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经过朋友圈投票,我们选择了幕布这个软件的经典样式作为我们表观调控13张图视频课程目录,如下:

目录列表是:

  • 01 果蝇参考基因组和注释文件准备

  • 02 文献测序原始数据下载

  • 03 ChIP-seq 数据质量控制与过滤

  • 04 ChIP-seq 数据从比对到 Peaks calling

  • 05 RNA-seq 数据从比对到定量

  • 06 用幕布展示此课程目录

  • 07 验证目标基因的指定外显子 knock out 是否有效

  • 08 多个样本基因信号矩阵来相关性计算与可视化

  • 09 对RNA-seq数据找差异基因以及可视化

  • 10 根据差异倍数来计算样本间相关性

  • 11 使用 ChIPseeker 对单组 Peak 进行注释与可视化

  • 12 对多组 Peaks 进行批量注释与可视化

  • 13 通过 bw 文件来计算 ChIP-seq 样本间相关性

  • 14 探索ChIPQC 包用法并且查看 ChIP-seq 数据质量

  • 15 最新版参考基因组注释peaks之果蝇 dm6

  • 16 样本间 Peaks 交集韦恩图

  • 17 基因组版本注释转换

  • 18 使用 R 和 linux 对多个 bed 进行骚操作处理

  • 19 对单个 bed 文件和 bw 文件可视化

  • 20 多个 bw 文件进行可视化

  • 21 获得差异表达基因 bed 文件

  • 22 对多个基因集进行富集分析

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