肿瘤研究靠不近热点？一文教你如何干湿结合申请国自然，发表10 文章的策略

肿瘤免疫是近年来国家自然科学基金申请中的热点问题，基于肿瘤免疫发表文章也是近几年肿瘤领域中最受欢迎的点之一，可以看到，仅2020年，基于肿瘤免疫申请的国家自然科学基金就达500项。由此可见，基于肿瘤免疫发表文章或者申请课题都是很有优势的。

今天，我们就通过一篇2021年5月发表在Nature Communications上的文章帮大家理清如何利用“干湿结合”的方法在肿瘤免疫领域中发表高水平文章，申请课题的套路。

一、研究背景

在胃癌 (GC) 中，CD8 T的比例与其预后以及治疗结果密切相关，但研究发现，肿瘤中 CD8 T 与GC预后之间的关联并不一致，具有较大的异质性。研究表明，在多种肿瘤中都有CXCR5 CD8 T的子集，且与肿瘤预后密切相关，然而在胃癌中，CXCR5 CD8 T比例与患者预后之间的关系却未见报道；因此，这篇文章从数据库验证及样本验证双维度验证CXCR5 CD8 T比例与胃癌患者预后之间的关系。

二、研究思维

2.1 表达验证

研究方法及结果：

a：验证CXCR5 CD8 T在胃癌组织中的表达；

b：验证CXCR5 CD8 T在不同类型胃癌组织（分期分级不同）中的表达（更进一步的表达验证）；

图1.CXCR5 CD8 T在胃癌组织中的表达

套路1：双维度联合验证表达-样本结合数据库进行目标细胞比例/靶点的表达验证；

2.2 生存验证

研究方法及结果：

b：临床大样本比较CXCR5 CD8 T高低表达或单纯CD8 T高低表达预测胃癌患者的生存预后的准确性；

c：比较CXCR5 CD8 T高低表达或单纯CD8 T高低表达预测胃癌患者的生存预后的准确性；

图2.CXCR5 CD8 T可更有效的预测胃癌患者的预后

套路2：双维度联合验证生存并比较-临床大样本结合生信数据库验证细胞比例/靶点与患者生存预后之间的相关性，并完成不同指标之间的比较；

2.3 治疗相关性

研究方法及结果：

a: 临床大样本验证CXCR5 CD8 T高低表达与胃癌患者的生存预后的相关性，并与单纯CD8 T高低表达预测胃癌生存预后进行比较；

b：TCGA数据库验证CXCR5 CD8 T高低表达与胃癌患者的生存预后的相关性，并与单纯CD8 T高低表达预测胃癌生存预后进行比较；

图3.CXCR5 CD8 T可有效的预测胃癌患者辅助放化疗的治疗反应

套路3：进一步验证并比较接受治疗患者的生存预后-临床大样本结合生信数据库验证细胞比例/靶点与接受辅助放化疗患者生存预后之间的相关性，并完成不同指标之间的比较；

2.4 机制验证1-现象级机制

研究方法及结果：

a：TCGA数据库验证CXCR5 CD8 T在不同肿瘤微环境特征和分子亚型（MSI, EBV, GS, CIN）中的表达情况，明确CXCR5 CD8 T与TCGA不同分子亚型之间的关联；

b：ACRG数据库验证CXCR5 CD8 T在不同肿瘤微环境特征和分子亚型（MSI, MSS/EMT, MSS/TP53 , MSS/TP53^-）中的表达情况，明确CXCR5 CD8 T与ACRG不同分子亚型之间的关联；

图4.CXCR5 CD8 T胃癌患者分子亚型相关

套路4：浅谈现象级机制（病理分型相关性）-验证细胞比例/靶点在不同病理分型样本中的表达情况

2.5 机制验证2-明确到分子的机制

研究方法及结果：

a：临床样本验证CXCR5 CD8 T与免疫检查点之间的相关性（第一层）；

b：临床样本验证CXCR5 CD8 T与细胞因子之间的相关性（第二层）；

c：临床样本验证CXCR5 CD8 T与效应分子之间的相关性（第三层）；

图5.CXCR5 CD8 T与免疫检查点-细胞因子-效应分子之间的相关性

套路5：进一步机制验证（免疫检查点-细胞因子-效应分子）-逐级递进的机制，验证细胞比例/靶点与免疫检查点-细胞因子-效应分子的相关性

四、全文总结

从全文来看，作者的逻辑思路还是很清晰的，总结一下肿瘤免疫研究的整体思路：表达验证-生存验证-治疗反应的预测-病理分子亚型的预测-免疫检查点、细胞因子及效应分子的验证；如果要申请国家自然科学基金的话，我建议从以下图中思路去完成。

最后，我们可以发现，逐步递进的逻辑思路以及多层次验证数据对于我们申请课题及发表高水平文章都是至关重要的。

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