有了这个网站,我可以写一篇疾病相关综述!

写在前面

对于临床方面的研究而言,如果我们要研究一个疾病,那么肯定要先知道这个基因之前的研究是什么一种情况,这种最经典的方式还是去看关于疾病的相关综述。随着现在网络数据库的增多,已经很多和疾病相关的数据库了,所以我们去查询这些疾病汇总的数据库去可以快速的了解一个疾病的基本研究现状了。

今天要介绍的这个数据库是汇总了多个疾病相关数据库而成的疾病相关数据库:MalaCards (https://www.malacards.org/),这个数据库汇总了来自于74个数据库的信息。

数据库使用

这个数据库和我们前两天介绍的GeneCards是一样的,GeneCards是输入基因将就可以获得信息,这个数据库输入相关的疾病即可。例如我们检索胃癌,输入: gastric cancer

输入疾病之后,我们就跳转到了疾病信息汇总界面。对于疾病的信息,这个数据库总结了以下 几个方面。

疾病相关总结(Summaries)

MalaCards汇总了包括 NIH、OMIM、KEGG 等多个数据库对于疾病相关的总结,通过这个部分,我们就可以了解大概的疾病背景了。

疾病相关的药物(Drugs & Therapeutic)

既然是一个疾病,那就会涉及到和这个疾病相关的药物,MalaCards总结了DrugBank, HMDB, Dgidb, PharmGKB, IUPHAR, NovoSeek 和 BitterDB 这7个药物相关数据库,在结果当中我们可以看到和检索疾病有关的药物是哪些。

另外,这个是已经有研究的有关的药物,可能还有一些药物在做临床实验,关于临床实验相关的信息也在里面会有显示。

疾病相关的基因特征

对于基础研究而言,我们还是要做基因相关的研究的,所以需要知道和疾病相关的经典基因有哪些。关于疾病相关的基因特征,主要能确定是和基相关的基因,这个结果在Genes结果当中;另外还有和疾病相关的基因变异,这个结果在Variations当中。

Genes

在和疾病相关的基因当中,数据库按照证据等级汇总了和疾病相关的经典基因。这些基因当中,按照他们自己的算法,如果是标🌟的就代表是明星基因,属于很经典的基因,如果是标CC的话,则代表在COSMIC数据库当中属于经典基因。

Variations

在基因变异方面,MalaCards 总结和和疾病相关的多个变异特征,其中包括基因多态、突变和拷贝数变异。

影响疾病的主要生物学功能

有了和疾病相关的基因了,其实在通过富集什么的就可以获得影响疾病相关的功能都是什么了。在这个MalaCards当中汇总了和疾病相关的通路以及GO结果都有哪些。

数据库总结

以上就是关于MalaCards的主要结果了。其他的还有比如相关的疾病、发表的文章。这个如果有需要的也可以看一眼。基本上通过这样一检索,一看,就相当于了解了一个疾病主要的信息。所以如果你的老师让你写一个和疾病相关的综述。那。。。是不是把参考参考这个数据库的结果了

(0)

相关推荐

  • 处方不懂怎么用?中药靶点和疾病相关基因网络图不会做?TCMID来帮您

    中医药综合数据库(TCMID)是一个有关中药各个方面的数据库,包括配方,草药和草药成分,药物和疾病的信息.目前的TCMID包含约4.7万个处方,8159种草药,25210种化合物,6828种药物,37 ...

  • RMVar:m6A修饰相关甲基化数据库

    m6A是mRNA上最丰富的甲基化修饰,是RNA中腺嘌呤(A)上第6位N原子上的甲基,主要存在于mRNA的CDS区和3'UTR区,影响mRNA的稳定性,翻译效率,可变剪接和定位等.此外,长非编码RNA以 ...

  • 人类疾病数据库MalaCards

    MalaCards数据库是人类疾病及其注释的综合汇编.当前版本包括来自74个来源的21369种疾病的信息. 对于每一种疾病,数据库都会显示一张带有关于该疾病的各种注释信息的"疾病卡" ...

  • 想分析的都被别人做过了?那你可以考虑写一篇这样的综述!

    AML through the prism of molecular genetics 从分子遗传学角度看急性髓系白血病 一.研究背景 AML是一种恶性克隆性血液系统疾病,主要表现为感染.出血.贫血以 ...

  • 网站标题怎么写才能更规范符合百度呢?

    百度这次为了保障搜索用户对获取资源的有效性以及体验良好,推出了<网页标题规范>,不按照此规范来,被搜索引擎查到,会直接进行排名限制的影响. 2018年11月15日,百度推出了名为<百 ...

  • ​一直想写一篇关于新冠疫苗的文章

    但总觉得时机没那么好,现在我认为新冠疫苗市场会在下半年迎来变局,因此和大家分享下我的一些看法. 关于新冠疫苗市场整体:新冠疫苗是终结新冠的唯一可能,这应该已经成为市场共识.但对于新冠疫苗接种频率,市场 ...

  • 儿子要写一篇关于梦想的作文,他问我,“爸...

    儿子要写一篇关于梦想的作文,他问我,"爸爸你的梦想是什么?"我不假思索的就说出了,我的梦想就是能够拥有分身术.回答速度快的我自己都惊讶,因为之前我从来都没有想过这个问题.为什么想拥 ...

  • [微课展播] 写作指导:如何写一篇影评

    宝坻 一中 微课展播         写作指导:如何写一篇影评 尹雅冬 宝坻一中英语教师,从教两年以来凭借扎实的专业素养.勤恳严谨的工作态度和沉心思考的教育热情,所带教班级成绩保持优异,多次在青年教师 ...

  • 刘西川 | 如何动手写一篇实证文章?(1)——观点最重要!

    摘要:年轻朋友在论文写作过程中,常常把握不好写文章的重点.难点.顺序以及相关规范等问题.在这篇推文中,笔者与年轻朋友一起分享如何动手写实证文章的个人经验.第一个经验是,时刻要想着自己的观点,即文章的重 ...

  • 刘西川 | 如何动手写一篇实证论文文章?(2)——搭架子

    搭架子的目的就是论证观点,在实证论文中就是提出并检验命题.在一篇文章中,观点是论证出来.就实证论文而言,论证观点的思路和过程是:提出问题和命题,然后实证检验,进而讨论最后得出结论.搭架子首先要搞清楚一 ...

  • 刘西川 | 如何动手写一篇实证文章?(3)——行动顺序

    观点和搭架子都要落实在行动上.写文章有千头万绪,究竟从哪里开始才算合理和高效的,又该如何一步一步有条不紊地进行呢?行动顺序,可以分为准备和写作两个阶段. 根据我的认识,这两个阶段在行动顺序上有四个要求 ...

  • 他屡遭排挤,怒写一篇古文,仅9句,抚慰世人近1200年

    山不在高,有仙则名. 水不在深,有龙则灵. 斯是陋室,惟吾德馨. 苔痕上阶绿,草色入帘青. 谈笑有鸿儒,往来无白丁. 可以调素琴,阅金经. 无丝竹之乱耳,无案牍之劳形. 南阳诸葛庐,西蜀子云亭. 孔子 ...