R绘图：无与伦比的华丽风行（桑基图）
首先看到这个名字，有没有勾起你的某些回忆呢？
R绘图我们已经出过几期
今天我们来了解一下桑基图
桑基图（Sankey diagram），即桑基能量分流图，也叫桑基能量平衡图。它是一种特定类型的流程图，图中延伸的分支的宽度对应数据流量的大小，通常应用于能源、材料成分、金融等数据的可视化分析。
如下图
那么桑基图在我们科研中有什么用处呢？目前我见过的最常见的两个用处，一个是展示某分组，与肿瘤分期，患者生存状态，另一种就是展示ceRNA网络中的lncRNA-miRNA-mRNA的关系，今天我们来简单实现一下，大家只要套用数据就可以画出自己的桑基图了。
安装加载包
install.packages("ggalluvial")library(ggalluvial)载入数据
我们用的是自带的数据，来表示泰坦尼克号上乘客多维分类数据
titanic_wide <- data.frame(Titanic)head(titanic_wide)画图
ggplot(data = titanic_wide, aes(axis1 = Class, axis2 = Sex, axis3 = Age, y = Freq)) + scale_x_discrete(limits = c("Class", "Sex", "Age"), expand = c(.1, .05)) + xlab("Demographic") + geom_alluvium(aes(fill = Survived)) + geom_stratum() + geom_text(stat = "stratum", label.strata = TRUE) + theme_minimal() + ggtitle("passengers on the maiden voyage of the Titanic", "stratified by demographics and survival")出图就是这么简单，快赶紧用自己的数据试一下吧
下面是福利专用贴，目前公众号所有的福利都在里面
目前有
1. 火山图，热图示例文件及完整代码
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万水千山总是情，点个在看行不行，哈哈哈哈哈哈哈。
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