基于网络药理学和分子对接的桃红四物汤治疗原发性痛经的作用机制研究

目的通过网络药理学和分子对接技术分析桃红四物汤治疗原发性痛经的作用机制。方法通过TCMSP数据库搜索并筛选桃红四物汤中6味中药的有效化合物和靶点。检索OMIM,Genecards数据库获得原发性痛经的疾病基因。利用R语言得到桃红四物汤治疗原发性痛经的潜在作用靶点,并利用cytoscape构建"药物-化合物-靶点"网络图筛选出主要化合物。利用STRING数据库获得潜在作用靶点的蛋白与蛋白相互关系,从而获得主要作用靶点。利用Clue GO对潜在作用靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析。MOE软件对主要化合物和关键靶点进行分子对接。结果通过筛选,桃红四物汤中有61个有效化合物,共199个作用靶点。通过OMIM,genecards数据库获得原发性痛经疾病靶点205个。桃红四物汤靶点中的36个与原发性痛经靶点共表达。cytoscape软件分析得到桃红四物汤治疗原发性痛经的主要化合物是槲皮素,山柰酚,木樨草素,黄芩素,β-谷固醇,β-胡萝卜素,杨梅酮等。通过string数据库分析得到桃红四物汤治疗原发性痛经的潜在作用靶点主要是IL6,PTGS2,VEGFA,CASP3,CXCL8,ESR1,MMP9,FOS,IL1B,MMP2等。GO富集分析共1069个结果,靶点基因主要参与类固醇激素反应、平滑肌细胞增殖的调节等生物学过程。KEGG通路富集在Fluid shear stress and atherosclerosis、Kaposi sarcoma-associated herpesvirus infection、Proteoglycans in cancer、Human cytomegalovirus infection、IL-17 signaling pathway等通路。分子对接结果显示关键化合物与靶点结合性较强,结合分值均大于6.6,其中大部分结合分值大于7.0。

结论桃红四物汤通过多成分、多靶点、多通路的方法对原发性痛经发挥治疗作用,为研究桃红四物汤的活性成分和后续动物、细胞实验研究提供了理论依据。...