TCGA年度(共4年)研讨会资料分享
最近搜索很多资料,都跳转到TCGA年度(共4年)研讨会PPT了,觉得有必要再次分享,第一次分享在:http://www.bio-info-trainee.com/958.html
TCGA年度(共4年)研讨会PPT官网是: http://www.genome.gov/17516564
蛮有趣的,下面的PDF链接,可以使用 wget批量下载,或者R里面也可以,欢迎大家写出极简代码在这里分享。
假设下面的 url
被保存在 url.txt
文件里面。
wget -i url.txt
当然,如何获取这么多url,你可能是需要自行摸索一下。
Meetings
The Cancer Genome Atlas Fourth Annual Scientific Symposium
May 11-12, 2015The Cancer Genome Atlas Third Annual Scientific Symposium
May 12-13, 2014The Cancer Genome Atlas Second Annual Scientific Symposium
November 27-28, 2012The Cancer Genome Atlas First Annual Scientific Symposium
November 17-18, 2011
假设url文件如下:
http://www.genome.gov/Multimedia/Slides/TCGA1/TCGA1_.pdf
http://www.genome.gov/Multimedia/Slides/TCGA4/24_Gross.pdf
其实有YouTube视频
虽然大部分人无法观看,但是我相信,真正感兴趣的还是能找到办法。
TCGA教程长期更新列表
TCGA的28篇教程-使用R语言的cgdsr包获取TCGA数据(cBioPortal)
TCGA的28篇教程-使用R语言的RTCGA包获取TCGA数据 (离线打包版本)
TCGA的28篇教程-使用R语言的RTCGAToolbox包获取TCGA数据 (FireBrowse portal)
TCGA的28篇教程-批量下载TCGA所有数据 ( UCSC的 XENA)