病毒就是靠它表面的S蛋白与人体细胞表面的血管紧张素转换酶2（ACE2）受体结合，才能吸附到细胞上并侵入细胞。而人体对S蛋白发生免疫反应产生的抗体，可以与S蛋白结合，使病毒失去吸附人体细胞的能力，就能阻止感染。虽然机制很明确，但如果没有拿到实锤的S蛋白免疫保护率证据，谁也不敢打包票。在这种情况下，我国年初制定了5条技术路线研制新冠疫苗：其中1条是传统灭活疫苗路线，包括了病毒的所有类型蛋白成分；另外4条基于S蛋白进行设计（重组蛋白疫苗、流感病毒载体疫苗、腺病毒载体疫苗、核酸疫苗）。安全性高，技术成熟，仅激发体液免疫，生产受场地限制。灭活疫苗主要有效成分为灭活的病毒颗粒，包含所有的病毒结构组分，接近或等于天然病毒颗粒，是最易于研制的疫苗种类。灭活疫苗是一种传统疫苗技术，有120年以上的使用历史（第一个是伤寒灭活疫苗，1896年开始使用），其安全性和有效性得到了充分的验证。目前，儿童常用的灭活疫苗有脊灰灭活疫苗、甲肝灭活疫苗、手足口疫苗，全人群常用的疫苗有狂犬病疫苗（孕妇都可以接种）。一是，不能模拟病毒的感染过程，对免疫系统的刺激比较弱，通常只产生以抗体为主的体液免疫；二是，需要先培养活病原体，再灭活做成疫苗，对生产车间的生物安全等级要求高，产量也受到一定的限制。就新冠病毒来说，它含有4种结构蛋白（S、E、M、N蛋白）以及更多其他蛋白。如果确认S蛋白才是形成免疫关键成分，而灭活疫苗还含有其他组分蛋白，就相当于同等疫苗剂量下，灭活疫苗的S蛋白比例低于其他类型疫苗，有效成分降低，可能不利于产生足够强度的免疫反应。这样一来，在病毒培养和疫苗制备过程中，可能易残留宿主蛋白或其他杂质成分，除了可能影响免疫效果外，同时增加了不良反应的可能性。重组蛋白疫苗的技术相对成熟，目前已经有了很多产品走向市场。这种疫苗的本质是将有效的抗原成分经过基因工程改造，在其他细胞内完成蛋白表达，然后分离目标蛋白、添加保护剂等，最终封装为市面上出售的疫苗。
乙肝疫苗是重组蛋白疫苗的鼻祖，已经有30年的应用历史，此外还有戊肝疫苗、宫颈癌疫苗和带状疱疹疫苗。重组蛋白疫苗目标非常精确，就是病原体的关键蛋白成分，所以它的效果和安全性很可能优于灭活疫苗。其生产过程也不会产生活病原体，对生物安全的要求低，培养细胞来生产病原体蛋白的效率很高，所以产能也高于灭活疫苗。当然，重组疫苗也有缺点——由于表达宿主的限制，复制出的蛋白与天然蛋白常常不同，可能影响免疫原性。后期需要进行纯化分离与封装，也面临杂质的影响问题。产能最高，但不良反应明显更多，安全性有待观察。这两种技术都是把编码病毒S蛋白的基因转到人体细胞中，让人体细胞自己来生产S蛋白。前者通过无害病毒（比如腺病毒）作为载体，把S蛋白基因转入人体；后者是直接把S蛋白基因转入人体细胞。
（非复制型病毒载体疫苗，也是腺病毒载体疫苗的主要研究类型）
