ggClusterNet-专辑-简介

写在前面

微生物生态学领域对于网络的追求就像是人类对对航天的追求，弄不清楚，但是充满兴趣。对于微生物组数据做网络分析，充满着机会和挑战。多种多样的网络构建方法，检测方法，可视化方法出现，并且依赖的平台也不太统一。整合起来将是一个巨大的难题。

目前我们将一下几个部分进行一个汇总，以R语言作为媒介进行整理，将逐渐包含以下几个方面的内容。ggClusterNet正在发展，相关功能正在完善，希望大家可以提出需求。留言盖楼。

目前可以在我的github主页下载使用，pipeline正在构建中，将陆续发布。https://github.com/taowenmicro/ggClusterNet

网络构建

• 逐渐整合多种网络计算方法；

网络可视化

• 主要设计按照分组展示网络，毛线球拆分成不同的模块展示；

• 网络标记，等

网络属性，节点属性，整体网络属性

• 多种节点属性计算，包括度，中心性等；

• 网络属性，模块性的等；

随机网络与生态学网络

• 随机网络计算；

• 微生物网络与随机网络显著性；

• 幂律分布及其可视化；

网络模块化

• 模块化计算；

• ZiPi计算可视化；

网络HUB节点

• 基于多种算法的HUB节点计算；