils.core import setup from Cython.Build import cythonize setup( name = "Cython Update State" , ext_modules = cythonize( "update.pyx" ), include_dirs = [np.get_include()] ) |
因为在 Cython 文件中使用了 NumPy 的头文件,所以我们需要在 setup.py 将其包含进去。
执行 python setup.py build_ext --inplace 后,同文件夹下会生成一个 update.cp36-win_amd64.pyd 的文件,这就是编译好的 C 扩展。
我们修改原始的代码,首先在文件头部加入 import update as cupdate,然后修改更新方法如下
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def update_state( self ): """更新一次状态""" self .cells = cupdate.update_state( self .cells) self .timer + = 1 |
将原方法名就改为 update_state_py 即可,运行脚本,无异常。
测速
我们编写一个方法来测试一下使用 Cython 可以带来多少速度的提升
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def test_time(): import time game = GameOfLife(cells_shape = ( 60 , 60 )) t1 = time.time() for _ in range ( 300 ): game.update_state() t2 = time.time() print ( "Cython Use Time:" , t2 - t1) del game game = GameOfLife(cells_shape = ( 60 , 60 )) t1 = time.time() for _ in range ( 300 ): game.update_state_py() t2 = time.time() print ( "Native Python Use Time:" , t2 - t1) |
运行该方法,在我的电脑上输出如下
Cython Use Time: 0.007000446319580078
Native Python Use Time: 4.342248439788818
速度提升了 600 多倍。
以上就是本文的全部内容,希望对大家的学习有所帮助,也希望大家多多支持脚本之家。
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