人类微生物组测序数据的聚类：基于距离的无监督学习模型 / 开普饭

编译:草重木雪,编辑:Tracy.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读肠道菌群及其代谢物对人体健康和疾病起着至关重要的作用,如今高通量测序.质谱和其他组学分析平台的发展提高了我们获得大量数据以及 ...

编译:国民少女,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读由于数据的复杂性,微生物组数据的差异丰度(DA)分析仍然是一个具有挑战性的问题.在本文中,我们定义了"采样分数&quo ...

9.3 用ANOSIM假设检验组间的不同 9.3.1相似性分析介绍(ANOSIM) ANOSIM仅仅是基于两个距离矩阵之间标准化秩相关的Mantel测试的修正版本. ANOSIM检验是由Clarke ...

编译:小菌菌,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读人体栖息着多种多样的微生物,整个微生物系统是一个动态的,辅助的功能系统,与宿主的生理发育同步地协同发展.人类微生物组学领域已经从对 ...

编译:逍遥君,编辑:小菌菌.江舜尧. 原创微文,欢迎转发转载. 导读肠道微生物组的胆汁酸代谢对宿主健康同时发挥有益和有害的作用.启动胆汁酸代谢的微生物胆盐水解酶(BSHs)对宿主生理表现出积极和消极 ...

本文由晚香编译,玛莉.江舜尧编辑. 原创微文,欢迎转发转载. 导读在过去的十年里,在二代测序平台.组学技术和先进的生物信息学方法的推动下,肠道微生物组和癌症的研究数量激增.人类基因组是遗传的,基本上 ...

本文由杨家军编译,玛莉.江舜尧编辑. 原创微文,欢迎转发转载. 导读人类微生物组研究发现:机体与器官中固有的多样化菌群存在密切的依赖关系,且器官菌群对维持人体健康十分必要.为了明确不同人体以及在器官 ...

意大利特伦托大学Nicola Segata等人于2019年1月17日在<Cell>上发表题目为<Extensive Unexplored Human Microbiome Diver ...

本文由李红霞编译,董小橙.江舜尧编辑. 原创微文,欢迎转发转载. 导读微生物定植于人体,如粘膜和皮肤中,微生物在人体的数量巨大,相当于人体细胞数量,这些微生物中包含大量的基因,远大于人体基因.不同人 ...

微生物组测序分析包括菌群结构谱.宏基因组和宏转录组,但是目前宏转录组研究较少.所以,本文介绍菌群结构谱.宏基因组测序分析的主要步骤和预算,以助大家申请相关科研基金.本文介绍三种模式:(1)单独的菌群结 ...

看过往期文章的小伙伴都知道,人体微生物群维持体内的共生关系,促进新陈代谢功能,抵御病原体,训练和发展免疫系统,直接或间接影响我们的大部分生理功能. 每个人都拥有属于自己的独特的微生物组,人与人之间这种 ...

Nucleic Acids Research [IF:11.501] HMPDACC: a Human Microbiome Project Multi-omic data resource HMPD ...

人类微生物组测序数据的聚类：基于距离的无监督学习模型