CLASSY家族控制拟南芥中组织特异性的DNA甲基化模式

DNA甲基化改变了基因组的表观遗传格局,在调节基因表达中起着关键作用,并确保转座子沉默。正如与异常DNA甲基化景观相关的许多缺陷所证明的,建立适当的组织特异性甲基化模式是至关重要的。然而,这种差异是如何产生的,在动植物中仍然是一个很大程度上悬而未决的问题。

在这里,我们证明了在植物发育过程中差异表达的DNA甲基化的四个位点特异性调控因子1-4(CLSY1-4)在控制组织特异性DNA甲基化模式中起主要作用。

根据组织的不同,特定CLSYs的遗传要求有显著差异,在全基因组范围内,某些clsy突变体足以在很大程度上改变组织间的表观遗传格局。

综上所述,这些发现不仅揭示了组织间的表观遗传多样性,而且将这些变化赋予了特定的CLSY蛋白,揭示了位点特异性靶向与组织特异性表达相结合如何使CLSYs在植物发育过程中产生表观遗传多样性。

DNA methylation shapes the epigenetic landscape of the genome, plays critical roles in regulating gene expression, and ensures transposon silencing. As evidenced by the numerous defects associated with aberrant DNA methylation landscapes, establishing proper tissue-specific methylation patterns is critical. Yet, how such differences arise remains a largely open question in both plants and animals. Here we demonstrate that CLASSY1-4 (CLSY1-4), four locus-specific regulators of DNA methylation that are differentially expressed during plant development, play major roles in controlling tissue-specific DNA methylation patterns. Depending on the tissue, the genetic requirements for specific CLSYs differ significantly and, on a global scale, certain clsy mutants are sufficient to largely shift the epigenetic landscape between tissues. Together, these findings not only reveal substantial epigenetic diversity between tissues, but assign these changes to specific CLSY proteins, revealing how locus-specific targeting combined with tissue-specific expression enables the CLSYs to generate epigenetic diversity during plant development.

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