所有人！瞬间掌握-无限个列表的-‘韦恩图’（Venn）绘制！

写在前面

《-零命令行-生信下游数据分析》的第四帖主题，定为韦恩图绘制
总的来说，凡是相对不简单的分析，无论是否涉及到组学数据，韦恩图（Venn）都是常见的操作之一。
目前关于韦恩图绘制，有不少推文，但可能没有一个推文提出一个绝对简单的，适合所有人的解法

一图胜千言

为了避免推文没人看，想想还是先祭出TBtools的UpsetPlot的图。Upset Plot应该算是要革了多集合韦恩图的命的一个图形展示方式。首先我们摆一张TBtools六组的韦恩图

恩，看着有点懵逼，不过Venn Plot无需解释，再摆一张TBtools的Upset Plot

稍微解说下图片。图形主要是三个区块：

  1. 图形左边的 水平柱形图，每一个柱子对应了一个输入列表，柱子长度对应的是 输入的那个列表的ID个数

  2. 图形下边（的右侧），标识的是当前竖直柱形图柱子对应的是哪些列表的交集，如第一个（最长的）那个柱子，其中只有一个黑色圈圈，所以上边竖直柱形图对应的柱子 571 即标识 Set3 具有唯一的 571 个ID；类似的，图中已经被我调整为蓝色的“圈圈-连线-圈圈”，标识的是，Set1 和 Set3 和 Set4 和 Set5 独有的交集；而图中已经被我调整为绿色的“圈圈-连线-圈圈”，标识的是，Set1,2,3,4,5 独有的交集。总的来说，对比Venn Plot应该就什么都知道啦

  3. 图形上边的柱形图..... 相信无需解释了

好的，下面进入正文。

韦恩图绘制的相关解法与局限

解法：

  1. 网页工具，如Venny

  2. 界面化工具，如......

  3. R语言包

局限：

  1. 网页工具，数据的复制黏贴是个问题。这个主要可能受到网速的限制

  2. 界面化工具是不错的解法，然而目前看来操作并不够简单，各种麻烦，而且基本就真的只能画Venn

  3. R语言包；总的来说，相对优秀的R语言使用者都会贡献出一些不错的R包，似乎R语言除了不能帮你生孩子之外，没有什么做不到的了....。But，首先，编程！。其次，数据整理麻烦！一旦超过5组的Venn，就要Upset了。而一旦要用UpsetR，又有一堆人要懵逼。原因是UpsetR需要输入所谓的0-1矩阵。

没人愿意整，那就让我来

大背景是，TBtools早就支持二到六组的Venn，而且还有一些独特的优点：

  1. 本地化，你需要做的就是拖文件进去，或者复制ID列表进去，然后点击Start

  2. 可以随意使用取色器，任意修改颜色，甚至是修改形状，线条粗细等

  3. 可交互，所有数字标签，双击可以获得列表；所有元件，包括标签位置可以随便拖动

  4. 可以导出300dpi图片或者矢量图如PDF svg

  5. 批量输出交集和差集列表

操作方式简单

1.    黏贴ID列表或拖文件（有多少个列表就拖多少个列表）

2.    点击Start

摆一些例图

但是，以上远远不够

任何韦恩图绘制，只要超过4组，其实都比较丑。所以只有UpsetPlot才是解法。
你需要做的事情很简单，几乎可以在几秒钟之内完成：

  1. 打开TBtools

  2. 移动鼠标，点击六次"Add"（因为一共是有6个列表要看差集和交集），你有多少个列表就点击多少下

  3. 分别把每个列表拖进去或者黏贴进去

  4. 点击“Never be Upset!”即可。

图形是可以交互的，双击 竖直柱形图的对应柱子，即可获得对应的ID列表。出图使用的TBtools最近的JIGplot绘图引擎，所以...拥有先天出图和交互优势。

写在最后

....讲真的，写到这里我不是太想写。GUI工具，写一个介绍，真的有点虐。
不如录一个小视频来的简单。OK，感兴趣的朋友
欢迎加入TBtools使用交流群 讨论TBtools的使用，
软件，我放在群共享了，去拿吧

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